RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
TOM1-216ENST00000492723 A0A1B0GVY2 172 aa9.76□□□□□ -0.85
TOM1-216ENST00000492723 RYR2Q92736 4967 aa9.75□□□□□ -0.85
TOM1-216ENST00000492723 MP68P56378 58 aa9.74□□□□□ -0.85
TOM1-216ENST00000492723 SMIM26A0A096LP01 95 aa9.74□□□□□ -0.85
TOM1-216ENST00000492723 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
TOM1-216ENST00000492723 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
TOM1-216ENST00000492723 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa9.72□□□□□ -0.85
TOM1-216ENST00000492723 PRO0628Q9UI54 55 aa9.72□□□□□ -0.85
TOM1-216ENST00000492723 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
TOM1-216ENST00000492723 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
TOM1-216ENST00000492723 H0Y9P7 68 aa9.71□□□□□ -0.86
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TOM1-216ENST00000492723 LINC00208Q96KT6 92 aa9.7□□□□□ -0.86
TOM1-216ENST00000492723 NDUFS5O43920 106 aa9.67□□□□□ -0.86
TOM1-216ENST00000492723 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
TOM1-216ENST00000492723 TYMSOSQ8TAI1 123 aa9.66□□□□□ -0.86
TOM1-216ENST00000492723 TRAV22A0A0B4J277 110 aa9.65□□□□□ -0.86
TOM1-216ENST00000492723 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa9.65□□□□□ -0.86
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TOM1-216ENST00000492723 H3BPC8 53 aa9.64□□□□□ -0.87
TOM1-216ENST00000492723 C1orf195Q5TG92 126 aa9.64□□□□□ -0.87
TOM1-216ENST00000492723 C4orf48Q5BLP8 95 aa9.63□□□□□ -0.87
TOM1-216ENST00000492723 C1orf64Q8NEQ6 169 aa9.62□□□□□ -0.87
TOM1-216ENST00000492723 BRK1Q8WUW1 75 aa9.62□□□□□ -0.87
TOM1-216ENST00000492723 LIMD2Q9BT23 127 aa9.62□□□□□ -0.87
TOM1-216ENST00000492723 FAT1Q14517 4588 aa9.61□□□□□ -0.87
TOM1-216ENST00000492723 PRR26Q8N8Z3 221 aa9.6□□□□□ -0.87
TOM1-216ENST00000492723 C8orf87E5RJ46 101 aa9.58□□□□□ -0.88
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TOM1-216ENST00000492723 PRR4Q16378 134 aa9.56□□□□□ -0.88
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TOM1-216ENST00000492723 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
TOM1-216ENST00000492723 LINC00304Q8N9R0 145 aa9.53□□□□□ -0.88
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TOM1-216ENST00000492723 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa9.48□□□□□ -0.89
TOM1-216ENST00000492723 PCOTHQ58A44 107 aa9.48□□□□□ -0.89
TOM1-216ENST00000492723 Q5W150 140 aa9.48□□□□□ -0.89
TOM1-216ENST00000492723 SPAG11AQ6PDA7 123 aa9.47□□□□□ -0.89
TOM1-216ENST00000492723 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa9.47□□□□□ -0.89
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TOM1-216ENST00000492723 V9GYY9 64 aa9.42□□□□□ -0.9
TOM1-216ENST00000492723 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa9.4□□□□□ -0.9
TOM1-216ENST00000492723 RETNLBQ9BQ08 111 aa9.4□□□□□ -0.9
TOM1-216ENST00000492723 FAM229AH3BQW9 127 aa9.39□□□□□ -0.91
TOM1-216ENST00000492723 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa9.39□□□□□ -0.91
TOM1-216ENST00000492723 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa9.39□□□□□ -0.91
TOM1-216ENST00000492723 Q1T7F1 81 aa9.36□□□□□ -0.91
TOM1-216ENST00000492723 PSPHP1O15172 72 aa9.34□□□□□ -0.91
TOM1-216ENST00000492723 HSPG2P98160 4391 aa9.33□□□□□ -0.92
TOM1-216ENST00000492723 Q5VSD8 79 aa9.32□□□□□ -0.92
TOM1-216ENST00000492723 RYR1P21817 5038 aa9.26□□□□□ -0.93
TOM1-216ENST00000492723 COA5Q86WW8 74 aa9.26□□□□□ -0.93
TOM1-216ENST00000492723 IGKV2-30P06310 120 aa9.25□□□□□ -0.93
TOM1-216ENST00000492723 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
TOM1-216ENST00000492723 C9orf92A6NGG3 77 aa9.24□□□□□ -0.93
TOM1-216ENST00000492723 A8MUN3 132 aa9.22□□□□□ -0.93
TOM1-216ENST00000492723 HRES1P13985 223 aa9.22□□□□□ -0.93
TOM1-216ENST00000492723 Q8N1X5 172 aa9.21□□□□□ -0.93
TOM1-216ENST00000492723 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa9.21□□□□□ -0.94
TOM1-216ENST00000492723 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
TOM1-216ENST00000492723 PMAIP1Q13794 54 aa9.19□□□□□ -0.94
TOM1-216ENST00000492723 TNXBP22105 4242 aa9.19□□□□□ -0.94
TOM1-216ENST00000492723 A8MU10 97 aa9.18□□□□□ -0.94
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP10-8P60410 259 aa9.18□□□□□ -0.94
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa9.18□□□□□ -0.94
TOM1-216ENST00000492723 KIAA1109Q2LD37 5005 aa9.17□□□□□ -0.94
TOM1-216ENST00000492723 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa9.13□□□□□ -0.95
TOM1-216ENST00000492723 FAT3Q8TDW7 4589 aa9.12□□□□□ -0.95
TOM1-216ENST00000492723 A8MUU9 505 aa9.12□□□□□ -0.95
TOM1-216ENST00000492723 Q5VV11 94 aa9.12□□□□□ -0.95
TOM1-216ENST00000492723 ACYP2P14621 99 aa9.11□□□□□ -0.95
TOM1-216ENST00000492723 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
TOM1-216ENST00000492723 DMAC1Q96GE9 116 aa9.11□□□□□ -0.95
TOM1-216ENST00000492723 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa9.09□□□□□ -0.95
TOM1-216ENST00000492723 C7orf65Q6ZTY9 151 aa9.09□□□□□ -0.95
TOM1-216ENST00000492723 PRR15LQ9BU68 103 aa9.06□□□□□ -0.96
TOM1-216ENST00000492723 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
TOM1-216ENST00000492723 MYCBP2O75592 4640 aa9.05□□□□□ -0.96
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TOM1-216ENST00000492723 Q75L30 129 aa8.99□□□□□ -0.97
TOM1-216ENST00000492723 MT1HL1P0DM35 61 aa8.99□□□□□ -0.97
TOM1-216ENST00000492723 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa8.96□□□□□ -0.97
TOM1-216ENST00000492723 A6NED7 52 aa8.95□□□□□ -0.98
TOM1-216ENST00000492723 LCA10Q71F78 164 aa8.95□□□□□ -0.98
TOM1-216ENST00000492723 SPINK7P58062 85 aa8.93□□□□□ -0.98
TOM1-216ENST00000492723 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa8.88□□□□□ -0.99
TOM1-216ENST00000492723 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa8.87□□□□□ -0.99
TOM1-216ENST00000492723 XP32Q5T750 250 aa8.86□□□□□ -0.99
TOM1-216ENST00000492723 RPL37P61927 97 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa8.84□□□□□ -0.99
TOM1-216ENST00000492723 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa8.82□□□□□ -1
TOM1-216ENST00000492723 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa8.82□□□□□ -1
TOM1-216ENST00000492723 A6NN06 94 aa8.81□□□□□ -1
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa8.79□□□□□ -1
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