RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426965.1

HOXD-AS2-201, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 927 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SCGB1A1P11684 91 aa11.35□□□□□ -0.59
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MT-ATP8P03928 68 aa11.33□□□□□ -0.6
HOXD-AS2-201ENST00000426965 A8MUN3 132 aa11.32□□□□□ -0.6
HOXD-AS2-201ENST00000426965 K7ERU9 68 aa11.32□□□□□ -0.6
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IMUPQ9GZP8 106 aa11.31□□□□□ -0.6
HOXD-AS2-201ENST00000426965 H3BPC8 53 aa11.3□□□□□ -0.6
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 SPRR2GQ9BYE4 73 aa11.26□□□□□ -0.61
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa11.16□□□□□ -0.62
HOXD-AS2-201ENST00000426965 H0YAA0 97 aa11.14□□□□□ -0.63
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DMAC1Q96GE9 116 aa11.12□□□□□ -0.63
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa11.11□□□□□ -0.63
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TRAV7A0A075B6U4 112 aa11.09□□□□□ -0.63
HOXD-AS2-201ENST00000426965 Q5VV11 94 aa11.09□□□□□ -0.63
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CRIPTQ9P021 101 aa11.09□□□□□ -0.63
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SMIM20Q8N5G0 67 aa11.07□□□□□ -0.64
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ADM2Q7Z4H4 148 aa11.04□□□□□ -0.64
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 ACYP2P14621 99 aa10.84□□□□□ -0.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRTAP10-5P60370 271 aa10.84□□□□□ -0.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa10.82□□□□□ -0.68
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SERP2Q8N6R1 65 aa10.79□□□□□ -0.68
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C20orf197Q8N268 126 aa10.76□□□□□ -0.69
HOXD-AS2-201ENST00000426965 R4GN34 69 aa10.7□□□□□ -0.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa10.67□□□□□ -0.7
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa10.66□□□□□ -0.7
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 MT1XP80297 61 aa10.52□□□□□ -0.73
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 LINC01554Q52M75 96 aa10.48□□□□□ -0.73
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PRO2289Q9P1D8 64 aa10.43□□□□□ -0.74
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CYSTM1Q9H1C7 97 aa10.41□□□□□ -0.74
HOXD-AS2-201ENST00000426965 COA5Q86WW8 74 aa10.38□□□□□ -0.75
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MUC12Q9UKN1 5478 aa10.36□□□□□ -0.75
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 KMT2DO14686 5537 aa10.32□□□□□ -0.76
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRTAP5-9P26371 169 aa10.27□□□□□ -0.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa10.25□□□□□ -0.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ANAPC13Q9BS18 74 aa10.22□□□□□ -0.77
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRTAP12-2P59991 146 aa10.18□□□□□ -0.78
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MDN1Q9NU22 5596 aa10.13□□□□□ -0.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CCDC179H3BU77 68 aa10.08□□□□□ -0.8
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SEC61GP60059 68 aa10.05□□□□□ -0.8
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa10.02□□□□□ -0.81
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa10.02□□□□□ -0.81
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 SPATA8Q6RVD6 105 aa9.93□□□□□ -0.82
HOXD-AS2-201ENST00000426965 A0A1B0GU33 70 aa9.92□□□□□ -0.82
HOXD-AS2-201ENST00000426965 A0A0D9SG42 100 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa9.86□□□□□ -0.83
HOXD-AS2-201ENST00000426965 A0A1B0GU69 56 aa9.81□□□□□ -0.84
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SPRR2EP22531 72 aa9.79□□□□□ -0.84
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SPRR2BP35325 72 aa9.79□□□□□ -0.84
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SPRR2AP35326 72 aa9.79□□□□□ -0.84
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa9.75□□□□□ -0.85
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRTAP12-1P59990 96 aa9.73□□□□□ -0.85
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LCE1AQ5T7P2 110 aa9.73□□□□□ -0.85
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SPINT4Q6UDR6 99 aa9.72□□□□□ -0.85
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMEM258P61165 79 aa9.64□□□□□ -0.87
HOXD-AS2-201ENST00000426965 A8MU10 97 aa9.62□□□□□ -0.87
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SMIM26A0A096LP01 95 aa9.61□□□□□ -0.87
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa9.57□□□□□ -0.88
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa9.56□□□□□ -0.88
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 C10orf95Q9H7T3 257 aa9.3□□□□□ -0.92
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa9.27□□□□□ -0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa9.27□□□□□ -0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 UQCR11O14957 56 aa9.26□□□□□ -0.93
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa9.21□□□□□ -0.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LCE3BQ5TA77 95 aa9.2□□□□□ -0.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LCE5AQ5TCM9 118 aa9.17□□□□□ -0.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa9.16□□□□□ -0.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TNP1P09430 55 aa9.15□□□□□ -0.94
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LCE3AQ5TA76 89 aa9.1□□□□□ -0.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MIR22HGQ0VDD5 57 aa9.09□□□□□ -0.95
HOXD-AS2-201ENST00000426965 Q1T7F1 81 aa9.06□□□□□ -0.96
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PSPHP1O15172 72 aa9.05□□□□□ -0.96
HOXD-AS2-201ENST00000426965 V9GYY9 64 aa9.05□□□□□ -0.96
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MT1GP13640 62 aa8.95□□□□□ -0.98
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MT1LQ93083 61 aa8.92□□□□□ -0.98
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
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