RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453030.5

GARNL3-210, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 536 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-210ENST00000453030 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.97□□□□□ -1.45
GARNL3-210ENST00000453030 PPDPFLQ8WWR9 84 aa5.96□□□□□ -1.46
GARNL3-210ENST00000453030 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa5.96□□□□□ -1.46
GARNL3-210ENST00000453030 SS18L2Q9UHA2 77 aa5.96□□□□□ -1.46
GARNL3-210ENST00000453030 F8W1H4 67 aa5.95□□□□□ -1.46
GARNL3-210ENST00000453030 ANKRD29Q8N6D5 301 aa5.95□□□□□ -1.46
GARNL3-210ENST00000453030 A8MUU9 505 aa5.94□□□□□ -1.46
GARNL3-210ENST00000453030 H3BT86 120 aa5.94□□□□□ -1.46
GARNL3-210ENST00000453030 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa5.94□□□□□ -1.46
GARNL3-210ENST00000453030 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
GARNL3-210ENST00000453030 H3BS24 57 aa5.93□□□□□ -1.46
GARNL3-210ENST00000453030 A0A087WSZ3 146 aa5.92□□□□□ -1.46
GARNL3-210ENST00000453030 DSCR10P59022 87 aa5.92□□□□□ -1.46
GARNL3-210ENST00000453030 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
GARNL3-210ENST00000453030 ETDBQ3ZM63 59 aa5.91□□□□□ -1.46
GARNL3-210ENST00000453030 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa5.9□□□□□ -1.46
GARNL3-210ENST00000453030 H3BQ85 93 aa5.9□□□□□ -1.46
GARNL3-210ENST00000453030 FAM236CP0DP71 79 aa5.9□□□□□ -1.46
GARNL3-210ENST00000453030 TEN1Q86WV5 123 aa5.9□□□□□ -1.46
GARNL3-210ENST00000453030 SIGMAR1Q99720 223 aa5.9□□□□□ -1.46
GARNL3-210ENST00000453030 MT2AP02795 61 aa5.88□□□□□ -1.47
GARNL3-210ENST00000453030 C14orf132Q9NPU4 83 aa5.87□□□□□ -1.47
GARNL3-210ENST00000453030 RBM3P98179 157 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
GARNL3-210ENST00000453030 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa5.85□□□□□ -1.47
GARNL3-210ENST00000453030 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa5.85□□□□□ -1.47
GARNL3-210ENST00000453030 MT1FP04733 61 aa5.85□□□□□ -1.47
GARNL3-210ENST00000453030 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5.84□□□□□ -1.47
GARNL3-210ENST00000453030 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.83□□□□□ -1.48
GARNL3-210ENST00000453030 DSCR8Q96T75 97 aa5.83□□□□□ -1.48
GARNL3-210ENST00000453030 VPS25Q9BRG1 176 aa5.83□□□□□ -1.48
GARNL3-210ENST00000453030 A0A1W2PNM2 257 aa5.82□□□□□ -1.48
GARNL3-210ENST00000453030 IGKV4-1P06312 121 aa5.82□□□□□ -1.48
GARNL3-210ENST00000453030 LINC00313P59037 77 aa5.82□□□□□ -1.48
GARNL3-210ENST00000453030 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa5.82□□□□□ -1.48
GARNL3-210ENST00000453030 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa5.82□□□□□ -1.48
GARNL3-210ENST00000453030 HRES1P13985 223 aa5.81□□□□□ -1.48
GARNL3-210ENST00000453030 KRTAP10-10P60014 251 aa5.81□□□□□ -1.48
GARNL3-210ENST00000453030 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa5.8□□□□□ -1.48
GARNL3-210ENST00000453030 Q6ZQT0 140 aa5.8□□□□□ -1.48
GARNL3-210ENST00000453030 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa5.79□□□□□ -1.48
GARNL3-210ENST00000453030 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa5.79□□□□□ -1.48
GARNL3-210ENST00000453030 MPLKIPQ8TAP9 179 aa5.79□□□□□ -1.48
GARNL3-210ENST00000453030 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.79□□□□□ -1.48
GARNL3-210ENST00000453030 CCKP06307 115 aa5.78□□□□□ -1.48
GARNL3-210ENST00000453030 DEFB116Q30KQ4 102 aa5.78□□□□□ -1.48
GARNL3-210ENST00000453030 LCE3BQ5TA77 95 aa5.78□□□□□ -1.48
GARNL3-210ENST00000453030 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa5.76□□□□□ -1.49
GARNL3-210ENST00000453030 PDE6GP18545 87 aa5.76□□□□□ -1.49
GARNL3-210ENST00000453030 J3QR89 54 aa5.74□□□□□ -1.49
GARNL3-210ENST00000453030 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.74□□□□□ -1.49
GARNL3-210ENST00000453030 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.74□□□□□ -1.49
GARNL3-210ENST00000453030 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
GARNL3-210ENST00000453030 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
GARNL3-210ENST00000453030 K7ERU9 68 aa5.72□□□□□ -1.49
GARNL3-210ENST00000453030 LINC00472Q9H8W2 130 aa5.72□□□□□ -1.49
GARNL3-210ENST00000453030 LINC00846Q9NV44 126 aa5.71□□□□□ -1.5
GARNL3-210ENST00000453030 A0A1B0GVX0 72 aa5.68□□□□□ -1.5
GARNL3-210ENST00000453030 C8orf87E5RJ46 101 aa5.68□□□□□ -1.5
GARNL3-210ENST00000453030 ACYP1P07311 99 aa5.68□□□□□ -1.5
GARNL3-210ENST00000453030 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa5.67□□□□□ -1.5
GARNL3-210ENST00000453030 NREPQ16612 68 aa5.67□□□□□ -1.5
GARNL3-210ENST00000453030 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
GARNL3-210ENST00000453030 SPINK7P58062 85 aa5.66□□□□□ -1.5
GARNL3-210ENST00000453030 Q6ZVQ6 151 aa5.66□□□□□ -1.5
GARNL3-210ENST00000453030 UBL5Q9BZL1 73 aa5.66□□□□□ -1.5
GARNL3-210ENST00000453030 A0A1B0GW54 56 aa5.64□□□□□ -1.51
GARNL3-210ENST00000453030 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.64□□□□□ -1.51
GARNL3-210ENST00000453030 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.63□□□□□ -1.51
GARNL3-210ENST00000453030 WFDC13Q8IUB5 93 aa5.63□□□□□ -1.51
GARNL3-210ENST00000453030 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa5.62□□□□□ -1.51
GARNL3-210ENST00000453030 A8MWP4 228 aa5.61□□□□□ -1.51
GARNL3-210ENST00000453030 BPY2O14599 106 aa5.6□□□□□ -1.51
GARNL3-210ENST00000453030 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
GARNL3-210ENST00000453030 J3KT08 172 aa5.59□□□□□ -1.51
GARNL3-210ENST00000453030 LINC00643Q86TS7 51 aa5.59□□□□□ -1.51
GARNL3-210ENST00000453030 MT-ATP8P03928 68 aa5.57□□□□□ -1.52
GARNL3-210ENST00000453030 Q8N9L7 120 aa5.57□□□□□ -1.52
GARNL3-210ENST00000453030 NDUFB1O75438 58 aa5.56□□□□□ -1.52
GARNL3-210ENST00000453030 C8orf17Q9NRJ1 99 aa5.55□□□□□ -1.52
GARNL3-210ENST00000453030 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
GARNL3-210ENST00000453030 CXCL6P80162 114 aa5.54□□□□□ -1.52
GARNL3-210ENST00000453030 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa5.54□□□□□ -1.52
GARNL3-210ENST00000453030 K7EQZ3 153 aa5.53□□□□□ -1.52
GARNL3-210ENST00000453030 A0A087WVE0 104 aa5.5□□□□□ -1.53
GARNL3-210ENST00000453030 PRR15Q8IV56 129 aa5.5□□□□□ -1.53
GARNL3-210ENST00000453030 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.49□□□□□ -1.53
GARNL3-210ENST00000453030 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa5.47□□□□□ -1.53
GARNL3-210ENST00000453030 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa5.45□□□□□ -1.54
GARNL3-210ENST00000453030 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.44□□□□□ -1.54
GARNL3-210ENST00000453030 HCG22E2RYF7 251 aa5.44□□□□□ -1.54
GARNL3-210ENST00000453030 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
GARNL3-210ENST00000453030 IMUPQ9GZP8 106 aa5.44□□□□□ -1.54
GARNL3-210ENST00000453030 NDUFS5O43920 106 aa5.43□□□□□ -1.54
GARNL3-210ENST00000453030 CASC2Q6XLA1 102 aa5.43□□□□□ -1.54
GARNL3-210ENST00000453030 TMEM254Q8TBM7 123 aa5.43□□□□□ -1.54
GARNL3-210ENST00000453030 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.43□□□□□ -1.54
GARNL3-210ENST00000453030 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa5.42□□□□□ -1.54
GARNL3-210ENST00000453030 hDV103S1A0JD37 113 aa5.42□□□□□ -1.54
GARNL3-210ENST00000453030 IGKV2-30P06310 120 aa5.42□□□□□ -1.54
GARNL3-210ENST00000453030 LCE1DQ5T752 114 aa5.42□□□□□ -1.54
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