RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 C4orf26Q17RF5 130 aa6.21□□□□□ -1.42
PRAME-208ENST00000438888 CCDC179H3BU77 68 aa6.2□□□□□ -1.42
PRAME-208ENST00000438888 MT2AP02795 61 aa6.19□□□□□ -1.42
PRAME-208ENST00000438888 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PRAME-208ENST00000438888 NDUFC1O43677 76 aa6.15□□□□□ -1.42
PRAME-208ENST00000438888 MT1FP04733 61 aa6.15□□□□□ -1.42
PRAME-208ENST00000438888 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.15□□□□□ -1.42
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.14□□□□□ -1.43
PRAME-208ENST00000438888 LCE2BO14633 110 aa6.13□□□□□ -1.43
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP10-10P60014 251 aa6.13□□□□□ -1.43
PRAME-208ENST00000438888 H7BZZ5 65 aa6.11□□□□□ -1.43
PRAME-208ENST00000438888 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.11□□□□□ -1.43
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.11□□□□□ -1.43
PRAME-208ENST00000438888 A8MUN3 132 aa6.1□□□□□ -1.43
PRAME-208ENST00000438888 PCP4P48539 62 aa6.1□□□□□ -1.43
PRAME-208ENST00000438888 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.1□□□□□ -1.43
PRAME-208ENST00000438888 DMAC1Q96GE9 116 aa6.08□□□□□ -1.44
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.08□□□□□ -1.44
PRAME-208ENST00000438888 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PRAME-208ENST00000438888 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PRAME-208ENST00000438888 ACYP2P14621 99 aa6.02□□□□□ -1.45
PRAME-208ENST00000438888 S4R3F8 94 aa6.01□□□□□ -1.45
PRAME-208ENST00000438888 TMEM258P61165 79 aa6□□□□□ -1.45
PRAME-208ENST00000438888 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PRAME-208ENST00000438888 LCA10Q71F78 164 aa5.97□□□□□ -1.45
PRAME-208ENST00000438888 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa5.92□□□□□ -1.46
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.92□□□□□ -1.46
PRAME-208ENST00000438888 COA5Q86WW8 74 aa5.91□□□□□ -1.46
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa5.91□□□□□ -1.46
PRAME-208ENST00000438888 CSAG1Q6PB30 78 aa5.9□□□□□ -1.46
PRAME-208ENST00000438888 SPTSSBQ8NFR3 76 aa5.87□□□□□ -1.47
PRAME-208ENST00000438888 SERP1Q9Y6X1 66 aa5.8□□□□□ -1.48
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.78□□□□□ -1.48
PRAME-208ENST00000438888 H0YAA0 97 aa5.74□□□□□ -1.49
PRAME-208ENST00000438888 ADM2Q7Z4H4 148 aa5.7□□□□□ -1.5
PRAME-208ENST00000438888 NEBP20929 6669 aa5.69□□□□□ -1.5
PRAME-208ENST00000438888 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa5.65□□□□□ -1.5
PRAME-208ENST00000438888 SEC61GP60059 68 aa5.64□□□□□ -1.51
PRAME-208ENST00000438888 P0C880 135 aa5.63□□□□□ -1.51
PRAME-208ENST00000438888 SMIM26A0A096LP01 95 aa5.62□□□□□ -1.51
PRAME-208ENST00000438888 A6NN06 94 aa5.62□□□□□ -1.51
PRAME-208ENST00000438888 A0A1B0GU69 56 aa5.61□□□□□ -1.51
PRAME-208ENST00000438888 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.61□□□□□ -1.51
PRAME-208ENST00000438888 PRR15LQ9BU68 103 aa5.58□□□□□ -1.52
PRAME-208ENST00000438888 CRIPTQ9P021 101 aa5.58□□□□□ -1.52
PRAME-208ENST00000438888 V9GYY9 64 aa5.58□□□□□ -1.52
PRAME-208ENST00000438888 MT1BP07438 61 aa5.57□□□□□ -1.52
PRAME-208ENST00000438888 Q1T7F1 81 aa5.56□□□□□ -1.52
PRAME-208ENST00000438888 Q5VV11 94 aa5.56□□□□□ -1.52
PRAME-208ENST00000438888 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.55□□□□□ -1.52
PRAME-208ENST00000438888 R4GN34 69 aa5.52□□□□□ -1.53
PRAME-208ENST00000438888 M0QZ58 72 aa5.51□□□□□ -1.53
PRAME-208ENST00000438888 A0A1B0GU33 70 aa5.5□□□□□ -1.53
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.5□□□□□ -1.53
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.5□□□□□ -1.53
PRAME-208ENST00000438888 SPRR2GQ9BYE4 73 aa5.5□□□□□ -1.53
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP10-5P60370 271 aa5.48□□□□□ -1.53
PRAME-208ENST00000438888 PSPHP1O15172 72 aa5.47□□□□□ -1.53
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa5.44□□□□□ -1.54
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP5-9P26371 169 aa5.41□□□□□ -1.54
PRAME-208ENST00000438888 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.41□□□□□ -1.54
PRAME-208ENST00000438888 KMT2DO14686 5537 aa5.41□□□□□ -1.54
PRAME-208ENST00000438888 MDN1Q9NU22 5596 aa5.4□□□□□ -1.54
PRAME-208ENST00000438888 LINC01554Q52M75 96 aa5.4□□□□□ -1.54
PRAME-208ENST00000438888 UQCR11O14957 56 aa5.39□□□□□ -1.55
PRAME-208ENST00000438888 A0A0D9SG42 100 aa5.33□□□□□ -1.56
PRAME-208ENST00000438888 A6NED7 52 aa5.32□□□□□ -1.56
PRAME-208ENST00000438888 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.31□□□□□ -1.56
PRAME-208ENST00000438888 A8MU10 97 aa5.3□□□□□ -1.56
PRAME-208ENST00000438888 PLAC4Q8WY50 150 aa5.28□□□□□ -1.56
PRAME-208ENST00000438888 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.27□□□□□ -1.57
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.26□□□□□ -1.57
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.26□□□□□ -1.57
PRAME-208ENST00000438888 SPRR2EP22531 72 aa5.24□□□□□ -1.57
PRAME-208ENST00000438888 SPRR2BP35325 72 aa5.24□□□□□ -1.57
PRAME-208ENST00000438888 SPRR2AP35326 72 aa5.24□□□□□ -1.57
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP12-1P59990 96 aa5.23□□□□□ -1.57
PRAME-208ENST00000438888 SPINT4Q6UDR6 99 aa5.23□□□□□ -1.57
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP12-2P59991 146 aa5.2□□□□□ -1.58
PRAME-208ENST00000438888 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.19□□□□□ -1.58
PRAME-208ENST00000438888 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.18□□□□□ -1.58
PRAME-208ENST00000438888 MT1XP80297 61 aa5.17□□□□□ -1.58
PRAME-208ENST00000438888 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa5.16□□□□□ -1.58
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.16□□□□□ -1.58
PRAME-208ENST00000438888 K7ERS5 55 aa5.13□□□□□ -1.59
PRAME-208ENST00000438888 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.1□□□□□ -1.59
PRAME-208ENST00000438888 BRK1Q8WUW1 75 aa5.09□□□□□ -1.59
PRAME-208ENST00000438888 SPRR2DP22532 72 aa5.07□□□□□ -1.6
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.07□□□□□ -1.6
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.07□□□□□ -1.6
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.05□□□□□ -1.6
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.05□□□□□ -1.6
PRAME-208ENST00000438888 C10orf95Q9H7T3 257 aa4.96□□□□□ -1.62
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PRAME-208ENST00000438888 LCE3BQ5TA77 95 aa4.94□□□□□ -1.62
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP10-12P60413 245 aa4.88□□□□□ -1.63
PRAME-208ENST00000438888 TNP1P09430 55 aa4.87□□□□□ -1.63
PRAME-208ENST00000438888 ROMO1P60602 79 aa4.87□□□□□ -1.63
PRAME-208ENST00000438888 PRO0628Q9UI54 55 aa4.86□□□□□ -1.63
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