RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559460.5

SMAD3-211, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa4.54□□□□□ -1.68
SMAD3-211ENST00000559460 TAX1BP3O14907 124 aa4.54□□□□□ -1.68
SMAD3-211ENST00000559460 H0YGX0 51 aa4.53□□□□□ -1.68
SMAD3-211ENST00000559460 SNCGO76070 127 aa4.53□□□□□ -1.68
SMAD3-211ENST00000559460 VAMP3Q15836 100 aa4.53□□□□□ -1.68
SMAD3-211ENST00000559460 FABP2P12104 132 aa4.52□□□□□ -1.69
SMAD3-211ENST00000559460 SMIM11BQ8TCY0 68 aa4.52□□□□□ -1.69
SMAD3-211ENST00000559460 A0A1B0GX51 115 aa4.51□□□□□ -1.69
SMAD3-211ENST00000559460 A0A1W2PPM0 123 aa4.51□□□□□ -1.69
SMAD3-211ENST00000559460 PSMB2P49721 201 aa4.51□□□□□ -1.69
SMAD3-211ENST00000559460 H3BUT2 72 aa4.5□□□□□ -1.69
SMAD3-211ENST00000559460 K7ERJ3 54 aa4.5□□□□□ -1.69
SMAD3-211ENST00000559460 SCGB1C2P0DMR2 95 aa4.5□□□□□ -1.69
SMAD3-211ENST00000559460 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa4.5□□□□□ -1.69
SMAD3-211ENST00000559460 H3BQ85 93 aa4.49□□□□□ -1.69
SMAD3-211ENST00000559460 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
SMAD3-211ENST00000559460 LINC00313P59037 77 aa4.49□□□□□ -1.69
SMAD3-211ENST00000559460 Q5VV11 94 aa4.49□□□□□ -1.69
SMAD3-211ENST00000559460 SIGMAR1Q99720 223 aa4.49□□□□□ -1.69
SMAD3-211ENST00000559460 TRIAP1O43715 76 aa4.48□□□□□ -1.69
SMAD3-211ENST00000559460 SPRR2FQ96RM1 72 aa4.48□□□□□ -1.69
SMAD3-211ENST00000559460 TRACP01848 142 aa4.47□□□□□ -1.69
SMAD3-211ENST00000559460 ATXN8Q156A1 80 aa4.47□□□□□ -1.69
SMAD3-211ENST00000559460 OCIAD2Q56VL3 154 aa4.47□□□□□ -1.69
SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP10-5P60370 271 aa4.46□□□□□ -1.7
SMAD3-211ENST00000559460 SPCS1Q9Y6A9 102 aa4.46□□□□□ -1.7
SMAD3-211ENST00000559460 A0A1W2PNM2 257 aa4.45□□□□□ -1.7
SMAD3-211ENST00000559460 K7EP34 96 aa4.45□□□□□ -1.7
SMAD3-211ENST00000559460 UBE2V1Q13404 147 aa4.45□□□□□ -1.7
SMAD3-211ENST00000559460 FAM218AQ96MZ4 157 aa4.45□□□□□ -1.7
SMAD3-211ENST00000559460 IMUPQ9GZP8 106 aa4.45□□□□□ -1.7
SMAD3-211ENST00000559460 A0A1B0GV90 55 aa4.44□□□□□ -1.7
SMAD3-211ENST00000559460 hADV29S1A0JD25 119 aa4.44□□□□□ -1.7
SMAD3-211ENST00000559460 F8W1H4 67 aa4.44□□□□□ -1.7
SMAD3-211ENST00000559460 LINC00575Q6W349 94 aa4.44□□□□□ -1.7
SMAD3-211ENST00000559460 DNAL4O96015 105 aa4.43□□□□□ -1.7
SMAD3-211ENST00000559460 SPINK7P58062 85 aa4.43□□□□□ -1.7
SMAD3-211ENST00000559460 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
SMAD3-211ENST00000559460 Q6ZQY7 126 aa4.43□□□□□ -1.7
SMAD3-211ENST00000559460 WFDC13Q8IUB5 93 aa4.43□□□□□ -1.7
SMAD3-211ENST00000559460 PPDPFLQ8WWR9 84 aa4.43□□□□□ -1.7
SMAD3-211ENST00000559460 SPRR2DP22532 72 aa4.42□□□□□ -1.7
SMAD3-211ENST00000559460 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
SMAD3-211ENST00000559460 H3BMG7 143 aa4.41□□□□□ -1.7
SMAD3-211ENST00000559460 H3BT86 120 aa4.41□□□□□ -1.7
SMAD3-211ENST00000559460 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa4.41□□□□□ -1.7
SMAD3-211ENST00000559460 MT1BP07438 61 aa4.41□□□□□ -1.7
SMAD3-211ENST00000559460 A0A087WSZ3 146 aa4.4□□□□□ -1.71
SMAD3-211ENST00000559460 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa4.4□□□□□ -1.71
SMAD3-211ENST00000559460 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa4.4□□□□□ -1.71
SMAD3-211ENST00000559460 ORMDL1Q9P0S3 153 aa4.4□□□□□ -1.71
SMAD3-211ENST00000559460 C9JAW5 83 aa4.39□□□□□ -1.71
SMAD3-211ENST00000559460 BAALC-AS2P0C853 105 aa4.39□□□□□ -1.71
SMAD3-211ENST00000559460 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa4.39□□□□□ -1.71
SMAD3-211ENST00000559460 TEN1Q86WV5 123 aa4.39□□□□□ -1.71
SMAD3-211ENST00000559460 IGKV4-1P06312 121 aa4.38□□□□□ -1.71
SMAD3-211ENST00000559460 ANKRD29Q8N6D5 301 aa4.38□□□□□ -1.71
SMAD3-211ENST00000559460 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.37□□□□□ -1.71
SMAD3-211ENST00000559460 PRO0461Q9UI25 63 aa4.37□□□□□ -1.71
SMAD3-211ENST00000559460 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa4.36□□□□□ -1.71
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SMAD3-211ENST00000559460 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa4.35□□□□□ -1.71
SMAD3-211ENST00000559460 A0A1B0GV72 72 aa4.35□□□□□ -1.71
SMAD3-211ENST00000559460 PDE6GP18545 87 aa4.34□□□□□ -1.71
SMAD3-211ENST00000559460 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa4.34□□□□□ -1.71
SMAD3-211ENST00000559460 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.34□□□□□ -1.71
SMAD3-211ENST00000559460 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa4.33□□□□□ -1.72
SMAD3-211ENST00000559460 RBM3P98179 157 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
SMAD3-211ENST00000559460 LCE3BQ5TA77 95 aa4.32□□□□□ -1.72
SMAD3-211ENST00000559460 A0A1B0GW54 56 aa4.31□□□□□ -1.72
SMAD3-211ENST00000559460 J3QR89 54 aa4.31□□□□□ -1.72
SMAD3-211ENST00000559460 ETDBQ3ZM63 59 aa4.31□□□□□ -1.72
SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa4.3□□□□□ -1.72
SMAD3-211ENST00000559460 DSCR8Q96T75 97 aa4.3□□□□□ -1.72
SMAD3-211ENST00000559460 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa4.29□□□□□ -1.72
SMAD3-211ENST00000559460 C8orf87E5RJ46 101 aa4.29□□□□□ -1.72
SMAD3-211ENST00000559460 ACYP1P07311 99 aa4.28□□□□□ -1.72
SMAD3-211ENST00000559460 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa4.27□□□□□ -1.73
SMAD3-211ENST00000559460 K7ERU9 68 aa4.27□□□□□ -1.73
SMAD3-211ENST00000559460 SPRR2GQ9BYE4 73 aa4.27□□□□□ -1.73
SMAD3-211ENST00000559460 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa4.26□□□□□ -1.73
SMAD3-211ENST00000559460 CCKP06307 115 aa4.26□□□□□ -1.73
SMAD3-211ENST00000559460 DEFB116Q30KQ4 102 aa4.26□□□□□ -1.73
SMAD3-211ENST00000559460 Q6ZQT0 140 aa4.25□□□□□ -1.73
SMAD3-211ENST00000559460 VPS25Q9BRG1 176 aa4.25□□□□□ -1.73
SMAD3-211ENST00000559460 C14orf132Q9NPU4 83 aa4.24□□□□□ -1.73
SMAD3-211ENST00000559460 A0A1B0GVX0 72 aa4.22□□□□□ -1.73
SMAD3-211ENST00000559460 C5orf47Q569G3 176 aa4.21□□□□□ -1.74
SMAD3-211ENST00000559460 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa4.19□□□□□ -1.74
SMAD3-211ENST00000559460 PRO2289Q9P1D8 64 aa4.19□□□□□ -1.74
SMAD3-211ENST00000559460 UBL5Q9BZL1 73 aa4.18□□□□□ -1.74
SMAD3-211ENST00000559460 LINC00472Q9H8W2 130 aa4.18□□□□□ -1.74
SMAD3-211ENST00000559460 SVIPQ8NHG7 77 aa4.17□□□□□ -1.74
SMAD3-211ENST00000559460 NREPQ16612 68 aa4.16□□□□□ -1.74
SMAD3-211ENST00000559460 LINC00643Q86TS7 51 aa4.16□□□□□ -1.74
SMAD3-211ENST00000559460 KLKP1Q107X0 134 aa4.15□□□□□ -1.75
SMAD3-211ENST00000559460 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa4.15□□□□□ -1.75
SMAD3-211ENST00000559460 J3KT08 172 aa4.14□□□□□ -1.75
SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.14□□□□□ -1.75
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