RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517083.1

RNU6-548P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 548, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-548P, Length 115 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-548P-201ENST00000517083 A0A0D9SG42 100 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 UMAD1C9J7I0 102 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 LEPROTO15243 131 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 SSNA1O43805 119 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 ADCYAP1P18509 176 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 CEBPGP53567 150 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 LINC00575Q6W349 94 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 C1orf64Q8NEQ6 169 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPANXCQ9NY87 97 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 VAMP3Q15836 100 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 Q6ZQY7 126 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 Q6ZVQ6 151 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 MUSTN1Q8IVN3 82 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 PPDPFLQ8WWR9 84 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 LINC00472Q9H8W2 130 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 SMCO4Q9NRQ5 59 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 MUC19Q7Z5P9 8384 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 hADV29S1A0JD25 119 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 A6NDN8 102 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 LINC01546A6NGU7 62 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 C11orf86A6NJI1 115 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 HCG22E2RYF7 251 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 LYRM1O43325 122 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 NDUFC1O43677 76 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRGC2P03986 189 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 BTCP35070 178 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 H2BFSP57053 126 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM74A3Q4VXF1 159 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 BAGE3Q86Y29 109 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 C12orf57Q99622 126 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 OSTCQ9NRP0 149 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 V9GYH0 126 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-548P-201ENST00000517083 A0A087WVE0 104 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-548P-201ENST00000517083 J3KT08 172 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-548P-201ENST00000517083 TCTE3Q8IZS6 198 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-548P-201ENST00000517083 A0A1B0GXF2 115 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-548P-201ENST00000517083 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-548P-201ENST00000517083 SNCGO76070 127 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRACP01848 142 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-548P-201ENST00000517083 MT1AP04731 61 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-548P-201ENST00000517083 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-548P-201ENST00000517083 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP0.51□□□□□ -2.33
RNU6-548P-201ENST00000517083 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-548P-201ENST00000517083 SMIM7Q9BQ49 75 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-548P-201ENST00000517083 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP0.51□□□□□ -2.33
RNU6-548P-201ENST00000517083 C8orf17Q9NRJ1 99 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-548P-201ENST00000517083 V9GYV3 84 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-548P-201ENST00000517083 KRTAP23-1A1A580 65 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-548P-201ENST00000517083 H3BMG7 143 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-548P-201ENST00000517083 TIMM17BO60830 172 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-548P-201ENST00000517083 SERF1AO75920 110 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-548P-201ENST00000517083 HERVK_113P61574 105 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-548P-201ENST00000517083 UQCC3Q6UW78 93 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-548P-201ENST00000517083 LINC00308Q8TCZ7 52 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-548P-201ENST00000517083 COPS9Q8WXC6 57 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-548P-201ENST00000517083 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
RNU6-548P-201ENST00000517083 RPS10P5Q9NQ39 176 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-548P-201ENST00000517083 PAM16Q9Y3D7 125 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-548P-201ENST00000517083 J3QQQ9 107 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-548P-201ENST00000517083 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-548P-201ENST00000517083 BLOC1S1P78537 153 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-548P-201ENST00000517083 ADIRFQ15847 76 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-548P-201ENST00000517083 ANKRD29Q8N6D5 301 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM254Q8TBM7 123 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-548P-201ENST00000517083 S100ZQ8WXG8 99 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-548P-201ENST00000517083 BATF3Q9NR55 127 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-548P-201ENST00000517083 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-548P-201ENST00000517083 ARPC5O15511 151 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-548P-201ENST00000517083 CCKP06307 115 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-548P-201ENST00000517083 FABP2P12104 132 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-548P-201ENST00000517083 S100PP25815 95 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-548P-201ENST00000517083 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-548P-201ENST00000517083 SMIM11BQ8TCY0 68 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-548P-201ENST00000517083 VPS25Q9BRG1 176 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-548P-201ENST00000517083 A0A1B0GV72 72 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-548P-201ENST00000517083 PLNP26678 52 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-548P-201ENST00000517083 TSPEAR-AS2P59090 65 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-548P-201ENST00000517083 H0Y8G0 127 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-548P-201ENST00000517083 IFITM1P13164 125 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-548P-201ENST00000517083 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-548P-201ENST00000517083 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-548P-201ENST00000517083 HSPB8Q9UJY1 196 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-548P-201ENST00000517083 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-548P-201ENST00000517083 CXCL6P80162 114 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-548P-201ENST00000517083 FABP9Q0Z7S8 132 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-548P-201ENST00000517083 Q6ZQT0 140 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRO0461Q9UI25 63 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-548P-201ENST00000517083 K7EP34 96 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-548P-201ENST00000517083 ACYP1P07311 99 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-548P-201ENST00000517083 LINC00614P0C842 121 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-548P-201ENST00000517083 PMCHL1Q16048 86 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-548P-201ENST00000517083 IFI27L1Q96BM0 104 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-548P-201ENST00000517083 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-548P-201ENST00000517083 KRTAP12-3P60328 96 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-548P-201ENST00000517083 IFITM3Q01628 133 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-548P-201ENST00000517083 SCGB1D4Q6XE38 83 aa0.43□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.4 ms