RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 SPINK6Q6UWN8 80 aa4.07□□□□□ -1.76
SMARCE1-201ENST00000264640 ANAPC11Q9NYG5 84 aa4.07□□□□□ -1.76
SMARCE1-201ENST00000264640 COA5Q86WW8 74 aa4.06□□□□□ -1.76
SMARCE1-201ENST00000264640 LINC00313P59037 77 aa4.05□□□□□ -1.76
SMARCE1-201ENST00000264640 PCOTHQ58A44 107 aa4.05□□□□□ -1.76
SMARCE1-201ENST00000264640 PRR26Q8N8Z3 221 aa4.03□□□□□ -1.76
SMARCE1-201ENST00000264640 PSPHP1O15172 72 aa4.02□□□□□ -1.77
SMARCE1-201ENST00000264640 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
SMARCE1-201ENST00000264640 ACYP2P14621 99 aa4.01□□□□□ -1.77
SMARCE1-201ENST00000264640 A8MUN3 132 aa4□□□□□ -1.77
SMARCE1-201ENST00000264640 SPINK1P00995 79 aa4□□□□□ -1.77
SMARCE1-201ENST00000264640 PRR15LQ9BU68 103 aa4□□□□□ -1.77
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A087X002 238 aa3.99□□□□□ -1.77
SMARCE1-201ENST00000264640 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa3.99□□□□□ -1.77
SMARCE1-201ENST00000264640 SPAG11AQ6PDA7 123 aa3.99□□□□□ -1.77
SMARCE1-201ENST00000264640 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa3.99□□□□□ -1.77
SMARCE1-201ENST00000264640 TYMSOSQ8TAI1 123 aa3.99□□□□□ -1.77
SMARCE1-201ENST00000264640 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa3.99□□□□□ -1.77
SMARCE1-201ENST00000264640 RPS29P62273 56 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
SMARCE1-201ENST00000264640 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa3.98□□□□□ -1.77
SMARCE1-201ENST00000264640 Q5VV11 94 aa3.98□□□□□ -1.77
SMARCE1-201ENST00000264640 Q75L30 129 aa3.98□□□□□ -1.77
SMARCE1-201ENST00000264640 HRES1P13985 223 aa3.97□□□□□ -1.77
SMARCE1-201ENST00000264640 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa3.97□□□□□ -1.77
SMARCE1-201ENST00000264640 Q5W150 140 aa3.97□□□□□ -1.77
SMARCE1-201ENST00000264640 MUC17Q685J3 4493 aa3.95□□□□□ -1.78
SMARCE1-201ENST00000264640 A6NED7 52 aa3.95□□□□□ -1.78
SMARCE1-201ENST00000264640 IGKV2-30P06310 120 aa3.95□□□□□ -1.78
SMARCE1-201ENST00000264640 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa3.95□□□□□ -1.78
SMARCE1-201ENST00000264640 LINC00304Q8N9R0 145 aa3.94□□□□□ -1.78
SMARCE1-201ENST00000264640 DMAC1Q96GE9 116 aa3.94□□□□□ -1.78
SMARCE1-201ENST00000264640 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa3.92□□□□□ -1.78
SMARCE1-201ENST00000264640 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa3.91□□□□□ -1.78
SMARCE1-201ENST00000264640 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.91□□□□□ -1.78
SMARCE1-201ENST00000264640 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa3.91□□□□□ -1.78
SMARCE1-201ENST00000264640 RETNLBQ9BQ08 111 aa3.9□□□□□ -1.79
SMARCE1-201ENST00000264640 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa3.89□□□□□ -1.79
SMARCE1-201ENST00000264640 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
SMARCE1-201ENST00000264640 C7orf65Q6ZTY9 151 aa3.89□□□□□ -1.79
SMARCE1-201ENST00000264640 SPTSSBQ8NFR3 76 aa3.89□□□□□ -1.79
SMARCE1-201ENST00000264640 PMAIP1Q13794 54 aa3.88□□□□□ -1.79
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A1B0GU69 56 aa3.86□□□□□ -1.79
SMARCE1-201ENST00000264640 SEC61GP60059 68 aa3.84□□□□□ -1.79
SMARCE1-201ENST00000264640 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa3.84□□□□□ -1.79
SMARCE1-201ENST00000264640 TPRXLQ17RH7 258 aa3.83□□□□□ -1.8
SMARCE1-201ENST00000264640 LCA10Q71F78 164 aa3.83□□□□□ -1.8
SMARCE1-201ENST00000264640 A8MUU9 505 aa3.82□□□□□ -1.8
SMARCE1-201ENST00000264640 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa3.82□□□□□ -1.8
SMARCE1-201ENST00000264640 UQCR11O14957 56 aa3.81□□□□□ -1.8
SMARCE1-201ENST00000264640 SPINK7P58062 85 aa3.81□□□□□ -1.8
SMARCE1-201ENST00000264640 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
SMARCE1-201ENST00000264640 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.8□□□□□ -1.8
SMARCE1-201ENST00000264640 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.8□□□□□ -1.8
SMARCE1-201ENST00000264640 SPATA8Q6RVD6 105 aa3.78□□□□□ -1.8
SMARCE1-201ENST00000264640 C9orf92A6NGG3 77 aa3.77□□□□□ -1.81
SMARCE1-201ENST00000264640 A6NN06 94 aa3.77□□□□□ -1.81
SMARCE1-201ENST00000264640 MT1HP80294 61 aa3.77□□□□□ -1.81
SMARCE1-201ENST00000264640 MIR22HGQ0VDD5 57 aa3.77□□□□□ -1.81
SMARCE1-201ENST00000264640 A8MU10 97 aa3.76□□□□□ -1.81
SMARCE1-201ENST00000264640 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
SMARCE1-201ENST00000264640 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa3.73□□□□□ -1.81
SMARCE1-201ENST00000264640 SSPOA2VEC9 5147 aa3.72□□□□□ -1.81
SMARCE1-201ENST00000264640 USH2AO75445 5202 aa3.71□□□□□ -1.81
SMARCE1-201ENST00000264640 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
SMARCE1-201ENST00000264640 COX6B2Q6YFQ2 88 aa3.7□□□□□ -1.82
SMARCE1-201ENST00000264640 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
SMARCE1-201ENST00000264640 M0R2T5 61 aa3.68□□□□□ -1.82
SMARCE1-201ENST00000264640 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.67□□□□□ -1.82
SMARCE1-201ENST00000264640 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A1B0GU33 70 aa3.65□□□□□ -1.83
SMARCE1-201ENST00000264640 K7ERS5 55 aa3.65□□□□□ -1.83
SMARCE1-201ENST00000264640 RPL37P61927 97 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
SMARCE1-201ENST00000264640 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa3.64□□□□□ -1.83
SMARCE1-201ENST00000264640 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
SMARCE1-201ENST00000264640 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa3.63□□□□□ -1.83
SMARCE1-201ENST00000264640 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
SMARCE1-201ENST00000264640 S4R3F8 94 aa3.59□□□□□ -1.83
SMARCE1-201ENST00000264640 LCE1EQ5T753 118 aa3.58□□□□□ -1.84
SMARCE1-201ENST00000264640 H0YAA0 97 aa3.57□□□□□ -1.84
SMARCE1-201ENST00000264640 PRAC1Q96KF2 57 aa3.53□□□□□ -1.84
SMARCE1-201ENST00000264640 LINC01554Q52M75 96 aa3.5□□□□□ -1.85
SMARCE1-201ENST00000264640 CSAG1Q6PB30 78 aa3.5□□□□□ -1.85
SMARCE1-201ENST00000264640 ADM2Q7Z4H4 148 aa3.49□□□□□ -1.85
SMARCE1-201ENST00000264640 NEBP20929 6669 aa3.48□□□□□ -1.85
SMARCE1-201ENST00000264640 ROMO1P60602 79 aa3.46□□□□□ -1.86
SMARCE1-201ENST00000264640 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.45□□□□□ -1.86
SMARCE1-201ENST00000264640 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.45□□□□□ -1.86
SMARCE1-201ENST00000264640 M0QZ58 72 aa3.44□□□□□ -1.86
SMARCE1-201ENST00000264640 MT2AP02795 61 aa3.43□□□□□ -1.86
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A0D9SG42 100 aa3.42□□□□□ -1.86
SMARCE1-201ENST00000264640 MT1FP04733 61 aa3.41□□□□□ -1.86
SMARCE1-201ENST00000264640 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.41□□□□□ -1.86
SMARCE1-201ENST00000264640 P0C880 135 aa3.39□□□□□ -1.87
SMARCE1-201ENST00000264640 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa3.38□□□□□ -1.87
SMARCE1-201ENST00000264640 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa3.38□□□□□ -1.87
SMARCE1-201ENST00000264640 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.36□□□□□ -1.87
SMARCE1-201ENST00000264640 KRTAP10-10P60014 251 aa3.36□□□□□ -1.87
SMARCE1-201ENST00000264640 CRIPTQ9P021 101 aa3.36□□□□□ -1.87
SMARCE1-201ENST00000264640 SPINT4Q6UDR6 99 aa3.35□□□□□ -1.87
SMARCE1-201ENST00000264640 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.34□□□□□ -1.87
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