RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535535.5

LMO3-212, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-212ENST00000535535 CCL18P55774 89 aa4.89□□□□□ -1.63
LMO3-212ENST00000535535 PRCDQ00LT1 54 aa4.89□□□□□ -1.63
LMO3-212ENST00000535535 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
LMO3-212ENST00000535535 C7orf33Q8WU49 177 aa4.89□□□□□ -1.63
LMO3-212ENST00000535535 LINC00167Q96N53 147 aa4.89□□□□□ -1.63
LMO3-212ENST00000535535 H3BPC8 53 aa4.88□□□□□ -1.63
LMO3-212ENST00000535535 HMCN2Q8NDA2 5059 aa4.88□□□□□ -1.63
LMO3-212ENST00000535535 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa4.87□□□□□ -1.63
LMO3-212ENST00000535535 SMIM1B2RUZ4 78 aa4.87□□□□□ -1.63
LMO3-212ENST00000535535 NCR3O14931 201 aa4.87□□□□□ -1.63
LMO3-212ENST00000535535 IGKV1-17P01599 117 aa4.87□□□□□ -1.63
LMO3-212ENST00000535535 DEFB1P60022 68 aa4.87□□□□□ -1.63
LMO3-212ENST00000535535 ERHP84090 104 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
LMO3-212ENST00000535535 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
LMO3-212ENST00000535535 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
LMO3-212ENST00000535535 SPINK9Q5DT21 86 aa4.86□□□□□ -1.63
LMO3-212ENST00000535535 LINC00308Q8TCZ7 52 aa4.86□□□□□ -1.63
LMO3-212ENST00000535535 H0Y9P7 68 aa4.85□□□□□ -1.63
LMO3-212ENST00000535535 KRTAP10-1P60331 282 aa4.85□□□□□ -1.63
LMO3-212ENST00000535535 HIGD2BQ4VC39 106 aa4.85□□□□□ -1.63
LMO3-212ENST00000535535 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa4.85□□□□□ -1.63
LMO3-212ENST00000535535 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
LMO3-212ENST00000535535 NDUFA1O15239 70 aa4.84□□□□□ -1.63
LMO3-212ENST00000535535 DNAH10OSP0CZ25 163 aa4.84□□□□□ -1.63
LMO3-212ENST00000535535 DEFB130BP0DP73 79 aa4.84□□□□□ -1.63
LMO3-212ENST00000535535 DEFB130AP0DP74 79 aa4.84□□□□□ -1.63
LMO3-212ENST00000535535 LINC00315P59091 139 aa4.84□□□□□ -1.63
LMO3-212ENST00000535535 C1orf137Q5JT78 98 aa4.83□□□□□ -1.64
LMO3-212ENST00000535535 Q8TAT8 98 aa4.83□□□□□ -1.64
LMO3-212ENST00000535535 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa4.83□□□□□ -1.64
LMO3-212ENST00000535535 A8MTW9 85 aa4.82□□□□□ -1.64
LMO3-212ENST00000535535 CRIP1P50238 77 aa4.82□□□□□ -1.64
LMO3-212ENST00000535535 LINC00483Q53H64 154 aa4.82□□□□□ -1.64
LMO3-212ENST00000535535 DMAC1Q96GE9 116 aa4.82□□□□□ -1.64
LMO3-212ENST00000535535 IGHV3-53P01767 116 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-212ENST00000535535 DNAH8Q96JB1 4490 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-212ENST00000535535 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-212ENST00000535535 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
LMO3-212ENST00000535535 A0A087WTM6 91 aa4.8□□□□□ -1.64
LMO3-212ENST00000535535 INSP01308 110 aa4.8□□□□□ -1.64
LMO3-212ENST00000535535 MGPP08493 103 aa4.8□□□□□ -1.64
LMO3-212ENST00000535535 SPINK13Q1W4C9 94 aa4.8□□□□□ -1.64
LMO3-212ENST00000535535 FAT3Q8TDW7 4589 aa4.79□□□□□ -1.64
LMO3-212ENST00000535535 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa4.79□□□□□ -1.64
LMO3-212ENST00000535535 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
LMO3-212ENST00000535535 H3BNG1 76 aa4.79□□□□□ -1.64
LMO3-212ENST00000535535 P0C880 135 aa4.79□□□□□ -1.64
LMO3-212ENST00000535535 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa4.79□□□□□ -1.64
LMO3-212ENST00000535535 C16orf74Q96GX8 76 aa4.79□□□□□ -1.64
LMO3-212ENST00000535535 TRGV2A0A075B6R0 118 aa4.78□□□□□ -1.64
LMO3-212ENST00000535535 A0A1B0GVX0 72 aa4.78□□□□□ -1.64
LMO3-212ENST00000535535 SPINK7P58062 85 aa4.78□□□□□ -1.64
LMO3-212ENST00000535535 LINC00612Q8N6U2 182 aa4.78□□□□□ -1.64
LMO3-212ENST00000535535 UQCR11O14957 56 aa4.77□□□□□ -1.65
LMO3-212ENST00000535535 IGKV4-1P06312 121 aa4.77□□□□□ -1.65
LMO3-212ENST00000535535 KCNQ1DNQ9H478 68 aa4.77□□□□□ -1.65
LMO3-212ENST00000535535 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
LMO3-212ENST00000535535 PRR34Q9NV39 138 aa4.77□□□□□ -1.65
LMO3-212ENST00000535535 A0A096LPF7 62 aa4.76□□□□□ -1.65
LMO3-212ENST00000535535 SPATA8Q6RVD6 105 aa4.76□□□□□ -1.65
LMO3-212ENST00000535535 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa4.76□□□□□ -1.65
LMO3-212ENST00000535535 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa4.76□□□□□ -1.65
LMO3-212ENST00000535535 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
LMO3-212ENST00000535535 HTN1P15515 57 aa4.75□□□□□ -1.65
LMO3-212ENST00000535535 LYZP61626 148 aa4.75□□□□□ -1.65
LMO3-212ENST00000535535 COA5Q86WW8 74 aa4.75□□□□□ -1.65
LMO3-212ENST00000535535 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa4.75□□□□□ -1.65
LMO3-212ENST00000535535 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa4.75□□□□□ -1.65
LMO3-212ENST00000535535 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa4.75□□□□□ -1.65
LMO3-212ENST00000535535 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa4.75□□□□□ -1.65
LMO3-212ENST00000535535 SMIM11BQ8TCY0 68 aa4.74□□□□□ -1.65
LMO3-212ENST00000535535 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa4.73□□□□□ -1.65
LMO3-212ENST00000535535 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa4.73□□□□□ -1.65
LMO3-212ENST00000535535 Q6ZTI0 123 aa4.73□□□□□ -1.65
LMO3-212ENST00000535535 RNF213Q63HN8 5207 aa4.73□□□□□ -1.65
LMO3-212ENST00000535535 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
LMO3-212ENST00000535535 DSCR10P59022 87 aa4.72□□□□□ -1.65
LMO3-212ENST00000535535 SPRR4Q96PI1 79 aa4.72□□□□□ -1.65
LMO3-212ENST00000535535 LRP2P98164 4655 aa4.71□□□□□ -1.65
LMO3-212ENST00000535535 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa4.71□□□□□ -1.66
LMO3-212ENST00000535535 A8MUU9 505 aa4.71□□□□□ -1.66
LMO3-212ENST00000535535 TLX1NBP0CAT3 122 aa4.71□□□□□ -1.66
LMO3-212ENST00000535535 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
LMO3-212ENST00000535535 Q6ZSA8 131 aa4.71□□□□□ -1.66
LMO3-212ENST00000535535 C15orf56Q8N910 161 aa4.71□□□□□ -1.66
LMO3-212ENST00000535535 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
LMO3-212ENST00000535535 NDUFAF8A1L188 74 aa4.7□□□□□ -1.66
LMO3-212ENST00000535535 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa4.69□□□□□ -1.66
LMO3-212ENST00000535535 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa4.69□□□□□ -1.66
LMO3-212ENST00000535535 WFDC10BQ8IUB3 73 aa4.69□□□□□ -1.66
LMO3-212ENST00000535535 H3BRN7 92 aa4.69□□□□□ -1.66
LMO3-212ENST00000535535 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
LMO3-212ENST00000535535 TNXBP22105 4242 aa4.67□□□□□ -1.66
LMO3-212ENST00000535535 PRO0255Q9UI72 69 aa4.67□□□□□ -1.66
LMO3-212ENST00000535535 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.66□□□□□ -1.66
LMO3-212ENST00000535535 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa4.66□□□□□ -1.66
LMO3-212ENST00000535535 COX7BP24311 80 aa4.66□□□□□ -1.66
LMO3-212ENST00000535535 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa4.65□□□□□ -1.66
LMO3-212ENST00000535535 PANO1I0J062 215 aa4.65□□□□□ -1.66
LMO3-212ENST00000535535 Q8NBF4 154 aa4.65□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 130.6 ms