RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 WFDC13Q8IUB5 93 aa16.08■□□□□ 0.16
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CAPNS1-201ENST00000246533 A8MWP4 228 aa16.04■□□□□ 0.16
CAPNS1-201ENST00000246533 CASC2Q6XLA1 102 aa16.04■□□□□ 0.16
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A0G2JQZ4 141 aa16.03■□□□□ 0.16
CAPNS1-201ENST00000246533 DEFB116Q30KQ4 102 aa16.02■□□□□ 0.16
CAPNS1-201ENST00000246533 PLAC8Q9NZF1 115 aa16.02■□□□□ 0.16
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CAPNS1-201ENST00000246533 LINC00472Q9H8W2 130 aa16■□□□□ 0.15
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CAPNS1-201ENST00000246533 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
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CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF861PO60384 105 aa15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1-201ENST00000246533 A6NED7 52 aa15.35■□□□□ 0.05
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CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa15.27■□□□□ 0.04
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CAPNS1-201ENST00000246533 A8MU10 97 aa15.25■□□□□ 0.03
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CAPNS1-201ENST00000246533 C8orf87E5RJ46 101 aa15.21■□□□□ 0.03
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CAPNS1-201ENST00000246533 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa15.19■□□□□ 0.02
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CAPNS1-201ENST00000246533 DMAC1Q96GE9 116 aa15□□□□□ -0.01
CAPNS1-201ENST00000246533 HMCN2Q8NDA2 5059 aa15□□□□□ -0.01
CAPNS1-201ENST00000246533 SPINK7P58062 85 aa14.98□□□□□ -0.01
CAPNS1-201ENST00000246533 LINC00313P59037 77 aa14.96□□□□□ -0.02
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CAPNS1-201ENST00000246533 TYMSOSQ8TAI1 123 aa14.91□□□□□ -0.02
CAPNS1-201ENST00000246533 IGKV2-30P06310 120 aa14.85□□□□□ -0.03
CAPNS1-201ENST00000246533 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa14.8□□□□□ -0.04
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1B0GU69 56 aa14.74□□□□□ -0.05
CAPNS1-201ENST00000246533 LINC00304Q8N9R0 145 aa14.73□□□□□ -0.05
CAPNS1-201ENST00000246533 LRP2P98164 4655 aa14.73□□□□□ -0.05
CAPNS1-201ENST00000246533 LPAP08519 4548 aa14.71□□□□□ -0.05
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa14.7□□□□□ -0.06
CAPNS1-201ENST00000246533 SPATA8Q6RVD6 105 aa14.66□□□□□ -0.06
CAPNS1-201ENST00000246533 UBR4Q5T4S7 5183 aa14.62□□□□□ -0.07
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