RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439365.6

NPAS1-201, Transcript of neuronal PAS domain protein 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NPAS1, Length 1,341 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1-201ENST00000439365 ATOX1O00244 68 aa8.81□□□□□ -1
NPAS1-201ENST00000439365 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa8.81□□□□□ -1
NPAS1-201ENST00000439365 A6NN06 94 aa8.8□□□□□ -1
NPAS1-201ENST00000439365 SPRR2GQ9BYE4 73 aa8.78□□□□□ -1
NPAS1-201ENST00000439365 OCR1Q9BZK8 76 aa8.78□□□□□ -1
NPAS1-201ENST00000439365 MT1BP07438 61 aa8.77□□□□□ -1.01
NPAS1-201ENST00000439365 KLKP1Q107X0 134 aa8.77□□□□□ -1.01
NPAS1-201ENST00000439365 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa8.75□□□□□ -1.01
NPAS1-201ENST00000439365 LINC00208Q96KT6 92 aa8.74□□□□□ -1.01
NPAS1-201ENST00000439365 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa8.73□□□□□ -1.01
NPAS1-201ENST00000439365 MP68P56378 58 aa8.69□□□□□ -1.02
NPAS1-201ENST00000439365 SCGB1A1P11684 91 aa8.64□□□□□ -1.03
NPAS1-201ENST00000439365 CRIPTQ9P021 101 aa8.63□□□□□ -1.03
NPAS1-201ENST00000439365 NDUFC1O43677 76 aa8.62□□□□□ -1.03
NPAS1-201ENST00000439365 IMUPQ9GZP8 106 aa8.62□□□□□ -1.03
NPAS1-201ENST00000439365 KRTAP10-5P60370 271 aa8.61□□□□□ -1.03
NPAS1-201ENST00000439365 MT-ATP8P03928 68 aa8.59□□□□□ -1.03
NPAS1-201ENST00000439365 A8MUN3 132 aa8.58□□□□□ -1.04
NPAS1-201ENST00000439365 H3BPC8 53 aa8.56□□□□□ -1.04
NPAS1-201ENST00000439365 MUC12Q9UKN1 5478 aa8.51□□□□□ -1.05
NPAS1-201ENST00000439365 H0YAA0 97 aa8.5□□□□□ -1.05
NPAS1-201ENST00000439365 NEBP20929 6669 aa8.5□□□□□ -1.05
NPAS1-201ENST00000439365 ADM2Q7Z4H4 148 aa8.49□□□□□ -1.05
NPAS1-201ENST00000439365 TRAV7A0A075B6U4 112 aa8.43□□□□□ -1.06
NPAS1-201ENST00000439365 DMAC1Q96GE9 116 aa8.42□□□□□ -1.06
NPAS1-201ENST00000439365 SMIM20Q8N5G0 67 aa8.4□□□□□ -1.06
NPAS1-201ENST00000439365 KRTAP5-9P26371 169 aa8.33□□□□□ -1.08
NPAS1-201ENST00000439365 PLAC4Q8WY50 150 aa8.3□□□□□ -1.08
NPAS1-201ENST00000439365 PRO2289Q9P1D8 64 aa8.3□□□□□ -1.08
NPAS1-201ENST00000439365 R4GN34 69 aa8.29□□□□□ -1.08
NPAS1-201ENST00000439365 KMT2DO14686 5537 aa8.29□□□□□ -1.08
NPAS1-201ENST00000439365 MDN1Q9NU22 5596 aa8.27□□□□□ -1.09
NPAS1-201ENST00000439365 SNURFQ9Y675 71 aa8.27□□□□□ -1.09
NPAS1-201ENST00000439365 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa8.26□□□□□ -1.09
NPAS1-201ENST00000439365 C20orf197Q8N268 126 aa8.26□□□□□ -1.09
NPAS1-201ENST00000439365 P0C880 135 aa8.24□□□□□ -1.09
NPAS1-201ENST00000439365 ACYP2P14621 99 aa8.24□□□□□ -1.09
NPAS1-201ENST00000439365 M0QZ58 72 aa8.22□□□□□ -1.09
NPAS1-201ENST00000439365 MT1XP80297 61 aa8.21□□□□□ -1.1
NPAS1-201ENST00000439365 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa8.2□□□□□ -1.1
NPAS1-201ENST00000439365 SERP2Q8N6R1 65 aa8.19□□□□□ -1.1
NPAS1-201ENST00000439365 LINC01554Q52M75 96 aa8.15□□□□□ -1.1
NPAS1-201ENST00000439365 SPRR2FQ96RM1 72 aa8.15□□□□□ -1.1
NPAS1-201ENST00000439365 ANAPC13Q9BS18 74 aa8.13□□□□□ -1.11
NPAS1-201ENST00000439365 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa8.09□□□□□ -1.11
NPAS1-201ENST00000439365 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa8.09□□□□□ -1.11
NPAS1-201ENST00000439365 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa8.08□□□□□ -1.12
NPAS1-201ENST00000439365 SPTSSBQ8NFR3 76 aa8.08□□□□□ -1.12
NPAS1-201ENST00000439365 SPRR2EP22531 72 aa8.05□□□□□ -1.12
NPAS1-201ENST00000439365 SPRR2BP35325 72 aa8.05□□□□□ -1.12
NPAS1-201ENST00000439365 SPRR2AP35326 72 aa8.05□□□□□ -1.12
NPAS1-201ENST00000439365 COX7CP15954 63 aa8.03□□□□□ -1.12
NPAS1-201ENST00000439365 PCP4P48539 62 aa8.02□□□□□ -1.13
NPAS1-201ENST00000439365 KRTAP12-2P59991 146 aa8.01□□□□□ -1.13
NPAS1-201ENST00000439365 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa7.99□□□□□ -1.13
NPAS1-201ENST00000439365 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa7.99□□□□□ -1.13
NPAS1-201ENST00000439365 CCDC179H3BU77 68 aa7.92□□□□□ -1.14
NPAS1-201ENST00000439365 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa7.91□□□□□ -1.14
NPAS1-201ENST00000439365 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa7.91□□□□□ -1.14
NPAS1-201ENST00000439365 COA5Q86WW8 74 aa7.88□□□□□ -1.15
NPAS1-201ENST00000439365 CYSTM1Q9H1C7 97 aa7.88□□□□□ -1.15
NPAS1-201ENST00000439365 LCE1AQ5T7P2 110 aa7.87□□□□□ -1.15
NPAS1-201ENST00000439365 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
NPAS1-201ENST00000439365 H7BZZ5 65 aa7.83□□□□□ -1.16
NPAS1-201ENST00000439365 SPRR2DP22532 72 aa7.79□□□□□ -1.16
NPAS1-201ENST00000439365 KRTAP10-12P60413 245 aa7.78□□□□□ -1.16
NPAS1-201ENST00000439365 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa7.76□□□□□ -1.17
NPAS1-201ENST00000439365 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa7.74□□□□□ -1.17
NPAS1-201ENST00000439365 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa7.74□□□□□ -1.17
NPAS1-201ENST00000439365 TMEM258P61165 79 aa7.69□□□□□ -1.18
NPAS1-201ENST00000439365 SEC61GP60059 68 aa7.65□□□□□ -1.18
NPAS1-201ENST00000439365 SERP1Q9Y6X1 66 aa7.65□□□□□ -1.18
NPAS1-201ENST00000439365 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
NPAS1-201ENST00000439365 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa7.63□□□□□ -1.19
NPAS1-201ENST00000439365 LCE3BQ5TA77 95 aa7.57□□□□□ -1.2
NPAS1-201ENST00000439365 A0A1B0GU33 70 aa7.54□□□□□ -1.2
NPAS1-201ENST00000439365 SPATA8Q6RVD6 105 aa7.54□□□□□ -1.2
NPAS1-201ENST00000439365 A0A0D9SG42 100 aa7.52□□□□□ -1.2
NPAS1-201ENST00000439365 A0A1B0GU69 56 aa7.46□□□□□ -1.22
NPAS1-201ENST00000439365 SPINT4Q6UDR6 99 aa7.4□□□□□ -1.22
NPAS1-201ENST00000439365 KRTAP12-1P59990 96 aa7.37□□□□□ -1.23
NPAS1-201ENST00000439365 RPS28P62857 69 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
NPAS1-201ENST00000439365 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa7.32□□□□□ -1.24
NPAS1-201ENST00000439365 SMIM26A0A096LP01 95 aa7.3□□□□□ -1.24
NPAS1-201ENST00000439365 A8MU10 97 aa7.3□□□□□ -1.24
NPAS1-201ENST00000439365 MT1EP04732 61 aa7.28□□□□□ -1.24
NPAS1-201ENST00000439365 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
NPAS1-201ENST00000439365 LCE5AQ5TCM9 118 aa7.27□□□□□ -1.25
NPAS1-201ENST00000439365 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa7.26□□□□□ -1.25
NPAS1-201ENST00000439365 PRR15LQ9BU68 103 aa7.26□□□□□ -1.25
NPAS1-201ENST00000439365 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa7.26□□□□□ -1.25
NPAS1-201ENST00000439365 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa7.16□□□□□ -1.26
NPAS1-201ENST00000439365 V9GYY9 64 aa7.13□□□□□ -1.27
NPAS1-201ENST00000439365 Q1T7F1 81 aa7.09□□□□□ -1.27
NPAS1-201ENST00000439365 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa7.09□□□□□ -1.27
NPAS1-201ENST00000439365 MT1GP13640 62 aa7.07□□□□□ -1.28
NPAS1-201ENST00000439365 PP632Q6XCG6 107 aa7.05□□□□□ -1.28
NPAS1-201ENST00000439365 C10orf95Q9H7T3 257 aa7.05□□□□□ -1.28
NPAS1-201ENST00000439365 UQCR11O14957 56 aa7.03□□□□□ -1.28
NPAS1-201ENST00000439365 TNP1P09430 55 aa6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 103.8 ms