RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395211.6

TMOD1-203, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,259 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-203ENST00000395211 KRTAP10-2P60368 255 aa4.86□□□□□ -1.63
TMOD1-203ENST00000395211 VPS13DQ5THJ4 4388 aa4.86□□□□□ -1.63
TMOD1-203ENST00000395211 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
TMOD1-203ENST00000395211 DNAH2Q9P225 4427 aa4.81□□□□□ -1.64
TMOD1-203ENST00000395211 STARD9Q9P2P6 4700 aa4.8□□□□□ -1.64
TMOD1-203ENST00000395211 KRTAP10-8P60410 259 aa4.8□□□□□ -1.64
TMOD1-203ENST00000395211 DNAH11Q96DT5 4516 aa4.78□□□□□ -1.64
TMOD1-203ENST00000395211 KRTAP10-1P60331 282 aa4.78□□□□□ -1.64
TMOD1-203ENST00000395211 SACSQ9NZJ4 4579 aa4.76□□□□□ -1.65
TMOD1-203ENST00000395211 LRP1BQ9NZR2 4599 aa4.76□□□□□ -1.65
TMOD1-203ENST00000395211 RYR2Q92736 4967 aa4.75□□□□□ -1.65
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TMOD1-203ENST00000395211 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa4.68□□□□□ -1.66
TMOD1-203ENST00000395211 RYR3Q15413 4870 aa4.66□□□□□ -1.66
TMOD1-203ENST00000395211 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.65□□□□□ -1.67
TMOD1-203ENST00000395211 M0QZ58 72 aa4.65□□□□□ -1.67
TMOD1-203ENST00000395211 RPS29P62273 56 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
TMOD1-203ENST00000395211 HYDINQ4G0P3 5121 aa4.63□□□□□ -1.67
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TMOD1-203ENST00000395211 FAT2Q9NYQ8 4349 aa4.61□□□□□ -1.67
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TMOD1-203ENST00000395211 A0A1B0GVY2 172 aa4.57□□□□□ -1.68
TMOD1-203ENST00000395211 PKD1P98161 4303 aa4.57□□□□□ -1.68
TMOD1-203ENST00000395211 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa4.55□□□□□ -1.68
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TMOD1-203ENST00000395211 LORP23490 312 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
TMOD1-203ENST00000395211 APOBP04114 4563 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
TMOD1-203ENST00000395211 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
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TMOD1-203ENST00000395211 PP632Q6XCG6 107 aa4.45□□□□□ -1.7
TMOD1-203ENST00000395211 HERC2O95714 4834 aa4.43□□□□□ -1.7
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TMOD1-203ENST00000395211 HSPG2P98160 4391 aa4.41□□□□□ -1.7
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TMOD1-203ENST00000395211 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa4.38□□□□□ -1.71
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TMOD1-203ENST00000395211 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa4.29□□□□□ -1.72
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TMOD1-203ENST00000395211 TNP1P09430 55 aa4.26□□□□□ -1.73
TMOD1-203ENST00000395211 FAT3Q8TDW7 4589 aa4.25□□□□□ -1.73
TMOD1-203ENST00000395211 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4.24□□□□□ -1.73
TMOD1-203ENST00000395211 INE1O15225 51 aa4.22□□□□□ -1.73
TMOD1-203ENST00000395211 ABCA13Q86UQ4 5058 aa4.21□□□□□ -1.74
TMOD1-203ENST00000395211 Q5VSD8 79 aa4.2□□□□□ -1.74
TMOD1-203ENST00000395211 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa4.2□□□□□ -1.74
TMOD1-203ENST00000395211 PCLOQ9Y6V0 5065 aa4.19□□□□□ -1.74
TMOD1-203ENST00000395211 LRP2P98164 4655 aa4.16□□□□□ -1.74
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TMOD1-203ENST00000395211 MUC2Q02817 5179 aa3.74□□□□□ -1.81
TMOD1-203ENST00000395211 KRTAP10-10P60014 251 aa3.72□□□□□ -1.81
TMOD1-203ENST00000395211 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa3.71□□□□□ -1.82
TMOD1-203ENST00000395211 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
TMOD1-203ENST00000395211 UBR4Q5T4S7 5183 aa3.7□□□□□ -1.82
TMOD1-203ENST00000395211 KRTAP10-12P60413 245 aa3.69□□□□□ -1.82
TMOD1-203ENST00000395211 RNF213Q63HN8 5207 aa3.69□□□□□ -1.82
TMOD1-203ENST00000395211 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa3.68□□□□□ -1.82
TMOD1-203ENST00000395211 M0R2T5 61 aa3.62□□□□□ -1.83
TMOD1-203ENST00000395211 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa3.6□□□□□ -1.83
TMOD1-203ENST00000395211 SPRR2GQ9BYE4 73 aa3.57□□□□□ -1.84
TMOD1-203ENST00000395211 FAT4Q6V0I7 4981 aa3.51□□□□□ -1.85
TMOD1-203ENST00000395211 KRTAP10-5P60370 271 aa3.5□□□□□ -1.85
TMOD1-203ENST00000395211 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.49□□□□□ -1.85
TMOD1-203ENST00000395211 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
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TMOD1-203ENST00000395211 MT1XP80297 61 aa3.44□□□□□ -1.86
TMOD1-203ENST00000395211 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa3.43□□□□□ -1.86
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TMOD1-203ENST00000395211 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.38□□□□□ -1.87
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TMOD1-203ENST00000395211 KMT2DO14686 5537 aa3.33□□□□□ -1.88
TMOD1-203ENST00000395211 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa3.31□□□□□ -1.88
TMOD1-203ENST00000395211 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.31□□□□□ -1.88
TMOD1-203ENST00000395211 KRTAP12-4P60329 112 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD1-203ENST00000395211 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa3.3□□□□□ -1.88
TMOD1-203ENST00000395211 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD1-203ENST00000395211 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa3.29□□□□□ -1.88
TMOD1-203ENST00000395211 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa3.27□□□□□ -1.89
TMOD1-203ENST00000395211 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa3.23□□□□□ -1.89
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