RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620466.4

ALMS1-208, Transcript of ALMS1, centrosome and basal body associated protein, human

TSL 2

Gene ALMS1, Length 6,720 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ALMS1-208	ENST00000620466	COL12A1	Q99715	3063 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ALMS1-208	ENST00000620466	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ALMS1-208	ENST00000620466	ITPR1	Q14643	2758 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ALMS1-208	ENST00000620466	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ALMS1-208	ENST00000620466	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ALMS1-208	ENST00000620466	NDUFAF8	A1L188	74 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ALMS1-208	ENST00000620466	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ALMS1-208	ENST00000620466	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ALMS1-208	ENST00000620466	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ALMS1-208	ENST00000620466	RELN	P78509	3460 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ALMS1-208	ENST00000620466	MAST4	O15021	2626 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ALMS1-208	ENST00000620466	LAMA5	O15230	3695 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ALMS1-208	ENST00000620466	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ALMS1-208	ENST00000620466	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
ALMS1-208	ENST00000620466		A8MUU9	505 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ALMS1-208	ENST00000620466	C20orf166-AS1	Q96NR2	134 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ALMS1-208	ENST00000620466	FLNC	Q14315	2725 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ALMS1-208	ENST00000620466	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ALMS1-208	ENST00000620466	APC	P25054	2843 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ALMS1-208	ENST00000620466	BSN	Q9UPA5	3926 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ALMS1-208	ENST00000620466	ITPR2	Q14571	2701 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ALMS1-208	ENST00000620466	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ALMS1-208	ENST00000620466	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ALMS1-208	ENST00000620466	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		4.59	□□□□□ -1.68
ALMS1-208	ENST00000620466	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ALMS1-208	ENST00000620466	ZAN	Q9Y493	2812 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ALMS1-208	ENST00000620466	FBN2	P35556	2912 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ALMS1-208	ENST00000620466	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ALMS1-208	ENST00000620466	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ALMS1-208	ENST00000620466	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ALMS1-208	ENST00000620466	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ALMS1-208	ENST00000620466	MUC3A	Q02505	3323 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ALMS1-208	ENST00000620466	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ALMS1-208	ENST00000620466	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ALMS1-208	ENST00000620466		P0C880	135 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ALMS1-208	ENST00000620466	NOTCH1	P46531	2555 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ALMS1-208	ENST00000620466	TNP1	P09430	55 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ALMS1-208	ENST00000620466	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ALMS1-208	ENST00000620466	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ALMS1-208	ENST00000620466	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ALMS1-208	ENST00000620466	HIVEP1	P15822	2718 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ALMS1-208	ENST00000620466	COL6A5	A8TX70	2615 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ALMS1-208	ENST00000620466	STAB1	Q9NY15	2570 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ALMS1-208	ENST00000620466	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ALMS1-208	ENST00000620466	PP632	Q6XCG6	107 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ALMS1-208	ENST00000620466	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
ALMS1-208	ENST00000620466		A0A1B0GVY2	172 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ALMS1-208	ENST00000620466	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		4.46	□□□□□ -1.7
ALMS1-208	ENST00000620466	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		4.46	□□□□□ -1.7
ALMS1-208	ENST00000620466	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		4.45	□□□□□ -1.7
ALMS1-208	ENST00000620466		H0YAA0	97 aa		4.44	□□□□□ -1.7
ALMS1-208	ENST00000620466	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		4.44	□□□□□ -1.7
ALMS1-208	ENST00000620466	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		4.43	□□□□□ -1.7
ALMS1-208	ENST00000620466	KRTAP10-8	P60410	259 aa		4.42	□□□□□ -1.7
ALMS1-208	ENST00000620466	PDZD2	O15018	2839 aa		4.41	□□□□□ -1.7
ALMS1-208	ENST00000620466	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	4.41	□□□□□ -1.7
ALMS1-208	ENST00000620466	XP32	Q5T750	250 aa		4.4	□□□□□ -1.71
ALMS1-208	ENST00000620466	NF1	P21359	2839 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ALMS1-208	ENST00000620466	ZFHX3	Q15911	3703 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ALMS1-208	ENST00000620466	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ALMS1-208	ENST00000620466	KRTAP10-10	P60014	251 aa		4.32	□□□□□ -1.72
ALMS1-208	ENST00000620466	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		4.32	□□□□□ -1.72
ALMS1-208	ENST00000620466	VPS13C	Q709C8	3753 aa		4.31	□□□□□ -1.72
ALMS1-208	ENST00000620466	AKAP9	Q99996	3911 aa		4.31	□□□□□ -1.72
ALMS1-208	ENST00000620466	TPRXL	Q17RH7	258 aa		4.3	□□□□□ -1.72
ALMS1-208	ENST00000620466	TENM4	Q6N022	2769 aa		4.29	□□□□□ -1.72
ALMS1-208	ENST00000620466	PRO2289	Q9P1D8	64 aa		4.29	□□□□□ -1.72
ALMS1-208	ENST00000620466	TENM3	Q9P273	2699 aa		4.29	□□□□□ -1.72
ALMS1-208	ENST00000620466	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
ALMS1-208	ENST00000620466	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
ALMS1-208	ENST00000620466	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ALMS1-208	ENST00000620466	CUBN	O60494	3623 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ALMS1-208	ENST00000620466	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ALMS1-208	ENST00000620466	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		4.2	□□□□□ -1.74
ALMS1-208	ENST00000620466	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		4.19	□□□□□ -1.74
ALMS1-208	ENST00000620466	KRTAP12-2	P59991	146 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ALMS1-208	ENST00000620466	VWF	P04275	2813 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ALMS1-208	ENST00000620466	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
ALMS1-208	ENST00000620466	TG	P01266	2768 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ALMS1-208	ENST00000620466	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
ALMS1-208	ENST00000620466	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
ALMS1-208	ENST00000620466	TENM2	Q9NT68	2774 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ALMS1-208	ENST00000620466	KRTAP12-1	P59990	96 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ALMS1-208	ENST00000620466	KRTAP13-4	Q3LI77	160 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ALMS1-208	ENST00000620466	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ALMS1-208	ENST00000620466	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
ALMS1-208	ENST00000620466	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ALMS1-208	ENST00000620466	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ALMS1-208	ENST00000620466	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ALMS1-208	ENST00000620466	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		3.96	□□□□□ -1.77
ALMS1-208	ENST00000620466	KRTAP3-3	Q9BYR6	98 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ALMS1-208	ENST00000620466	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	3.94	□□□□□ -1.78
ALMS1-208	ENST00000620466	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		3.94	□□□□□ -1.78
ALMS1-208	ENST00000620466	KRTAP3-2	Q9BYR7	98 aa		3.94	□□□□□ -1.78
ALMS1-208	ENST00000620466	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		3.93	□□□□□ -1.78
ALMS1-208	ENST00000620466	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
ALMS1-208	ENST00000620466	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
ALMS1-208	ENST00000620466	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		3.91	□□□□□ -1.78
ALMS1-208	ENST00000620466	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		3.9	□□□□□ -1.79
ALMS1-208	ENST00000620466	INE1	O15225	51 aa		3.89	□□□□□ -1.79

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