RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424089.5

POLR1A-204, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-204ENST00000424089 MOBPQ13875 183 aa5.98□□□□□ -1.45
POLR1A-204ENST00000424089 FAM229BQ4G0N7 80 aa5.96□□□□□ -1.46
POLR1A-204ENST00000424089 C5orf47Q569G3 176 aa5.95□□□□□ -1.46
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM254Q8TBM7 123 aa5.95□□□□□ -1.46
POLR1A-204ENST00000424089 DNAH8Q96JB1 4490 aa5.94□□□□□ -1.46
POLR1A-204ENST00000424089 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
POLR1A-204ENST00000424089 DEFB116Q30KQ4 102 aa5.94□□□□□ -1.46
POLR1A-204ENST00000424089 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
POLR1A-204ENST00000424089 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
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POLR1A-204ENST00000424089 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa5.92□□□□□ -1.46
POLR1A-204ENST00000424089 CASC2Q6XLA1 102 aa5.92□□□□□ -1.46
POLR1A-204ENST00000424089 Q96NJ1 140 aa5.92□□□□□ -1.46
POLR1A-204ENST00000424089 CYSTM1Q9H1C7 97 aa5.92□□□□□ -1.46
POLR1A-204ENST00000424089 ANAPC11Q9NYG5 84 aa5.92□□□□□ -1.46
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POLR1A-204ENST00000424089 Q5XG85 94 aa5.9□□□□□ -1.46
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POLR1A-204ENST00000424089 FAM236CP0DP71 79 aa5.88□□□□□ -1.47
POLR1A-204ENST00000424089 MP68P56378 58 aa5.88□□□□□ -1.47
POLR1A-204ENST00000424089 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa5.88□□□□□ -1.47
POLR1A-204ENST00000424089 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa5.87□□□□□ -1.47
POLR1A-204ENST00000424089 hDV103S1A0JD37 113 aa5.87□□□□□ -1.47
POLR1A-204ENST00000424089 SPINK6Q6UWN8 80 aa5.87□□□□□ -1.47
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POLR1A-204ENST00000424089 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa5.87□□□□□ -1.47
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POLR1A-204ENST00000424089 LRP2P98164 4655 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR1A-204ENST00000424089 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa5.84□□□□□ -1.47
POLR1A-204ENST00000424089 MT1HL1P0DM35 61 aa5.84□□□□□ -1.47
POLR1A-204ENST00000424089 LIMD2Q9BT23 127 aa5.84□□□□□ -1.47
POLR1A-204ENST00000424089 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.83□□□□□ -1.48
POLR1A-204ENST00000424089 C8orf87E5RJ46 101 aa5.83□□□□□ -1.48
POLR1A-204ENST00000424089 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa5.83□□□□□ -1.48
POLR1A-204ENST00000424089 A0A087X002 238 aa5.82□□□□□ -1.48
POLR1A-204ENST00000424089 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa5.82□□□□□ -1.48
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POLR1A-204ENST00000424089 C4orf48Q5BLP8 95 aa5.81□□□□□ -1.48
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POLR1A-204ENST00000424089 SPAG11AQ6PDA7 123 aa5.79□□□□□ -1.48
POLR1A-204ENST00000424089 TYMSOSQ8TAI1 123 aa5.79□□□□□ -1.48
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POLR1A-204ENST00000424089 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa5.75□□□□□ -1.49
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POLR1A-204ENST00000424089 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa5.72□□□□□ -1.49
POLR1A-204ENST00000424089 LINC00304Q8N9R0 145 aa5.72□□□□□ -1.49
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POLR1A-204ENST00000424089 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
POLR1A-204ENST00000424089 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa5.69□□□□□ -1.5
POLR1A-204ENST00000424089 PRR26Q8N8Z3 221 aa5.69□□□□□ -1.5
POLR1A-204ENST00000424089 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa5.66□□□□□ -1.5
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POLR1A-204ENST00000424089 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa5.65□□□□□ -1.5
POLR1A-204ENST00000424089 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa5.64□□□□□ -1.51
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POLR1A-204ENST00000424089 Q5W150 140 aa5.61□□□□□ -1.51
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POLR1A-204ENST00000424089 PCOTHQ58A44 107 aa5.59□□□□□ -1.51
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POLR1A-204ENST00000424089 IGKV2-30P06310 120 aa5.56□□□□□ -1.52
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POLR1A-204ENST00000424089 C4orf26Q17RF5 130 aa5.53□□□□□ -1.52
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POLR1A-204ENST00000424089 A8MUU9 505 aa5.51□□□□□ -1.53
POLR1A-204ENST00000424089 ACYP2P14621 99 aa5.51□□□□□ -1.53
POLR1A-204ENST00000424089 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
POLR1A-204ENST00000424089 HRES1P13985 223 aa5.5□□□□□ -1.53
POLR1A-204ENST00000424089 MPLKIPQ8TAP9 179 aa5.49□□□□□ -1.53
POLR1A-204ENST00000424089 DMAC1Q96GE9 116 aa5.49□□□□□ -1.53
POLR1A-204ENST00000424089 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.48□□□□□ -1.53
POLR1A-204ENST00000424089 C7orf65Q6ZTY9 151 aa5.47□□□□□ -1.53
POLR1A-204ENST00000424089 RETNLBQ9BQ08 111 aa5.47□□□□□ -1.53
POLR1A-204ENST00000424089 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa5.45□□□□□ -1.54
POLR1A-204ENST00000424089 Q75L30 129 aa5.45□□□□□ -1.54
POLR1A-204ENST00000424089 C9orf92A6NGG3 77 aa5.44□□□□□ -1.54
POLR1A-204ENST00000424089 A8MUN3 132 aa5.43□□□□□ -1.54
POLR1A-204ENST00000424089 FSIP2Q5CZC0 6907 aa5.41□□□□□ -1.54
POLR1A-204ENST00000424089 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa5.4□□□□□ -1.54
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