RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325897.4

CLVS1-201, Transcript of clavesin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLVS1, Length 3,486 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-201ENST00000325897 A0A1B0GU69 56 aa3.02□□□□□ -1.93
CLVS1-201ENST00000325897 C7orf33Q8WU49 177 aa3.02□□□□□ -1.93
CLVS1-201ENST00000325897 TLX1NBP0CAT3 122 aa3.01□□□□□ -1.93
CLVS1-201ENST00000325897 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa3.01□□□□□ -1.93
CLVS1-201ENST00000325897 WFDC13Q8IUB5 93 aa3□□□□□ -1.93
CLVS1-201ENST00000325897 COL7A1Q02388 2944 aa3□□□□□ -1.93
CLVS1-201ENST00000325897 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3□□□□□ -1.93
CLVS1-201ENST00000325897 Q8NBF4 154 aa3□□□□□ -1.93
CLVS1-201ENST00000325897 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa3□□□□□ -1.93
CLVS1-201ENST00000325897 TENM2Q9NT68 2774 aa2.99□□□□□ -1.93
CLVS1-201ENST00000325897 A0A087WTM6 91 aa2.99□□□□□ -1.93
CLVS1-201ENST00000325897 DEFB116Q30KQ4 102 aa2.99□□□□□ -1.93
CLVS1-201ENST00000325897 DNAH9Q9NYC9 4486 aa2.99□□□□□ -1.93
CLVS1-201ENST00000325897 LYSTQ99698 3801 aa2.98□□□□□ -1.93
CLVS1-201ENST00000325897 PCOTHQ58A44 107 aa2.98□□□□□ -1.93
CLVS1-201ENST00000325897 SPINT4Q6UDR6 99 aa2.98□□□□□ -1.93
CLVS1-201ENST00000325897 A0A1B0GVX0 72 aa2.97□□□□□ -1.93
CLVS1-201ENST00000325897 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa2.96□□□□□ -1.93
CLVS1-201ENST00000325897 APLNQ9ULZ1 77 aa2.96□□□□□ -1.93
CLVS1-201ENST00000325897 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa2.96□□□□□ -1.94
CLVS1-201ENST00000325897 DNHD1Q96M86 4753 aa2.96□□□□□ -1.94
CLVS1-201ENST00000325897 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa2.96□□□□□ -1.94
CLVS1-201ENST00000325897 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa2.95□□□□□ -1.94
CLVS1-201ENST00000325897 FAM168BA1KXE4 195 aa2.95□□□□□ -1.94
CLVS1-201ENST00000325897 C14orf177Q52M58 125 aa2.95□□□□□ -1.94
CLVS1-201ENST00000325897 PANO1I0J062 215 aa2.95□□□□□ -1.94
CLVS1-201ENST00000325897 LINC00304Q8N9R0 145 aa2.95□□□□□ -1.94
CLVS1-201ENST00000325897 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
CLVS1-201ENST00000325897 DNAH10Q8IVF4 4471 aa2.94□□□□□ -1.94
CLVS1-201ENST00000325897 ALMS1Q8TCU4 4167 aa2.94□□□□□ -1.94
CLVS1-201ENST00000325897 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa2.94□□□□□ -1.94
CLVS1-201ENST00000325897 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa2.94□□□□□ -1.94
CLVS1-201ENST00000325897 ACYP2P14621 99 aa2.94□□□□□ -1.94
CLVS1-201ENST00000325897 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa2.94□□□□□ -1.94
CLVS1-201ENST00000325897 Q8N377 158 aa2.94□□□□□ -1.94
CLVS1-201ENST00000325897 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
CLVS1-201ENST00000325897 CSMD3Q7Z407 3707 aa2.93□□□□□ -1.94
CLVS1-201ENST00000325897 IGLV7-43P04211 117 aa2.93□□□□□ -1.94
CLVS1-201ENST00000325897 DEFB105AQ8NG35 78 aa2.93□□□□□ -1.94
CLVS1-201ENST00000325897 DNAH1Q9P2D7 4330 aa2.93□□□□□ -1.94
CLVS1-201ENST00000325897 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa2.92□□□□□ -1.94
CLVS1-201ENST00000325897 A0A096LNI7 61 aa2.92□□□□□ -1.94
CLVS1-201ENST00000325897 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
CLVS1-201ENST00000325897 Q96NJ1 140 aa2.92□□□□□ -1.94
CLVS1-201ENST00000325897 Q6ZRX8 168 aa2.92□□□□□ -1.94
CLVS1-201ENST00000325897 FBN3Q75N90 2809 aa2.91□□□□□ -1.94
CLVS1-201ENST00000325897 DNAH7Q8WXX0 4024 aa2.91□□□□□ -1.94
CLVS1-201ENST00000325897 TGP01266 2768 aa2.91□□□□□ -1.94
CLVS1-201ENST00000325897 STARD9Q9P2P6 4700 aa2.9□□□□□ -1.94
CLVS1-201ENST00000325897 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa2.9□□□□□ -1.95
CLVS1-201ENST00000325897 A0A1W2PNN7 141 aa2.89□□□□□ -1.95
CLVS1-201ENST00000325897 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa2.89□□□□□ -1.95
CLVS1-201ENST00000325897 LY6G6CO95867 125 aa2.89□□□□□ -1.95
CLVS1-201ENST00000325897 SPRR1AP35321 89 aa2.89□□□□□ -1.95
CLVS1-201ENST00000325897 PRLHP81277 87 aa2.89□□□□□ -1.95
CLVS1-201ENST00000325897 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
CLVS1-201ENST00000325897 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa2.88□□□□□ -1.95
CLVS1-201ENST00000325897 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa2.88□□□□□ -1.95
CLVS1-201ENST00000325897 LCE2CQ5TA81 110 aa2.88□□□□□ -1.95
CLVS1-201ENST00000325897 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
CLVS1-201ENST00000325897 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
CLVS1-201ENST00000325897 KMT2AQ03164 3969 aa2.86□□□□□ -1.95
CLVS1-201ENST00000325897 VPS13DQ5THJ4 4388 aa2.86□□□□□ -1.95
CLVS1-201ENST00000325897 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa2.85□□□□□ -1.95
CLVS1-201ENST00000325897 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa2.85□□□□□ -1.95
CLVS1-201ENST00000325897 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa2.84□□□□□ -1.95
CLVS1-201ENST00000325897 SPACA4Q8TDM5 124 aa2.84□□□□□ -1.95
CLVS1-201ENST00000325897 CRIPTQ9P021 101 aa2.84□□□□□ -1.96
CLVS1-201ENST00000325897 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
CLVS1-201ENST00000325897 IGFL1Q6UW32 110 aa2.83□□□□□ -1.96
CLVS1-201ENST00000325897 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa2.83□□□□□ -1.96
CLVS1-201ENST00000325897 DNAH2Q9P225 4427 aa2.82□□□□□ -1.96
CLVS1-201ENST00000325897 LORP23490 312 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
CLVS1-201ENST00000325897 ANAPC11Q9NYG5 84 aa2.82□□□□□ -1.96
CLVS1-201ENST00000325897 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa2.82□□□□□ -1.96
CLVS1-201ENST00000325897 A0A0G2JQZ4 141 aa2.81□□□□□ -1.96
CLVS1-201ENST00000325897 H0YAA0 97 aa2.81□□□□□ -1.96
CLVS1-201ENST00000325897 FAM229AH3BQW9 127 aa2.81□□□□□ -1.96
CLVS1-201ENST00000325897 A0A1B0GU33 70 aa2.81□□□□□ -1.96
CLVS1-201ENST00000325897 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.8□□□□□ -1.96
CLVS1-201ENST00000325897 TPRXLQ17RH7 258 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-201ENST00000325897 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa2.79□□□□□ -1.96
CLVS1-201ENST00000325897 SPRR1BP22528 89 aa2.78□□□□□ -1.96
CLVS1-201ENST00000325897 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa2.78□□□□□ -1.96
CLVS1-201ENST00000325897 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa2.78□□□□□ -1.96
CLVS1-201ENST00000325897 FRAS1Q86XX4 4008 aa2.78□□□□□ -1.96
CLVS1-201ENST00000325897 KRTAP10-2P60368 255 aa2.78□□□□□ -1.96
CLVS1-201ENST00000325897 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.78□□□□□ -1.96
CLVS1-201ENST00000325897 DNAH17Q9UFH2 4485 aa2.78□□□□□ -1.96
CLVS1-201ENST00000325897 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-201ENST00000325897 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-201ENST00000325897 DNAH6Q9C0G6 4158 aa2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-201ENST00000325897 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-201ENST00000325897 Q6ZSA8 131 aa2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-201ENST00000325897 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-201ENST00000325897 DNAH8Q96JB1 4490 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-201ENST00000325897 HYDINQ4G0P3 5121 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-201ENST00000325897 DNAH11Q96DT5 4516 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-201ENST00000325897 DNAH5Q8TE73 4624 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-201ENST00000325897 KRTAP10-1P60331 282 aa2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.4 ms