RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498280.1

RBM39-242, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 3

Gene RBM39, Length 444 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-242ENST00000498280 COX7BP24311 80 aa-0.77□□□□□ -2.53
RBM39-242ENST00000498280 NMSQ5H8A3 153 aa-0.77□□□□□ -2.53
RBM39-242ENST00000498280 MYO3AQ8NEV4 1616 aa-0.78□□□□□ -2.53
RBM39-242ENST00000498280 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa-0.78□□□□□ -2.53
RBM39-242ENST00000498280 NCMAPQ5T1S8 102 aa-0.78□□□□□ -2.53
RBM39-242ENST00000498280 ACBD7Q8N6N7 88 aa-0.78□□□□□ -2.53
RBM39-242ENST00000498280 MAP3K1Q13233 1512 aa-0.79□□□□□ -2.54
RBM39-242ENST00000498280 ATP10BO94823 1461 aa-0.79□□□□□ -2.54
RBM39-242ENST00000498280 TTTY10Q9BZA0 68 aa-0.79□□□□□ -2.54
RBM39-242ENST00000498280 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
RBM39-242ENST00000498280 USP32Q8NFA0 1604 aa-0.79□□□□□ -2.54
RBM39-242ENST00000498280 ATP7BP35670 1465 aa-0.8□□□□□ -2.54
RBM39-242ENST00000498280 AKAP12Q02952 1782 aa-0.8□□□□□ -2.54
RBM39-242ENST00000498280 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP-0.8□□□□□ -2.54
RBM39-242ENST00000498280 NDUFA3O95167 84 aa-0.8□□□□□ -2.54
RBM39-242ENST00000498280 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP-0.81□□□□□ -2.54
RBM39-242ENST00000498280 MAST1Q9Y2H9 1570 aa-0.81□□□□□ -2.54
RBM39-242ENST00000498280 S4R3F8 94 aa-0.81□□□□□ -2.54
RBM39-242ENST00000498280 ABCC10Q5T3U5 1492 aa-0.81□□□□□ -2.54
RBM39-242ENST00000498280 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa-0.82□□□□□ -2.54
RBM39-242ENST00000498280 PLXNC1O60486 1568 aa-0.82□□□□□ -2.54
RBM39-242ENST00000498280 SCN11AQ9UI33 1791 aa-0.82□□□□□ -2.54
RBM39-242ENST00000498280 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP-0.82□□□□□ -2.54
RBM39-242ENST00000498280 RPL38P63173 70 aaKnown RBP-0.82□□□□□ -2.54
RBM39-242ENST00000498280 CEP162Q5TB80 1403 aa-0.82□□□□□ -2.54
RBM39-242ENST00000498280 PREX2Q70Z35 1606 aa-0.82□□□□□ -2.54
RBM39-242ENST00000498280 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP-0.83□□□□□ -2.54
RBM39-242ENST00000498280 LTN1O94822 1766 aa-0.83□□□□□ -2.54
RBM39-242ENST00000498280 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa-0.83□□□□□ -2.54
RBM39-242ENST00000498280 CLASP1Q7Z460 1538 aa-0.83□□□□□ -2.54
RBM39-242ENST00000498280 PLCH1Q4KWH8 1693 aa-0.83□□□□□ -2.54
RBM39-242ENST00000498280 A0A1B0GUT8 65 aa-0.83□□□□□ -2.54
RBM39-242ENST00000498280 M0R143 59 aa-0.83□□□□□ -2.54
RBM39-242ENST00000498280 NESP48681 1621 aa-0.83□□□□□ -2.54
RBM39-242ENST00000498280 VPS8Q8N3P4 1428 aa-0.83□□□□□ -2.54
RBM39-242ENST00000498280 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
RBM39-242ENST00000498280 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa-0.84□□□□□ -2.54
RBM39-242ENST00000498280 NCOA2Q15596 1464 aa-0.84□□□□□ -2.54
RBM39-242ENST00000498280 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa-0.84□□□□□ -2.54
RBM39-242ENST00000498280 IQCF6A8MYZ5 107 aa-0.84□□□□□ -2.54
RBM39-242ENST00000498280 PLGLAQ15195 96 aa-0.84□□□□□ -2.54
RBM39-242ENST00000498280 DEFB110Q30KQ9 67 aa-0.84□□□□□ -2.54
RBM39-242ENST00000498280 WFDC9Q8NEX5 89 aa-0.84□□□□□ -2.54
RBM39-242ENST00000498280 GAFA1Q96PS6 74 aa-0.84□□□□□ -2.54
RBM39-242ENST00000498280 C20orf78Q9BR46 151 aa-0.84□□□□□ -2.54
RBM39-242ENST00000498280 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa-0.84□□□□□ -2.54
RBM39-242ENST00000498280 DOT1LQ8TEK3 1739 aa-0.84□□□□□ -2.54
RBM39-242ENST00000498280 GYPAP02724 150 aa-0.85□□□□□ -2.55
RBM39-242ENST00000498280 PRLHP81277 87 aa-0.85□□□□□ -2.55
RBM39-242ENST00000498280 NWD1Q149M9 1564 aa-0.85□□□□□ -2.55
RBM39-242ENST00000498280 WIZO95785 1651 aa-0.85□□□□□ -2.55
RBM39-242ENST00000498280 NFAT5O94916 1531 aa-0.85□□□□□ -2.55
RBM39-242ENST00000498280 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
RBM39-242ENST00000498280 SMIM11AP58511 58 aa-0.86□□□□□ -2.55
RBM39-242ENST00000498280 PEA15Q15121 130 aa-0.86□□□□□ -2.55
RBM39-242ENST00000498280 SNHG12Q9BXW3 62 aa-0.86□□□□□ -2.55
RBM39-242ENST00000498280 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
RBM39-242ENST00000498280 EEA1Q15075 1411 aa-0.87□□□□□ -2.55
RBM39-242ENST00000498280 EFCAB6Q5THR3 1501 aa-0.87□□□□□ -2.55
RBM39-242ENST00000498280 CYB5AP00167 134 aa-0.87□□□□□ -2.55
RBM39-242ENST00000498280 LY75O60449 1722 aa-0.87□□□□□ -2.55
RBM39-242ENST00000498280 ERVK-7P63135 1459 aa-0.87□□□□□ -2.55
RBM39-242ENST00000498280 DEPDC5O75140 1603 aa-0.88□□□□□ -2.55
RBM39-242ENST00000498280 ITSN1Q15811 1721 aa-0.88□□□□□ -2.55
RBM39-242ENST00000498280 TRAV21A0A0B4J279 112 aa-0.88□□□□□ -2.55
RBM39-242ENST00000498280 LINC00158P58513 81 aa-0.88□□□□□ -2.55
RBM39-242ENST00000498280 C3orf79P0CE67 100 aa-0.89□□□□□ -2.55
RBM39-242ENST00000498280 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa-0.89□□□□□ -2.55
RBM39-242ENST00000498280 CROCC2H7BZ55 1655 aa-0.9□□□□□ -2.55
RBM39-242ENST00000498280 TIAM1Q13009 1591 aa-0.9□□□□□ -2.55
RBM39-242ENST00000498280 RALGAPBQ86X10 1494 aa-0.9□□□□□ -2.55
RBM39-242ENST00000498280 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa-0.9□□□□□ -2.55
RBM39-242ENST00000498280 S100A8P05109 93 aa-0.9□□□□□ -2.55
RBM39-242ENST00000498280 PKIAP61925 76 aa-0.9□□□□□ -2.55
RBM39-242ENST00000498280 DEFB136Q30KP8 78 aa-0.9□□□□□ -2.55
RBM39-242ENST00000498280 UGGT1Q9NYU2 1555 aa-0.91□□□□□ -2.55
RBM39-242ENST00000498280 DEFB130BP0DP73 79 aa-0.91□□□□□ -2.56
RBM39-242ENST00000498280 DEFB130AP0DP74 79 aa-0.91□□□□□ -2.56
RBM39-242ENST00000498280 DEFB106AQ8N104 65 aa-0.91□□□□□ -2.56
RBM39-242ENST00000498280 DNMBPQ6XZF7 1577 aa-0.91□□□□□ -2.56
RBM39-242ENST00000498280 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa-0.92□□□□□ -2.56
RBM39-242ENST00000498280 DIP2BQ9P265 1576 aa-0.92□□□□□ -2.56
RBM39-242ENST00000498280 KIF14Q15058 1648 aa-0.93□□□□□ -2.56
RBM39-242ENST00000498280 PLIN4Q96Q06 1357 aa-0.93□□□□□ -2.56
RBM39-242ENST00000498280 KDM5DQ9BY66 1539 aa-0.93□□□□□ -2.56
RBM39-242ENST00000498280 NDUFB1O75438 58 aa-0.93□□□□□ -2.56
RBM39-242ENST00000498280 IAPPP10997 89 aa-0.93□□□□□ -2.56
RBM39-242ENST00000498280 CLPSL2Q6UWE3 100 aa-0.93□□□□□ -2.56
RBM39-242ENST00000498280 RABAC1Q9UI14 185 aa-0.93□□□□□ -2.56
RBM39-242ENST00000498280 PPLO60437 1756 aa-0.93□□□□□ -2.56
RBM39-242ENST00000498280 ABCC3O15438 1527 aa-0.94□□□□□ -2.56
RBM39-242ENST00000498280 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP-0.94□□□□□ -2.56
RBM39-242ENST00000498280 DUOX2Q9NRD8 1548 aa-0.94□□□□□ -2.56
RBM39-242ENST00000498280 NRAPQ86VF7 1730 aa-0.94□□□□□ -2.56
RBM39-242ENST00000498280 PYY3Q5JQD4 70 aa-0.94□□□□□ -2.56
RBM39-242ENST00000498280 DEFB124Q8NES8 71 aa-0.94□□□□□ -2.56
RBM39-242ENST00000498280 TRPM2O94759 1503 aa-0.94□□□□□ -2.56
RBM39-242ENST00000498280 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP-0.95□□□□□ -2.56
RBM39-242ENST00000498280 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa-0.95□□□□□ -2.56
RBM39-242ENST00000498280 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP-0.95□□□□□ -2.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 126.7 ms