RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364043.1

SNORD46-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 46, humanhuman

BASIC

Gene SNORD46, Length 104 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD46-201ENST00000364043 Q1T7F1 81 aa4.25□□□□□ -1.73
SNORD46-201ENST00000364043 PCOTHQ58A44 107 aa4.25□□□□□ -1.73
SNORD46-201ENST00000364043 SVIPQ8NHG7 77 aa4.24□□□□□ -1.73
SNORD46-201ENST00000364043 V9GYY9 64 aa4.24□□□□□ -1.73
SNORD46-201ENST00000364043 IGKV2-30P06310 120 aa4.23□□□□□ -1.73
SNORD46-201ENST00000364043 COA5Q86WW8 74 aa4.22□□□□□ -1.73
SNORD46-201ENST00000364043 MPLKIPQ8TAP9 179 aa4.2□□□□□ -1.74
SNORD46-201ENST00000364043 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
SNORD46-201ENST00000364043 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.19□□□□□ -1.74
SNORD46-201ENST00000364043 DMAC1Q96GE9 116 aa4.18□□□□□ -1.74
SNORD46-201ENST00000364043 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa4.18□□□□□ -1.74
SNORD46-201ENST00000364043 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.18□□□□□ -1.74
SNORD46-201ENST00000364043 A8MUU9 505 aa4.17□□□□□ -1.74
SNORD46-201ENST00000364043 HRES1P13985 223 aa4.17□□□□□ -1.74
SNORD46-201ENST00000364043 ACYP2P14621 99 aa4.17□□□□□ -1.74
SNORD46-201ENST00000364043 C7orf65Q6ZTY9 151 aa4.15□□□□□ -1.75
SNORD46-201ENST00000364043 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa4.13□□□□□ -1.75
SNORD46-201ENST00000364043 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa4.12□□□□□ -1.75
SNORD46-201ENST00000364043 XP32Q5T750 250 aa4.12□□□□□ -1.75
SNORD46-201ENST00000364043 PRO0628Q9UI54 55 aa4.12□□□□□ -1.75
SNORD46-201ENST00000364043 A8MUN3 132 aa4.11□□□□□ -1.75
SNORD46-201ENST00000364043 LCE2BO14633 110 aa4.11□□□□□ -1.75
SNORD46-201ENST00000364043 Q5VV11 94 aa4.11□□□□□ -1.75
SNORD46-201ENST00000364043 Q75L30 129 aa4.11□□□□□ -1.75
SNORD46-201ENST00000364043 PSPHP1O15172 72 aa4.1□□□□□ -1.75
SNORD46-201ENST00000364043 COX6B2Q6YFQ2 88 aa4.1□□□□□ -1.75
SNORD46-201ENST00000364043 C9orf92A6NGG3 77 aa4.09□□□□□ -1.75
SNORD46-201ENST00000364043 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa4.08□□□□□ -1.76
SNORD46-201ENST00000364043 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa4.08□□□□□ -1.76
SNORD46-201ENST00000364043 BRK1Q8WUW1 75 aa4.08□□□□□ -1.76
SNORD46-201ENST00000364043 PRR15LQ9BU68 103 aa4.08□□□□□ -1.76
SNORD46-201ENST00000364043 KMT2DO14686 5537 aa4.08□□□□□ -1.76
SNORD46-201ENST00000364043 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa4.07□□□□□ -1.76
SNORD46-201ENST00000364043 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.02□□□□□ -1.77
SNORD46-201ENST00000364043 SPINK7P58062 85 aa4.02□□□□□ -1.77
SNORD46-201ENST00000364043 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4.02□□□□□ -1.77
SNORD46-201ENST00000364043 RPL37P61927 97 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
SNORD46-201ENST00000364043 SPTSSBQ8NFR3 76 aa4□□□□□ -1.77
SNORD46-201ENST00000364043 MDN1Q9NU22 5596 aa4□□□□□ -1.77
SNORD46-201ENST00000364043 A6NED7 52 aa3.99□□□□□ -1.77
SNORD46-201ENST00000364043 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa3.99□□□□□ -1.77
SNORD46-201ENST00000364043 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa3.99□□□□□ -1.77
SNORD46-201ENST00000364043 A0A1B0GU69 56 aa3.98□□□□□ -1.77
SNORD46-201ENST00000364043 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa3.97□□□□□ -1.77
SNORD46-201ENST00000364043 LCA10Q71F78 164 aa3.96□□□□□ -1.78
SNORD46-201ENST00000364043 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa3.96□□□□□ -1.78
SNORD46-201ENST00000364043 MT2AP02795 61 aa3.94□□□□□ -1.78
SNORD46-201ENST00000364043 A8MU10 97 aa3.92□□□□□ -1.78
SNORD46-201ENST00000364043 UQCR11O14957 56 aa3.91□□□□□ -1.78
SNORD46-201ENST00000364043 MT1FP04733 61 aa3.91□□□□□ -1.78
SNORD46-201ENST00000364043 SEC61GP60059 68 aa3.91□□□□□ -1.78
SNORD46-201ENST00000364043 SPATA8Q6RVD6 105 aa3.91□□□□□ -1.78
SNORD46-201ENST00000364043 KRTAP10-10P60014 251 aa3.88□□□□□ -1.79
SNORD46-201ENST00000364043 MIR22HGQ0VDD5 57 aa3.87□□□□□ -1.79
SNORD46-201ENST00000364043 PMAIP1Q13794 54 aa3.87□□□□□ -1.79
SNORD46-201ENST00000364043 KRTAP5-9P26371 169 aa3.86□□□□□ -1.79
SNORD46-201ENST00000364043 A6NN06 94 aa3.85□□□□□ -1.79
SNORD46-201ENST00000364043 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.85□□□□□ -1.79
SNORD46-201ENST00000364043 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.85□□□□□ -1.79
SNORD46-201ENST00000364043 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa3.83□□□□□ -1.8
SNORD46-201ENST00000364043 S4R3F8 94 aa3.83□□□□□ -1.8
SNORD46-201ENST00000364043 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa3.82□□□□□ -1.8
SNORD46-201ENST00000364043 A0A1B0GU33 70 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD46-201ENST00000364043 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD46-201ENST00000364043 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD46-201ENST00000364043 H0YAA0 97 aa3.78□□□□□ -1.8
SNORD46-201ENST00000364043 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa3.74□□□□□ -1.81
SNORD46-201ENST00000364043 CSAG1Q6PB30 78 aa3.71□□□□□ -1.82
SNORD46-201ENST00000364043 SPRR2EP22531 72 aa3.68□□□□□ -1.82
SNORD46-201ENST00000364043 SPRR2BP35325 72 aa3.68□□□□□ -1.82
SNORD46-201ENST00000364043 SPRR2AP35326 72 aa3.68□□□□□ -1.82
SNORD46-201ENST00000364043 K7ERS5 55 aa3.67□□□□□ -1.82
SNORD46-201ENST00000364043 P0C880 135 aa3.67□□□□□ -1.82
SNORD46-201ENST00000364043 ADM2Q7Z4H4 148 aa3.66□□□□□ -1.82
SNORD46-201ENST00000364043 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa3.65□□□□□ -1.83
SNORD46-201ENST00000364043 M0QZ58 72 aa3.64□□□□□ -1.83
SNORD46-201ENST00000364043 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
SNORD46-201ENST00000364043 PRAC1Q96KF2 57 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD46-201ENST00000364043 SPRR2FQ96RM1 72 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD46-201ENST00000364043 A0A0D9SG42 100 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD46-201ENST00000364043 SPRR2DP22532 72 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD46-201ENST00000364043 KRTAP12-1P59990 96 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD46-201ENST00000364043 ROMO1P60602 79 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD46-201ENST00000364043 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD46-201ENST00000364043 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.53□□□□□ -1.85
SNORD46-201ENST00000364043 KRTAP12-2P59991 146 aa3.52□□□□□ -1.85
SNORD46-201ENST00000364043 LCE3BQ5TA77 95 aa3.52□□□□□ -1.85
SNORD46-201ENST00000364043 R4GN34 69 aa3.52□□□□□ -1.85
SNORD46-201ENST00000364043 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.51□□□□□ -1.85
SNORD46-201ENST00000364043 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.51□□□□□ -1.85
SNORD46-201ENST00000364043 KRTAP10-5P60370 271 aa3.48□□□□□ -1.85
SNORD46-201ENST00000364043 SPINT4Q6UDR6 99 aa3.48□□□□□ -1.85
SNORD46-201ENST00000364043 CRIPTQ9P021 101 aa3.48□□□□□ -1.85
SNORD46-201ENST00000364043 LINC01554Q52M75 96 aa3.47□□□□□ -1.85
SNORD46-201ENST00000364043 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.46□□□□□ -1.86
SNORD46-201ENST00000364043 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.41□□□□□ -1.86
SNORD46-201ENST00000364043 MT1BP07438 61 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD46-201ENST00000364043 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD46-201ENST00000364043 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.37□□□□□ -1.87
SNORD46-201ENST00000364043 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa3.34□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.3 ms