RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 ARHGAP5Q13017 1502 aa-6.4□□□□□ -3.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 MYOM2P54296 1465 aa-6.41□□□□□ -3.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 E5RI56 91 aa-6.41□□□□□ -3.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 PFDN5Q99471 154 aa-6.41□□□□□ -3.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa-6.42□□□□□ -3.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 ARPC4P59998 168 aa-6.42□□□□□ -3.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 CHMP6Q96FZ7 201 aa-6.43□□□□□ -3.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 C6orf48Q9UBA6 75 aa-6.43□□□□□ -3.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP-6.43□□□□□ -3.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 C20orf78Q9BR46 151 aa-6.44□□□□□ -3.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP-6.44□□□□□ -3.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 FCER1GP30273 86 aa-6.45□□□□□ -3.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 TJP1Q07157 1748 aa-6.45□□□□□ -3.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 DNAH12Q6ZR08 3092 aa-6.46□□□□□ -3.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 H3BQ15 152 aa-6.46□□□□□ -3.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 NDUFA4O00483 81 aa-6.46□□□□□ -3.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 PLGLAQ15195 96 aa-6.46□□□□□ -3.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 NRAPQ86VF7 1730 aa-6.47□□□□□ -3.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 EEA1Q15075 1411 aa-6.47□□□□□ -3.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa-6.47□□□□□ -3.45
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF720Q7Z2F6 126 aa-6.48□□□□□ -3.45
RNU6-871P-201ENST00000516122 ACBD7Q8N6N7 88 aa-6.48□□□□□ -3.45
RNU6-871P-201ENST00000516122 PPLO60437 1756 aa-6.49□□□□□ -3.45
RNU6-871P-201ENST00000516122 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa-6.49□□□□□ -3.45
RNU6-871P-201ENST00000516122 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa-6.49□□□□□ -3.45
RNU6-871P-201ENST00000516122 CYB5AP00167 134 aa-6.51□□□□□ -3.45
RNU6-871P-201ENST00000516122 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP-6.51□□□□□ -3.45
RNU6-871P-201ENST00000516122 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa-6.52□□□□□ -3.45
RNU6-871P-201ENST00000516122 FABP1P07148 127 aa-6.53□□□□□ -3.45
RNU6-871P-201ENST00000516122 RICTORQ6R327 1708 aa-6.53□□□□□ -3.46
RNU6-871P-201ENST00000516122 KIF14Q15058 1648 aa-6.54□□□□□ -3.46
RNU6-871P-201ENST00000516122 PTMSP20962 102 aa-6.54□□□□□ -3.46
RNU6-871P-201ENST00000516122 LZICQ8WZA0 190 aa-6.54□□□□□ -3.46
RNU6-871P-201ENST00000516122 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP-6.55□□□□□ -3.46
RNU6-871P-201ENST00000516122 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP-6.55□□□□□ -3.46
RNU6-871P-201ENST00000516122 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP-6.55□□□□□ -3.46
RNU6-871P-201ENST00000516122 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP-6.55□□□□□ -3.46
RNU6-871P-201ENST00000516122 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP-6.56□□□□□ -3.46
RNU6-871P-201ENST00000516122 PREX2Q70Z35 1606 aa-6.56□□□□□ -3.46
RNU6-871P-201ENST00000516122 TTTY10Q9BZA0 68 aa-6.56□□□□□ -3.46
RNU6-871P-201ENST00000516122 ABCA3Q99758 1704 aa-6.56□□□□□ -3.46
RNU6-871P-201ENST00000516122 CLASP1Q7Z460 1538 aa-6.57□□□□□ -3.46
RNU6-871P-201ENST00000516122 ASPMQ8IZT6 3477 aa-6.58□□□□□ -3.46
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM25AB3EWG3 89 aa-6.58□□□□□ -3.46
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM25CB3EWG5 89 aa-6.58□□□□□ -3.46
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM25GB3EWG6 89 aa-6.58□□□□□ -3.46
RNU6-871P-201ENST00000516122 NDUFB1O75438 58 aa-6.58□□□□□ -3.46
RNU6-871P-201ENST00000516122 LINC00470Q9BZP3 86 aa-6.59□□□□□ -3.46
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCDC88BA6NC98 1476 aa-6.6□□□□□ -3.47
RNU6-871P-201ENST00000516122 CENPFP49454 3210 aa-6.6□□□□□ -3.47
RNU6-871P-201ENST00000516122 GNG7O60262 68 aa-6.61□□□□□ -3.47
RNU6-871P-201ENST00000516122 SMIM15Q7Z3B0 74 aa-6.61□□□□□ -3.47
RNU6-871P-201ENST00000516122 NAIPQ13075 1403 aa-6.61□□□□□ -3.47
RNU6-871P-201ENST00000516122 KCNQ1DNQ9H478 68 aa-6.62□□□□□ -3.47
RNU6-871P-201ENST00000516122 UMAD1C9J7I0 102 aa-6.64□□□□□ -3.47
RNU6-871P-201ENST00000516122 AKAIN1P0CW23 69 aa-6.64□□□□□ -3.47
RNU6-871P-201ENST00000516122 SELENOWP63302 87 aa-6.64□□□□□ -3.47
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP-6.65□□□□□ -3.47
RNU6-871P-201ENST00000516122 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP-6.65□□□□□ -3.47
RNU6-871P-201ENST00000516122 GNGT2O14610 69 aa-6.66□□□□□ -3.48
RNU6-871P-201ENST00000516122 LINC00032P0C843 101 aa-6.66□□□□□ -3.48
RNU6-871P-201ENST00000516122 SVBPQ8N300 66 aa-6.66□□□□□ -3.48
RNU6-871P-201ENST00000516122 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa-6.67□□□□□ -3.48
RNU6-871P-201ENST00000516122 MYO5CQ9NQX4 1742 aa-6.69□□□□□ -3.48
RNU6-871P-201ENST00000516122 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa-6.69□□□□□ -3.48
RNU6-871P-201ENST00000516122 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa-6.69□□□□□ -3.48
RNU6-871P-201ENST00000516122 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP-6.69□□□□□ -3.48
RNU6-871P-201ENST00000516122 UNC13AQ9UPW8 1703 aa-6.7□□□□□ -3.48
RNU6-871P-201ENST00000516122 NRKQ7Z2Y5 1582 aa-6.71□□□□□ -3.48
RNU6-871P-201ENST00000516122 KAAG1Q9UBP8 84 aa-6.72□□□□□ -3.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 PYDC1Q8WXC3 89 aa-6.73□□□□□ -3.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP-6.74□□□□□ -3.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 UQCRHLA0A096LP55 91 aa-6.74□□□□□ -3.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 ATOX1O00244 68 aa-6.75□□□□□ -3.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 FANCAO15360 1455 aa-6.76□□□□□ -3.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 PMCHL2Q9BQD1 86 aa-6.76□□□□□ -3.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 UBL5Q9BZL1 73 aa-6.76□□□□□ -3.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP-6.76□□□□□ -3.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 NREPQ16612 68 aa-6.77□□□□□ -3.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 C20orf202A1L168 122 aa-6.78□□□□□ -3.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 SNAPC5O75971 98 aa-6.78□□□□□ -3.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP-6.78□□□□□ -3.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 HFM1A2PYH4 1435 aa-6.78□□□□□ -3.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 S100A8P05109 93 aa-6.79□□□□□ -3.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 CDH23Q9H251 3354 aa-6.81□□□□□ -3.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 UACAQ9BZF9 1416 aa-6.81□□□□□ -3.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 PZPP20742 1482 aa-6.81□□□□□ -3.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa-6.82□□□□□ -3.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 DPY30Q9C005 99 aa-6.82□□□□□ -3.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa-6.84□□□□□ -3.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 NHSQ6T4R5 1651 aa-6.84□□□□□ -3.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa-6.85□□□□□ -3.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa-6.85□□□□□ -3.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 XIRP2A4UGR9 3374 aa-6.86□□□□□ -3.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 NALCNQ8IZF0 1738 aa-6.86□□□□□ -3.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 ABRACLQ9P1F3 81 aa-6.87□□□□□ -3.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP-6.88□□□□□ -3.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAUP35544 74 aaKnown RBP-6.88□□□□□ -3.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 CFAP43Q8NDM7 1665 aa-6.88□□□□□ -3.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM107BQ9H098 131 aa-6.89□□□□□ -3.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11 ms