RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
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SHQ1-201ENST00000325599 KRTAP10-8P60410 259 aa8.63□□□□□ -1.03
SHQ1-201ENST00000325599 SPINT4Q6UDR6 99 aa8.62□□□□□ -1.03
SHQ1-201ENST00000325599 A0A0A0MQY5 61 aa8.61□□□□□ -1.03
SHQ1-201ENST00000325599 NDUFAF8A1L188 74 aa8.61□□□□□ -1.03
SHQ1-201ENST00000325599 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa8.6□□□□□ -1.03
SHQ1-201ENST00000325599 MYCBP2O75592 4640 aa8.59□□□□□ -1.03
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SHQ1-201ENST00000325599 BIRC6Q9NR09 4857 aa7.84□□□□□ -1.15
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SHQ1-201ENST00000325599 J3QL48 77 aa7.81□□□□□ -1.16
SHQ1-201ENST00000325599 M0QZ58 72 aa7.79□□□□□ -1.16
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SHQ1-201ENST00000325599 HERC1Q15751 4861 aa7.5□□□□□ -1.21
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SHQ1-201ENST00000325599 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.93□□□□□ -1.3
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SHQ1-201ENST00000325599 MT2AP02795 61 aa6.9□□□□□ -1.3
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SHQ1-201ENST00000325599 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.87□□□□□ -1.31
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SHQ1-201ENST00000325599 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.78□□□□□ -1.32
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SHQ1-201ENST00000325599 MT1BP07438 61 aa6.66□□□□□ -1.34
SHQ1-201ENST00000325599 KRTAP10-5P60370 271 aa6.6□□□□□ -1.35
SHQ1-201ENST00000325599 INE1O15225 51 aa6.6□□□□□ -1.35
SHQ1-201ENST00000325599 MT1XP80297 61 aa6.59□□□□□ -1.35
SHQ1-201ENST00000325599 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-201ENST00000325599 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.45□□□□□ -1.38
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SHQ1-201ENST00000325599 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.1□□□□□ -1.43
SHQ1-201ENST00000325599 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.96□□□□□ -1.46
SHQ1-201ENST00000325599 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.88□□□□□ -1.47
SHQ1-201ENST00000325599 FSIP2Q5CZC0 6907 aa5.86□□□□□ -1.47
SHQ1-201ENST00000325599 SSPOA2VEC9 5147 aa5.86□□□□□ -1.47
SHQ1-201ENST00000325599 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.81□□□□□ -1.48
SHQ1-201ENST00000325599 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.8□□□□□ -1.48
SHQ1-201ENST00000325599 MT1EP04732 61 aa5.7□□□□□ -1.5
SHQ1-201ENST00000325599 MT1LQ93083 61 aa5.69□□□□□ -1.5
SHQ1-201ENST00000325599 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-201ENST00000325599 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
SHQ1-201ENST00000325599 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
SHQ1-201ENST00000325599 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.5□□□□□ -1.53
SHQ1-201ENST00000325599 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.5□□□□□ -1.53
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