RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGEF1-209ENST00000607882 Q8N377 158 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGEF1-209ENST00000607882 BPY2O14599 106 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-209ENST00000607882 IGKV4-1P06312 121 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGEF1-209ENST00000607882 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-209ENST00000607882 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa7.68□□□□□ -1.18
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RABGEF1-209ENST00000607882 C1orf137Q5JT78 98 aa7.67□□□□□ -1.18
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RABGEF1-209ENST00000607882 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.31□□□□□ -1.24
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RABGEF1-209ENST00000607882 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-209ENST00000607882 C8orf17Q9NRJ1 99 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-209ENST00000607882 LINC00483Q53H64 154 aa7.12□□□□□ -1.27
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RABGEF1-209ENST00000607882 LUZP6Q538Z0 58 aa7.09□□□□□ -1.27
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