RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336128.11

ZNF548-201, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ZNF548, Length 2,115 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-201ENST00000336128 C1orf195Q5TG92 126 aa7.15□□□□□ -1.26
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ZNF548-201ENST00000336128 C5orf47Q569G3 176 aa7.13□□□□□ -1.27
ZNF548-201ENST00000336128 FAT1Q14517 4588 aa7.13□□□□□ -1.27
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ZNF548-201ENST00000336128 FAM229AH3BQW9 127 aa7.11□□□□□ -1.27
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ZNF548-201ENST00000336128 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa7.07□□□□□ -1.28
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ZNF548-201ENST00000336128 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.94□□□□□ -1.3
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ZNF548-201ENST00000336128 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.89□□□□□ -1.31
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ZNF548-201ENST00000336128 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.76□□□□□ -1.33
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ZNF548-201ENST00000336128 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.71□□□□□ -1.34
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ZNF548-201ENST00000336128 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.65□□□□□ -1.34
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ZNF548-201ENST00000336128 TPRXLQ17RH7 258 aa6.55□□□□□ -1.36
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ZNF548-201ENST00000336128 A8MUN3 132 aa6.53□□□□□ -1.36
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ZNF548-201ENST00000336128 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.48□□□□□ -1.37
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ZNF548-201ENST00000336128 PRR15LQ9BU68 103 aa6.47□□□□□ -1.37
ZNF548-201ENST00000336128 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.46□□□□□ -1.37
ZNF548-201ENST00000336128 Q5VV11 94 aa6.43□□□□□ -1.38
ZNF548-201ENST00000336128 LPAP08519 4548 aa6.37□□□□□ -1.39
ZNF548-201ENST00000336128 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.36□□□□□ -1.39
ZNF548-201ENST00000336128 LRP2P98164 4655 aa6.35□□□□□ -1.39
ZNF548-201ENST00000336128 BRK1Q8WUW1 75 aa6.34□□□□□ -1.4
ZNF548-201ENST00000336128 A0A1B0GU69 56 aa6.33□□□□□ -1.4
ZNF548-201ENST00000336128 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
ZNF548-201ENST00000336128 A6NED7 52 aa6.29□□□□□ -1.4
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