RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa5.48□□□□□ -1.53
HDLBP-211ENST00000425989 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa5.48□□□□□ -1.53
HDLBP-211ENST00000425989 HCG22E2RYF7 251 aa5.48□□□□□ -1.53
HDLBP-211ENST00000425989 A0A087WVE0 104 aa5.47□□□□□ -1.53
HDLBP-211ENST00000425989 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
HDLBP-211ENST00000425989 Q8N9L7 120 aa5.46□□□□□ -1.54
HDLBP-211ENST00000425989 LINC00313P59037 77 aa5.45□□□□□ -1.54
HDLBP-211ENST00000425989 CASC2Q6XLA1 102 aa5.45□□□□□ -1.54
HDLBP-211ENST00000425989 C8orf17Q9NRJ1 99 aa5.45□□□□□ -1.54
HDLBP-211ENST00000425989 ABCA13Q86UQ4 5058 aa5.45□□□□□ -1.54
HDLBP-211ENST00000425989 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa5.44□□□□□ -1.54
HDLBP-211ENST00000425989 hDV103S1A0JD37 113 aa5.44□□□□□ -1.54
HDLBP-211ENST00000425989 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
HDLBP-211ENST00000425989 ANAPC13Q9BS18 74 aa5.44□□□□□ -1.54
HDLBP-211ENST00000425989 TRAV7A0A075B6U4 112 aa5.43□□□□□ -1.54
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM254Q8TBM7 123 aa5.43□□□□□ -1.54
HDLBP-211ENST00000425989 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa5.43□□□□□ -1.54
HDLBP-211ENST00000425989 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa5.42□□□□□ -1.54
HDLBP-211ENST00000425989 MT1HL1P0DM35 61 aa5.42□□□□□ -1.54
HDLBP-211ENST00000425989 SERP2Q8N6R1 65 aa5.42□□□□□ -1.54
HDLBP-211ENST00000425989 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
HDLBP-211ENST00000425989 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
HDLBP-211ENST00000425989 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
HDLBP-211ENST00000425989 UQCRQO14949 82 aa5.39□□□□□ -1.55
HDLBP-211ENST00000425989 PCP4P48539 62 aa5.39□□□□□ -1.55
HDLBP-211ENST00000425989 C5orf47Q569G3 176 aa5.39□□□□□ -1.55
HDLBP-211ENST00000425989 WFDC13Q8IUB5 93 aa5.39□□□□□ -1.55
HDLBP-211ENST00000425989 COX7CP15954 63 aa5.38□□□□□ -1.55
HDLBP-211ENST00000425989 OCR1Q9BZK8 76 aa5.38□□□□□ -1.55
HDLBP-211ENST00000425989 FAT3Q8TDW7 4589 aa5.38□□□□□ -1.55
HDLBP-211ENST00000425989 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
HDLBP-211ENST00000425989 H3BPC8 53 aa5.36□□□□□ -1.55
HDLBP-211ENST00000425989 TNXBP22105 4242 aa5.35□□□□□ -1.55
HDLBP-211ENST00000425989 J3QL48 77 aa5.35□□□□□ -1.55
HDLBP-211ENST00000425989 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
HDLBP-211ENST00000425989 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa5.34□□□□□ -1.55
HDLBP-211ENST00000425989 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa5.33□□□□□ -1.56
HDLBP-211ENST00000425989 NDUFS5O43920 106 aa5.33□□□□□ -1.56
HDLBP-211ENST00000425989 MP68P56378 58 aa5.33□□□□□ -1.56
HDLBP-211ENST00000425989 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa5.32□□□□□ -1.56
HDLBP-211ENST00000425989 HERC1Q15751 4861 aa5.32□□□□□ -1.56
HDLBP-211ENST00000425989 LCE2BO14633 110 aa5.3□□□□□ -1.56
HDLBP-211ENST00000425989 RETNLBQ9BQ08 111 aa5.3□□□□□ -1.56
HDLBP-211ENST00000425989 TRAV22A0A0B4J277 110 aa5.29□□□□□ -1.56
HDLBP-211ENST00000425989 NDUFC1O43677 76 aa5.29□□□□□ -1.56
HDLBP-211ENST00000425989 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa5.29□□□□□ -1.56
HDLBP-211ENST00000425989 A8MUU9 505 aa5.28□□□□□ -1.56
HDLBP-211ENST00000425989 KLKP1Q107X0 134 aa5.28□□□□□ -1.56
HDLBP-211ENST00000425989 PRR4Q16378 134 aa5.27□□□□□ -1.57
HDLBP-211ENST00000425989 Q75L30 129 aa5.27□□□□□ -1.57
HDLBP-211ENST00000425989 H0Y9P7 68 aa5.26□□□□□ -1.57
HDLBP-211ENST00000425989 TPRXLQ17RH7 258 aa5.26□□□□□ -1.57
HDLBP-211ENST00000425989 C20orf197Q8N268 126 aa5.26□□□□□ -1.57
HDLBP-211ENST00000425989 A0A0U1RQV1 116 aa5.25□□□□□ -1.57
HDLBP-211ENST00000425989 C9orf92A6NGG3 77 aa5.25□□□□□ -1.57
HDLBP-211ENST00000425989 CCDC179H3BU77 68 aa5.25□□□□□ -1.57
HDLBP-211ENST00000425989 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa5.25□□□□□ -1.57
HDLBP-211ENST00000425989 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa5.24□□□□□ -1.57
HDLBP-211ENST00000425989 MYCBP2O75592 4640 aa5.24□□□□□ -1.57
HDLBP-211ENST00000425989 UBR4Q5T4S7 5183 aa5.23□□□□□ -1.57
HDLBP-211ENST00000425989 C1orf64Q8NEQ6 169 aa5.23□□□□□ -1.57
HDLBP-211ENST00000425989 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
HDLBP-211ENST00000425989 LINC00208Q96KT6 92 aa5.23□□□□□ -1.57
HDLBP-211ENST00000425989 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa5.22□□□□□ -1.57
HDLBP-211ENST00000425989 Q5W150 140 aa5.21□□□□□ -1.58
HDLBP-211ENST00000425989 RPL37P61927 97 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
HDLBP-211ENST00000425989 XP32Q5T750 250 aa5.19□□□□□ -1.58
HDLBP-211ENST00000425989 SNURFQ9Y675 71 aa5.18□□□□□ -1.58
HDLBP-211ENST00000425989 IGKV2-30P06310 120 aa5.17□□□□□ -1.58
HDLBP-211ENST00000425989 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa5.17□□□□□ -1.58
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM258P61165 79 aa5.16□□□□□ -1.58
HDLBP-211ENST00000425989 H7BZZ5 65 aa5.15□□□□□ -1.59
HDLBP-211ENST00000425989 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
HDLBP-211ENST00000425989 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa5.15□□□□□ -1.59
HDLBP-211ENST00000425989 C7orf65Q6ZTY9 151 aa5.14□□□□□ -1.59
HDLBP-211ENST00000425989 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
HDLBP-211ENST00000425989 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa5.1□□□□□ -1.59
HDLBP-211ENST00000425989 SPINK7P58062 85 aa5.09□□□□□ -1.59
HDLBP-211ENST00000425989 CYSTM1Q9H1C7 97 aa5.09□□□□□ -1.59
HDLBP-211ENST00000425989 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa5.07□□□□□ -1.6
HDLBP-211ENST00000425989 FAM236CP0DP71 79 aa5.07□□□□□ -1.6
HDLBP-211ENST00000425989 PCOTHQ58A44 107 aa5.07□□□□□ -1.6
HDLBP-211ENST00000425989 HRES1P13985 223 aa5.05□□□□□ -1.6
HDLBP-211ENST00000425989 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
HDLBP-211ENST00000425989 A8MUN3 132 aa5.04□□□□□ -1.6
HDLBP-211ENST00000425989 ACYP2P14621 99 aa5.04□□□□□ -1.6
HDLBP-211ENST00000425989 SERP1Q9Y6X1 66 aa5.01□□□□□ -1.61
HDLBP-211ENST00000425989 DMAC1Q96GE9 116 aa4.99□□□□□ -1.61
HDLBP-211ENST00000425989 COX6B2Q6YFQ2 88 aa4.98□□□□□ -1.61
HDLBP-211ENST00000425989 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa4.98□□□□□ -1.61
HDLBP-211ENST00000425989 HMCN2Q8NDA2 5059 aa4.98□□□□□ -1.61
HDLBP-211ENST00000425989 LRP2P98164 4655 aa4.98□□□□□ -1.61
HDLBP-211ENST00000425989 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
HDLBP-211ENST00000425989 C4orf26Q17RF5 130 aa4.96□□□□□ -1.62
HDLBP-211ENST00000425989 LCE2CQ5TA81 110 aa4.96□□□□□ -1.62
HDLBP-211ENST00000425989 LPAP08519 4548 aa4.94□□□□□ -1.62
HDLBP-211ENST00000425989 SPTSSBQ8NFR3 76 aa4.92□□□□□ -1.62
HDLBP-211ENST00000425989 MPLKIPQ8TAP9 179 aa4.92□□□□□ -1.62
HDLBP-211ENST00000425989 COA5Q86WW8 74 aa4.91□□□□□ -1.62
HDLBP-211ENST00000425989 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa4.9□□□□□ -1.63
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