RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510829.6

RABGEF1-208, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-208ENST00000510829 Q5XG85 94 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-208ENST00000510829 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-208ENST00000510829 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-208ENST00000510829 LINC00313P59037 77 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-208ENST00000510829 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-208ENST00000510829 LIMD2Q9BT23 127 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-208ENST00000510829 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-208ENST00000510829 RETNLBQ9BQ08 111 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1-208ENST00000510829 C8orf87E5RJ46 101 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1-208ENST00000510829 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1-208ENST00000510829 C1orf195Q5TG92 126 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1-208ENST00000510829 DNAH8Q96JB1 4490 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1-208ENST00000510829 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1-208ENST00000510829 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-208ENST00000510829 FRAS1Q86XX4 4008 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-208ENST00000510829 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-208ENST00000510829 DNAH6Q9C0G6 4158 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-208ENST00000510829 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.34□□□□□ -1.39
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RABGEF1-208ENST00000510829 Q5W150 140 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-208ENST00000510829 SPINK1P00995 79 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-208ENST00000510829 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-208ENST00000510829 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-208ENST00000510829 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-208ENST00000510829 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGEF1-208ENST00000510829 FAM229AH3BQW9 127 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-208ENST00000510829 PSPHP1O15172 72 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-208ENST00000510829 LRP1BQ9NZR2 4599 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-208ENST00000510829 COA5Q86WW8 74 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-208ENST00000510829 BRK1Q8WUW1 75 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-208ENST00000510829 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-208ENST00000510829 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-208ENST00000510829 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-208ENST00000510829 A0A1B0GVY2 172 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-208ENST00000510829 IGKV2-30P06310 120 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-208ENST00000510829 V9GYY9 64 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-208ENST00000510829 Q1T7F1 81 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-208ENST00000510829 PKD1P98161 4303 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-208ENST00000510829 A8MUN3 132 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-208ENST00000510829 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-208ENST00000510829 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-208ENST00000510829 PRR15LQ9BU68 103 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-208ENST00000510829 C9orf92A6NGG3 77 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-208ENST00000510829 HRES1P13985 223 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGEF1-208ENST00000510829 ACYP2P14621 99 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-208ENST00000510829 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-208ENST00000510829 PRO0628Q9UI54 55 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-208ENST00000510829 SACSQ9NZJ4 4579 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-208ENST00000510829 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-208ENST00000510829 PKHD1P08F94 4074 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1-208ENST00000510829 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1-208ENST00000510829 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1-208ENST00000510829 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-208ENST00000510829 Q5VSD8 79 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-208ENST00000510829 A6NED7 52 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-208ENST00000510829 Q5VV11 94 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-208ENST00000510829 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-208ENST00000510829 DMAC1Q96GE9 116 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-208ENST00000510829 FAT1Q14517 4588 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1-208ENST00000510829 Q8N1X5 172 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-208ENST00000510829 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.06□□□□□ -1.44
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RABGEF1-208ENST00000510829 Q75L30 129 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-208ENST00000510829 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-208ENST00000510829 A8MUU9 505 aa6.01□□□□□ -1.45
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RABGEF1-208ENST00000510829 APOBP04114 4563 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
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RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP10-8P60410 259 aa5.96□□□□□ -1.45
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RABGEF1-208ENST00000510829 LCA10Q71F78 164 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-208ENST00000510829 SEC61GP60059 68 aa5.92□□□□□ -1.46
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RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa5.85□□□□□ -1.47
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RABGEF1-208ENST00000510829 XP32Q5T750 250 aa5.82□□□□□ -1.48
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RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.81□□□□□ -1.48
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RABGEF1-208ENST00000510829 MT1HL1P0DM35 61 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-208ENST00000510829 RYR1P21817 5038 aa5.78□□□□□ -1.48
RABGEF1-208ENST00000510829 HSPG2P98160 4391 aa5.78□□□□□ -1.48
RABGEF1-208ENST00000510829 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa5.77□□□□□ -1.49
RABGEF1-208ENST00000510829 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-208ENST00000510829 FAT3Q8TDW7 4589 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1-208ENST00000510829 J3QL48 77 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1-208ENST00000510829 A0A1B0GU33 70 aa5.7□□□□□ -1.5
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