RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533628.5

RPUSD4-208, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RPUSD4, Length 2,053 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4-208ENST00000533628 ANAPC11Q9NYG5 84 aa7.56□□□□□ -1.2
RPUSD4-208ENST00000533628 PRR26Q8N8Z3 221 aa7.55□□□□□ -1.2
RPUSD4-208ENST00000533628 A0A087X002 238 aa7.54□□□□□ -1.2
RPUSD4-208ENST00000533628 J3QL48 77 aa7.54□□□□□ -1.2
RPUSD4-208ENST00000533628 LINC00483Q53H64 154 aa7.52□□□□□ -1.21
RPUSD4-208ENST00000533628 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
RPUSD4-208ENST00000533628 IGKV4-1P06312 121 aa7.51□□□□□ -1.21
RPUSD4-208ENST00000533628 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa7.51□□□□□ -1.21
RPUSD4-208ENST00000533628 TRAV22A0A0B4J277 110 aa7.51□□□□□ -1.21
RPUSD4-208ENST00000533628 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa7.51□□□□□ -1.21
RPUSD4-208ENST00000533628 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa7.51□□□□□ -1.21
RPUSD4-208ENST00000533628 C1orf64Q8NEQ6 169 aa7.5□□□□□ -1.21
RPUSD4-208ENST00000533628 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
RPUSD4-208ENST00000533628 PSPHP1O15172 72 aa7.48□□□□□ -1.21
RPUSD4-208ENST00000533628 SPRR1BP22528 89 aa7.48□□□□□ -1.21
RPUSD4-208ENST00000533628 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa7.48□□□□□ -1.21
RPUSD4-208ENST00000533628 Q6ZQY7 126 aa7.47□□□□□ -1.21
RPUSD4-208ENST00000533628 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa7.47□□□□□ -1.21
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RPUSD4-208ENST00000533628 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
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RPUSD4-208ENST00000533628 TYMSOSQ8TAI1 123 aa7.45□□□□□ -1.22
RPUSD4-208ENST00000533628 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
RPUSD4-208ENST00000533628 Q8N9L7 120 aa7.43□□□□□ -1.22
RPUSD4-208ENST00000533628 Q5VV11 94 aa7.42□□□□□ -1.22
RPUSD4-208ENST00000533628 SMIM29Q86T20 159 aa7.42□□□□□ -1.22
RPUSD4-208ENST00000533628 Q8N377 158 aa7.42□□□□□ -1.22
RPUSD4-208ENST00000533628 A8MUN3 132 aa7.41□□□□□ -1.22
RPUSD4-208ENST00000533628 DEFB105AQ8NG35 78 aa7.41□□□□□ -1.22
RPUSD4-208ENST00000533628 NDUFS5O43920 106 aa7.4□□□□□ -1.22
RPUSD4-208ENST00000533628 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.39□□□□□ -1.23
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RPUSD4-208ENST00000533628 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa7.38□□□□□ -1.23
RPUSD4-208ENST00000533628 C4orf48Q5BLP8 95 aa7.37□□□□□ -1.23
RPUSD4-208ENST00000533628 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa7.37□□□□□ -1.23
RPUSD4-208ENST00000533628 LINC00304Q8N9R0 145 aa7.37□□□□□ -1.23
RPUSD4-208ENST00000533628 Q8NBF4 154 aa7.37□□□□□ -1.23
RPUSD4-208ENST00000533628 A6NN06 94 aa7.34□□□□□ -1.23
RPUSD4-208ENST00000533628 LIMD2Q9BT23 127 aa7.34□□□□□ -1.23
RPUSD4-208ENST00000533628 NDUFB1O75438 58 aa7.34□□□□□ -1.23
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RPUSD4-208ENST00000533628 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa7.32□□□□□ -1.24
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RPUSD4-208ENST00000533628 HCG22E2RYF7 251 aa7.31□□□□□ -1.24
RPUSD4-208ENST00000533628 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.3□□□□□ -1.24
RPUSD4-208ENST00000533628 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RPUSD4-208ENST00000533628 Q75L30 129 aa7.29□□□□□ -1.24
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RPUSD4-208ENST00000533628 SPTSSBQ8NFR3 76 aa7.28□□□□□ -1.24
RPUSD4-208ENST00000533628 A0A0G2JQZ4 141 aa7.28□□□□□ -1.24
RPUSD4-208ENST00000533628 LCA10Q71F78 164 aa7.28□□□□□ -1.24
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RPUSD4-208ENST00000533628 LINC00208Q96KT6 92 aa7.24□□□□□ -1.25
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RPUSD4-208ENST00000533628 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.13□□□□□ -1.27
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RPUSD4-208ENST00000533628 H3BS24 57 aa7.12□□□□□ -1.27
RPUSD4-208ENST00000533628 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7.12□□□□□ -1.27
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RPUSD4-208ENST00000533628 PRAC1Q96KF2 57 aa6.96□□□□□ -1.29
RPUSD4-208ENST00000533628 C9orf92A6NGG3 77 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD4-208ENST00000533628 XP32Q5T750 250 aa6.95□□□□□ -1.3
RPUSD4-208ENST00000533628 MUC17Q685J3 4493 aa6.94□□□□□ -1.3
RPUSD4-208ENST00000533628 A8MWP4 228 aa6.89□□□□□ -1.31
RPUSD4-208ENST00000533628 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.88□□□□□ -1.31
RPUSD4-208ENST00000533628 RNF213Q63HN8 5207 aa6.87□□□□□ -1.31
RPUSD4-208ENST00000533628 HRES1P13985 223 aa6.87□□□□□ -1.31
RPUSD4-208ENST00000533628 PCOTHQ58A44 107 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD4-208ENST00000533628 A0A1B0GVX0 72 aa6.85□□□□□ -1.31
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