RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259467.8

PDCL-201, Transcript of phosducin like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDCL, Length 2,813 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL-201ENST00000259467 H0Y9P7 68 aa6□□□□□ -1.45
PDCL-201ENST00000259467 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PDCL-201ENST00000259467 CASC2Q6XLA1 102 aa5.98□□□□□ -1.45
PDCL-201ENST00000259467 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa5.98□□□□□ -1.45
PDCL-201ENST00000259467 CD164Q04900 197 aa5.98□□□□□ -1.45
PDCL-201ENST00000259467 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
PDCL-201ENST00000259467 DEFB116Q30KQ4 102 aa5.97□□□□□ -1.45
PDCL-201ENST00000259467 PLAC8Q9NZF1 115 aa5.97□□□□□ -1.45
PDCL-201ENST00000259467 A8MWP4 228 aa5.95□□□□□ -1.46
PDCL-201ENST00000259467 PRR15LQ9BU68 103 aa5.95□□□□□ -1.46
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PDCL-201ENST00000259467 Q96NJ1 140 aa5.94□□□□□ -1.46
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PDCL-201ENST00000259467 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa5.89□□□□□ -1.47
PDCL-201ENST00000259467 SPTSSBQ8NFR3 76 aa5.89□□□□□ -1.47
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PDCL-201ENST00000259467 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.87□□□□□ -1.47
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PDCL-201ENST00000259467 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa5.85□□□□□ -1.47
PDCL-201ENST00000259467 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.85□□□□□ -1.47
PDCL-201ENST00000259467 A6NN06 94 aa5.84□□□□□ -1.47
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PDCL-201ENST00000259467 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa5.83□□□□□ -1.48
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PDCL-201ENST00000259467 C8orf17Q9NRJ1 99 aa5.81□□□□□ -1.48
PDCL-201ENST00000259467 A0A1B0GVX0 72 aa5.8□□□□□ -1.48
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PDCL-201ENST00000259467 C7orf65Q6ZTY9 151 aa5.8□□□□□ -1.48
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PDCL-201ENST00000259467 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa5.78□□□□□ -1.48
PDCL-201ENST00000259467 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa5.77□□□□□ -1.49
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PDCL-201ENST00000259467 SPINK7P58062 85 aa5.72□□□□□ -1.49
PDCL-201ENST00000259467 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PDCL-201ENST00000259467 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
PDCL-201ENST00000259467 MYCBP2O75592 4640 aa5.7□□□□□ -1.5
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa5.7□□□□□ -1.5
PDCL-201ENST00000259467 C8orf87E5RJ46 101 aa5.68□□□□□ -1.5
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa5.68□□□□□ -1.5
PDCL-201ENST00000259467 ACYP2P14621 99 aa5.67□□□□□ -1.5
PDCL-201ENST00000259467 ABCA13Q86UQ4 5058 aa5.66□□□□□ -1.5
PDCL-201ENST00000259467 Q5W150 140 aa5.65□□□□□ -1.5
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa5.65□□□□□ -1.51
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PDCL-201ENST00000259467 HERC2O95714 4834 aa5.64□□□□□ -1.51
PDCL-201ENST00000259467 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa5.63□□□□□ -1.51
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PDCL-201ENST00000259467 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa5.62□□□□□ -1.51
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PDCL-201ENST00000259467 DMAC1Q96GE9 116 aa5.61□□□□□ -1.51
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PDCL-201ENST00000259467 FAT3Q8TDW7 4589 aa5.57□□□□□ -1.52
PDCL-201ENST00000259467 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.57□□□□□ -1.52
PDCL-201ENST00000259467 FAM229AH3BQW9 127 aa5.57□□□□□ -1.52
PDCL-201ENST00000259467 RPS29P62273 56 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
PDCL-201ENST00000259467 Q8N1X5 172 aa5.56□□□□□ -1.52
PDCL-201ENST00000259467 PCLOQ9Y6V0 5065 aa5.55□□□□□ -1.52
PDCL-201ENST00000259467 H3BS24 57 aa5.54□□□□□ -1.52
PDCL-201ENST00000259467 SPINK1P00995 79 aa5.54□□□□□ -1.52
PDCL-201ENST00000259467 TNXBP22105 4242 aa5.54□□□□□ -1.52
PDCL-201ENST00000259467 IGKV2-30P06310 120 aa5.54□□□□□ -1.52
PDCL-201ENST00000259467 PRAC1Q96KF2 57 aa5.53□□□□□ -1.52
PDCL-201ENST00000259467 UQCR11O14957 56 aa5.53□□□□□ -1.52
PDCL-201ENST00000259467 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.52□□□□□ -1.53
PDCL-201ENST00000259467 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
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