RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 SNURFQ9Y675 71 aa15.23■□□□□ 0.03
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CAPNS1-204ENST00000587718 C9orf92A6NGG3 77 aa13.66□□□□□ -0.22
CAPNS1-204ENST00000587718 MUC17Q685J3 4493 aa13.6□□□□□ -0.23
CAPNS1-204ENST00000587718 A6NED7 52 aa13.54□□□□□ -0.24
CAPNS1-204ENST00000587718 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
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