RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 DNAH6Q9C0G6 4158 aa1.3□□□□□ -2.2
RABGGTB-209ENST00000473406 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa1.29□□□□□ -2.2
RABGGTB-209ENST00000473406 DNAH3Q8TD57 4116 aa1.29□□□□□ -2.2
RABGGTB-209ENST00000473406 TRAV21A0A0B4J279 112 aa1.28□□□□□ -2.2
RABGGTB-209ENST00000473406 DEFB109BQ30KR1 87 aa1.28□□□□□ -2.2
RABGGTB-209ENST00000473406 WFDC9Q8NEX5 89 aa1.28□□□□□ -2.2
RABGGTB-209ENST00000473406 FAT1Q14517 4588 aa1.28□□□□□ -2.2
RABGGTB-209ENST00000473406 LELP1Q5T871 98 aa1.27□□□□□ -2.21
RABGGTB-209ENST00000473406 ENHOQ6UWT2 76 aa1.27□□□□□ -2.21
RABGGTB-209ENST00000473406 Q8IZM0 81 aa1.27□□□□□ -2.21
RABGGTB-209ENST00000473406 GAFA1Q96PS6 74 aa1.27□□□□□ -2.21
RABGGTB-209ENST00000473406 IGIPA6NJ69 53 aa1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-209ENST00000473406 ALMS1Q8TCU4 4167 aa1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-209ENST00000473406 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-209ENST00000473406 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-209ENST00000473406 I3L3M4 83 aa1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-209ENST00000473406 DEFB112Q30KQ8 113 aa1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-209ENST00000473406 KCNQ1DNQ9H478 68 aa1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-209ENST00000473406 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-209ENST00000473406 M0R1W7 72 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-209ENST00000473406 NDUFA4O00483 81 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-209ENST00000473406 SPINK6Q6UWN8 80 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-209ENST00000473406 DNAH11Q96DT5 4516 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-209ENST00000473406 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-209ENST00000473406 APOBP04114 4563 aaKnown RBP1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-209ENST00000473406 KMT2DO14686 5537 aa1.23□□□□□ -2.21
RABGGTB-209ENST00000473406 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa1.23□□□□□ -2.21
RABGGTB-209ENST00000473406 SMIM2Q9BVW6 85 aa1.23□□□□□ -2.21
RABGGTB-209ENST00000473406 PKD1P98161 4303 aa1.23□□□□□ -2.21
RABGGTB-209ENST00000473406 FAT3Q8TDW7 4589 aa1.23□□□□□ -2.21
RABGGTB-209ENST00000473406 LRP1BQ9NZR2 4599 aa1.23□□□□□ -2.21
RABGGTB-209ENST00000473406 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
RABGGTB-209ENST00000473406 COX7BP24311 80 aa1.22□□□□□ -2.21
RABGGTB-209ENST00000473406 DNAH5Q8TE73 4624 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-209ENST00000473406 SPINK4O60575 86 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-209ENST00000473406 NDUFA3O95167 84 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-209ENST00000473406 CD52P31358 61 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-209ENST00000473406 VPS13DQ5THJ4 4388 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-209ENST00000473406 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-209ENST00000473406 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa1.19□□□□□ -2.22
RABGGTB-209ENST00000473406 COX6B2Q6YFQ2 88 aa1.19□□□□□ -2.22
RABGGTB-209ENST00000473406 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa1.19□□□□□ -2.22
RABGGTB-209ENST00000473406 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa1.19□□□□□ -2.22
RABGGTB-209ENST00000473406 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa1.19□□□□□ -2.22
RABGGTB-209ENST00000473406 DNAH2Q9P225 4427 aa1.19□□□□□ -2.22
RABGGTB-209ENST00000473406 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-209ENST00000473406 NDUFA1O15239 70 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-209ENST00000473406 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-209ENST00000473406 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-209ENST00000473406 USMG5Q96IX5 58 aa1.17□□□□□ -2.22
RABGGTB-209ENST00000473406 DNAH17Q9UFH2 4485 aa1.16□□□□□ -2.22
RABGGTB-209ENST00000473406 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.16□□□□□ -2.22
RABGGTB-209ENST00000473406 LYNX1G3V0Z9 82 aa1.16□□□□□ -2.22
RABGGTB-209ENST00000473406 CCL22O00626 93 aa1.16□□□□□ -2.22
RABGGTB-209ENST00000473406 LINC00308Q8TCZ7 52 aa1.16□□□□□ -2.22
RABGGTB-209ENST00000473406 MUC12Q9UKN1 5478 aa1.16□□□□□ -2.22
RABGGTB-209ENST00000473406 K7EQZ3 153 aa1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-209ENST00000473406 LINC00158P58513 81 aa1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-209ENST00000473406 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-209ENST00000473406 CRIPTQ9P021 101 aa1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-209ENST00000473406 STATHP02808 62 aa1.14□□□□□ -2.23
RABGGTB-209ENST00000473406 TFF3Q07654 80 aa1.14□□□□□ -2.23
RABGGTB-209ENST00000473406 TNXBP22105 4242 aa1.13□□□□□ -2.23
RABGGTB-209ENST00000473406 IAPPP10997 89 aa1.13□□□□□ -2.23
RABGGTB-209ENST00000473406 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa1.13□□□□□ -2.23
RABGGTB-209ENST00000473406 LINC01590Q5TEZ4 76 aa1.12□□□□□ -2.23
RABGGTB-209ENST00000473406 U3KQA8 63 aa1.12□□□□□ -2.23
RABGGTB-209ENST00000473406 USH2AO75445 5202 aa1.12□□□□□ -2.23
RABGGTB-209ENST00000473406 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP1.11□□□□□ -2.23
RABGGTB-209ENST00000473406 CRIP1P50238 77 aa1.1□□□□□ -2.23
RABGGTB-209ENST00000473406 DEFB131AP59861 70 aa1.1□□□□□ -2.23
RABGGTB-209ENST00000473406 MINOS1Q5TGZ0 78 aa1.1□□□□□ -2.23
RABGGTB-209ENST00000473406 Q5VSD8 79 aa1.1□□□□□ -2.23
RABGGTB-209ENST00000473406 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP1.1□□□□□ -2.23
RABGGTB-209ENST00000473406 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa1.09□□□□□ -2.23
RABGGTB-209ENST00000473406 H3BUA1 57 aa1.09□□□□□ -2.23
RABGGTB-209ENST00000473406 C6orf48Q9UBA6 75 aa1.09□□□□□ -2.23
RABGGTB-209ENST00000473406 PRCDQ00LT1 54 aa1.08□□□□□ -2.24
RABGGTB-209ENST00000473406 DEFB133Q30KQ1 61 aa1.06□□□□□ -2.24
RABGGTB-209ENST00000473406 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP1.06□□□□□ -2.24
RABGGTB-209ENST00000473406 LPAP08519 4548 aa1.06□□□□□ -2.24
RABGGTB-209ENST00000473406 MDN1Q9NU22 5596 aa1.05□□□□□ -2.24
RABGGTB-209ENST00000473406 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa1.05□□□□□ -2.24
RABGGTB-209ENST00000473406 SPINK1P00995 79 aa1.04□□□□□ -2.24
RABGGTB-209ENST00000473406 SPRR1BP22528 89 aa1.04□□□□□ -2.24
RABGGTB-209ENST00000473406 TTTY10Q9BZA0 68 aa1.04□□□□□ -2.24
RABGGTB-209ENST00000473406 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP1.03□□□□□ -2.24
RABGGTB-209ENST00000473406 RPL39P62891 51 aaKnown RBP1.03□□□□□ -2.24
RABGGTB-209ENST00000473406 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa1.03□□□□□ -2.24
RABGGTB-209ENST00000473406 M0QY20 66 aa1.02□□□□□ -2.25
RABGGTB-209ENST00000473406 SPRR1AP35321 89 aa1.02□□□□□ -2.25
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa1.02□□□□□ -2.25
RABGGTB-209ENST00000473406 K7EIM0 57 aa1.01□□□□□ -2.25
RABGGTB-209ENST00000473406 WFDC10BQ8IUB3 73 aa1.01□□□□□ -2.25
RABGGTB-209ENST00000473406 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP1.01□□□□□ -2.25
RABGGTB-209ENST00000473406 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP1.01□□□□□ -2.25
RABGGTB-209ENST00000473406 DNAH8Q96JB1 4490 aa1.01□□□□□ -2.25
RABGGTB-209ENST00000473406 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP1□□□□□ -2.25
RABGGTB-209ENST00000473406 WT1-ASQ06250 92 aa1□□□□□ -2.25
RABGGTB-209ENST00000473406 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa1□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms