RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362858.1

RNU6-655P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 655, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-655P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-655P-201ENST00000362858 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-655P-201ENST00000362858 WT1-ASQ06250 92 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-655P-201ENST00000362858 LAMA1P25391 3075 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-655P-201ENST00000362858 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-655P-201ENST00000362858 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-655P-201ENST00000362858 RPS27P42677 84 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-655P-201ENST00000362858 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-655P-201ENST00000362858 ACACAQ13085 2346 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-655P-201ENST00000362858 SACSQ9NZJ4 4579 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-655P-201ENST00000362858 CEP290O15078 2479 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-655P-201ENST00000362858 DIP2AQ14689 1571 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-655P-201ENST00000362858 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-655P-201ENST00000362858 DNHD1Q96M86 4753 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-655P-201ENST00000362858 DEFB110Q30KQ9 67 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-655P-201ENST00000362858 FAM186AA6NE01 2351 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-655P-201ENST00000362858 MYO18BQ8IUG5 2567 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-655P-201ENST00000362858 ATXN8Q156A1 80 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-655P-201ENST00000362858 MINOS1Q5TGZ0 78 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-655P-201ENST00000362858 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-655P-201ENST00000362858 DNAH1Q9P2D7 4330 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-655P-201ENST00000362858 LRRK2Q5S007 2527 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-655P-201ENST00000362858 DEFB114Q30KQ6 69 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-655P-201ENST00000362858 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-655P-201ENST00000362858 MGAM2Q2M2H8 2515 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-655P-201ENST00000362858 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-655P-201ENST00000362858 HILPDAQ9Y5L2 63 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-655P-201ENST00000362858 ITSN2Q9NZM3 1697 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-655P-201ENST00000362858 DNAH2Q9P225 4427 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-655P-201ENST00000362858 BIRC6Q9NR09 4857 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-655P-201ENST00000362858 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-655P-201ENST00000362858 KALRNO60229 2985 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-655P-201ENST00000362858 TRIOO75962 3097 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-655P-201ENST00000362858 NRAPQ86VF7 1730 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-655P-201ENST00000362858 NBEAQ8NFP9 2946 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-655P-201ENST00000362858 ACACBO00763 2458 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-655P-201ENST00000362858 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-655P-201ENST00000362858 SMCO4Q9NRQ5 59 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-655P-201ENST00000362858 C6orf48Q9UBA6 75 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-655P-201ENST00000362858 NHSQ6T4R5 1651 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-655P-201ENST00000362858 DNAH8Q96JB1 4490 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-655P-201ENST00000362858 ITPR3Q14573 2671 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-655P-201ENST00000362858 CCDC168Q8NDH2 2452 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-655P-201ENST00000362858 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-655P-201ENST00000362858 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-655P-201ENST00000362858 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-655P-201ENST00000362858 ABCC6O95255 1503 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-655P-201ENST00000362858 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-655P-201ENST00000362858 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-655P-201ENST00000362858 BPTFQ12830 3046 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-655P-201ENST00000362858 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-655P-201ENST00000362858 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-655P-201ENST00000362858 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-655P-201ENST00000362858 KIF1AQ12756 1690 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-655P-201ENST00000362858 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-655P-201ENST00000362858 DUOX2Q9NRD8 1548 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-655P-201ENST00000362858 UGGT2Q9NYU1 1516 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-655P-201ENST00000362858 PDCD5O14737 125 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-655P-201ENST00000362858 MYO5CQ9NQX4 1742 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-655P-201ENST00000362858 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-655P-201ENST00000362858 H3BUA1 57 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-655P-201ENST00000362858 FCER1GP30273 86 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-655P-201ENST00000362858 MT1HP80294 61 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-655P-201ENST00000362858 GNG13Q9P2W3 67 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-655P-201ENST00000362858 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-655P-201ENST00000362858 IQGAP3Q86VI3 1631 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-655P-201ENST00000362858 DNMBPQ6XZF7 1577 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-655P-201ENST00000362858 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-655P-201ENST00000362858 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-655P-201ENST00000362858 SFTA3P0C7M3 94 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-655P-201ENST00000362858 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-655P-201ENST00000362858 RELNP78509 3460 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-655P-201ENST00000362858 SCRIBQ14160 1630 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-655P-201ENST00000362858 TNP1P09430 55 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-655P-201ENST00000362858 C3P01024 1663 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-655P-201ENST00000362858 ABCA9Q8IUA7 1624 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-655P-201ENST00000362858 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-655P-201ENST00000362858 DEFB1P60022 68 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-655P-201ENST00000362858 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-655P-201ENST00000362858 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-655P-201ENST00000362858 LINC01549A6NIU2 74 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-655P-201ENST00000362858 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-655P-201ENST00000362858 CLASP1Q7Z460 1538 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-655P-201ENST00000362858 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-655P-201ENST00000362858 CMYA5Q8N3K9 4069 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-655P-201ENST00000362858 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-655P-201ENST00000362858 A0A0C4DFX4 3053 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-655P-201ENST00000362858 LAMA3Q16787 3333 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-655P-201ENST00000362858 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-655P-201ENST00000362858 K7EMI3 77 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-655P-201ENST00000362858 CLPSL2Q6UWE3 100 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-655P-201ENST00000362858 COL12A1Q99715 3063 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-655P-201ENST00000362858 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-655P-201ENST00000362858 MROH1Q8NDA8 1641 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-655P-201ENST00000362858 LY75O60449 1722 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-655P-201ENST00000362858 TLN2Q9Y4G6 2542 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-655P-201ENST00000362858 TIAM1Q13009 1591 aa-0.91□□□□□ -2.55
RNU6-655P-201ENST00000362858 M0R1W7 72 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-655P-201ENST00000362858 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-655P-201ENST00000362858 MAST1Q9Y2H9 1570 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-655P-201ENST00000362858 DNAH7Q8WXX0 4024 aa-0.92□□□□□ -2.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.3 ms