RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 ANAPC13Q9BS18 74 aa6.17□□□□□ -1.42
PRAME-212ENST00000485532 H3BPC8 53 aa6.16□□□□□ -1.42
PRAME-212ENST00000485532 COX7CP15954 63 aa6.16□□□□□ -1.42
PRAME-212ENST00000485532 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.16□□□□□ -1.42
PRAME-212ENST00000485532 C20orf197Q8N268 126 aa6.12□□□□□ -1.43
PRAME-212ENST00000485532 SNURFQ9Y675 71 aa6.11□□□□□ -1.43
PRAME-212ENST00000485532 KLKP1Q107X0 134 aa6.1□□□□□ -1.43
PRAME-212ENST00000485532 CCDC179H3BU77 68 aa6.07□□□□□ -1.44
PRAME-212ENST00000485532 C4orf26Q17RF5 130 aa6.05□□□□□ -1.44
PRAME-212ENST00000485532 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.04□□□□□ -1.44
PRAME-212ENST00000485532 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.04□□□□□ -1.44
PRAME-212ENST00000485532 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.01□□□□□ -1.45
PRAME-212ENST00000485532 H7BZZ5 65 aa5.98□□□□□ -1.45
PRAME-212ENST00000485532 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
PRAME-212ENST00000485532 NDUFC1O43677 76 aa5.97□□□□□ -1.45
PRAME-212ENST00000485532 PCP4P48539 62 aa5.95□□□□□ -1.46
PRAME-212ENST00000485532 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa5.94□□□□□ -1.46
PRAME-212ENST00000485532 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PRAME-212ENST00000485532 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa5.93□□□□□ -1.46
PRAME-212ENST00000485532 DMAC1Q96GE9 116 aa5.93□□□□□ -1.46
PRAME-212ENST00000485532 A8MUN3 132 aa5.91□□□□□ -1.46
PRAME-212ENST00000485532 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.85□□□□□ -1.47
PRAME-212ENST00000485532 ACYP2P14621 99 aa5.83□□□□□ -1.48
PRAME-212ENST00000485532 TMEM258P61165 79 aa5.83□□□□□ -1.48
PRAME-212ENST00000485532 S4R3F8 94 aa5.83□□□□□ -1.48
PRAME-212ENST00000485532 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
PRAME-212ENST00000485532 LCA10Q71F78 164 aa5.81□□□□□ -1.48
PRAME-212ENST00000485532 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa5.79□□□□□ -1.48
PRAME-212ENST00000485532 COA5Q86WW8 74 aa5.77□□□□□ -1.49
PRAME-212ENST00000485532 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa5.73□□□□□ -1.49
PRAME-212ENST00000485532 MT1BP07438 61 aa5.73□□□□□ -1.49
PRAME-212ENST00000485532 CSAG1Q6PB30 78 aa5.72□□□□□ -1.49
PRAME-212ENST00000485532 A6NN06 94 aa5.7□□□□□ -1.5
PRAME-212ENST00000485532 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.66□□□□□ -1.5
PRAME-212ENST00000485532 Q5VV11 94 aa5.66□□□□□ -1.5
PRAME-212ENST00000485532 SPTSSBQ8NFR3 76 aa5.66□□□□□ -1.5
PRAME-212ENST00000485532 SPRR2GQ9BYE4 73 aa5.65□□□□□ -1.5
PRAME-212ENST00000485532 SERP1Q9Y6X1 66 aa5.65□□□□□ -1.5
PRAME-212ENST00000485532 KRTAP10-5P60370 271 aa5.61□□□□□ -1.51
PRAME-212ENST00000485532 H0YAA0 97 aa5.58□□□□□ -1.52
PRAME-212ENST00000485532 NEBP20929 6669 aa5.57□□□□□ -1.52
PRAME-212ENST00000485532 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.56□□□□□ -1.52
PRAME-212ENST00000485532 ADM2Q7Z4H4 148 aa5.55□□□□□ -1.52
PRAME-212ENST00000485532 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa5.55□□□□□ -1.52
PRAME-212ENST00000485532 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PRAME-212ENST00000485532 P0C880 135 aa5.51□□□□□ -1.53
PRAME-212ENST00000485532 KRTAP5-9P26371 169 aa5.51□□□□□ -1.53
PRAME-212ENST00000485532 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.51□□□□□ -1.53
PRAME-212ENST00000485532 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.47□□□□□ -1.53
PRAME-212ENST00000485532 SMIM26A0A096LP01 95 aa5.46□□□□□ -1.54
PRAME-212ENST00000485532 SEC61GP60059 68 aa5.44□□□□□ -1.54
PRAME-212ENST00000485532 KMT2DO14686 5537 aa5.44□□□□□ -1.54
PRAME-212ENST00000485532 A0A1B0GU69 56 aa5.43□□□□□ -1.54
PRAME-212ENST00000485532 CRIPTQ9P021 101 aa5.42□□□□□ -1.54
PRAME-212ENST00000485532 Q1T7F1 81 aa5.41□□□□□ -1.54
PRAME-212ENST00000485532 MDN1Q9NU22 5596 aa5.39□□□□□ -1.55
PRAME-212ENST00000485532 V9GYY9 64 aa5.39□□□□□ -1.55
PRAME-212ENST00000485532 PRR15LQ9BU68 103 aa5.38□□□□□ -1.55
PRAME-212ENST00000485532 A0A1B0GU33 70 aa5.35□□□□□ -1.55
PRAME-212ENST00000485532 M0QZ58 72 aa5.35□□□□□ -1.55
PRAME-212ENST00000485532 R4GN34 69 aa5.35□□□□□ -1.55
PRAME-212ENST00000485532 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa5.34□□□□□ -1.55
PRAME-212ENST00000485532 PSPHP1O15172 72 aa5.33□□□□□ -1.56
PRAME-212ENST00000485532 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.33□□□□□ -1.56
PRAME-212ENST00000485532 MT1XP80297 61 aa5.32□□□□□ -1.56
PRAME-212ENST00000485532 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.31□□□□□ -1.56
PRAME-212ENST00000485532 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.31□□□□□ -1.56
PRAME-212ENST00000485532 SPRR2EP22531 72 aa5.3□□□□□ -1.56
PRAME-212ENST00000485532 SPRR2BP35325 72 aa5.3□□□□□ -1.56
PRAME-212ENST00000485532 SPRR2AP35326 72 aa5.3□□□□□ -1.56
PRAME-212ENST00000485532 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.28□□□□□ -1.56
PRAME-212ENST00000485532 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.26□□□□□ -1.57
PRAME-212ENST00000485532 LINC01554Q52M75 96 aa5.25□□□□□ -1.57
PRAME-212ENST00000485532 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.24□□□□□ -1.57
PRAME-212ENST00000485532 PLAC4Q8WY50 150 aa5.23□□□□□ -1.57
PRAME-212ENST00000485532 UQCR11O14957 56 aa5.22□□□□□ -1.57
PRAME-212ENST00000485532 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.21□□□□□ -1.58
PRAME-212ENST00000485532 A0A0D9SG42 100 aa5.2□□□□□ -1.58
PRAME-212ENST00000485532 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.19□□□□□ -1.58
PRAME-212ENST00000485532 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.19□□□□□ -1.58
PRAME-212ENST00000485532 A8MU10 97 aa5.18□□□□□ -1.58
PRAME-212ENST00000485532 KRTAP12-2P59991 146 aa5.17□□□□□ -1.58
PRAME-212ENST00000485532 A6NED7 52 aa5.16□□□□□ -1.58
PRAME-212ENST00000485532 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.16□□□□□ -1.58
PRAME-212ENST00000485532 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.13□□□□□ -1.59
PRAME-212ENST00000485532 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.13□□□□□ -1.59
PRAME-212ENST00000485532 SPRR2DP22532 72 aa5.12□□□□□ -1.59
PRAME-212ENST00000485532 KRTAP12-1P59990 96 aa5.11□□□□□ -1.59
PRAME-212ENST00000485532 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
PRAME-212ENST00000485532 SPINT4Q6UDR6 99 aa5.07□□□□□ -1.6
PRAME-212ENST00000485532 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.05□□□□□ -1.6
PRAME-212ENST00000485532 KRTAP10-12P60413 245 aa5.03□□□□□ -1.6
PRAME-212ENST00000485532 LCE3BQ5TA77 95 aa4.99□□□□□ -1.61
PRAME-212ENST00000485532 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa4.98□□□□□ -1.61
PRAME-212ENST00000485532 BRK1Q8WUW1 75 aa4.94□□□□□ -1.62
PRAME-212ENST00000485532 K7ERS5 55 aa4.93□□□□□ -1.62
PRAME-212ENST00000485532 C10orf95Q9H7T3 257 aa4.86□□□□□ -1.63
PRAME-212ENST00000485532 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa4.76□□□□□ -1.65
PRAME-212ENST00000485532 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.74□□□□□ -1.65
PRAME-212ENST00000485532 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.7 ms