RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000042824.12

Herc1-201, Transcript of HECT and RLD domain-containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Herc1, Length 15,153 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc1-201ENSMUST00000042824 Hoxa5P09021 270 aa4.71□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gata3P23772 443 aa4.71□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Npc2Q9Z0J0 149 aa4.71□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Tcrg-C1A0A075B5Z0 172 aa4.71□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Tcrg-C3L7N479 172 aa4.71□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Wipf3P0C7L0 485 aa4.71□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Mrpl55Q9CZ83 127 aa4.71□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 F11rO88792 300 aa4.7□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Olfr1323Q8VF35 309 aa4.7□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Olfr1012Q8VFJ7 311 aa4.7□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Trdv5A0A075B661 115 aa4.7□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Cd300eQ8K249 196 aa4.7□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Trbv12-2A0A0B4J1H1 124 aa4.7□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Nxph4G3X9N5 304 aa4.7□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 P04943 107 aa4.7□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Lyrm9Q3UN90 78 aa4.7□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Klf2Q60843 354 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Lamtor2Q9JHS3 125 aa4.7□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gm17455G3UW87 128 aa4.7□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ly86O88188 162 aa4.7□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Rpl36aP83882 106 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 C1ql4Q4ZJM9 238 aa4.7□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 F930015N05RikQ8C3A3 210 aa4.7□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gata4Q08369 441 aa4.7□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Pxt1Q8K459 51 aa4.7□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Q8R092 253 aa4.7□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Atp23Q9CWQ3 201 aa4.7□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Mmp23O88676 391 aa4.7□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Pla2g2cP48076 150 aa4.7□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Olfr975Q8VG91 310 aa4.7□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ankhd1E9PUR0 2548 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Nr2c2apQ3TV70 140 aa4.7□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Rpp25lQ99JH1 163 aa4.7□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Tmem52Q9D702 196 aa4.7□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Trbv31A0A075B5J5 111 aa4.7□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Il1f10Q8R459 152 aa4.7□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Olfr211Q8VGH2 309 aa4.7□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gm33815A0A087WNV3 176 aa4.7□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Timp3P39876 211 aa4.7□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 St6galnac6Q9JM95 333 aa4.7□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Trav7n-4A0A075B620 113 aa4.7□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Slamf6Q9ET39 351 aa4.7□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Tex26Q0VB26 296 aa4.7□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Tmem136Q3TYE7 245 aa4.7□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Rbm38Q62176 237 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Il3raP26952 396 aa4.69□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gpx7Q99LJ6 186 aa4.69□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Trdv2-1A0A0G2JGB9 116 aa4.69□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Igh-3P01867 404 aa4.69□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Cela2aP05208 271 aa4.69□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gm12888Q3UW77 119 aa4.69□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Olfr322Q5NCC8 327 aa4.69□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Mrpl36Q99N90 102 aa4.69□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Obox1Q9D350 204 aa4.69□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Saa4P31532 130 aa4.69□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Cd5lQ9QWK4 352 aa4.69□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Usp9xP70398 2559 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Trbv13-3A0A0B4J1H2 113 aa4.69□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 H2al1jA2BFR3 109 aa4.69□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Q08AU9 97 aa4.69□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 March3Q8BRX9 218 aa4.69□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Nav2E9Q842 2432 aa4.69□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Id3P41133 119 aa4.69□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Lynx1P0DP60 116 aa4.69□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 4930596D02RikQ3V0H9 216 aa4.69□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 P06330 118 aa4.69□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ccl24Q9JKC0 119 aa4.69□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 SnrpcQ62241 159 aa4.69□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Isg15Q64339 161 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Lhfpl1Q80SV1 220 aa4.69□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Tac4Q99N14 128 aa4.69□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Tmem170aQ9D342 144 aa4.69□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Flg2Q2VIS4 2362 aa4.69□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Bak1O08734 209 aa4.69□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Itgb1bp1O35671 200 aa4.69□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Rspo3Q2TJ95 277 aa4.69□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Olfr433Q7TRV9 314 aa4.69□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gm26938S4R185 226 aa4.68□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Lrp4Q8VI56 1905 aa4.68□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gm36368A0A1D5RLK8 91 aa4.68□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 AmelxP63277 210 aa4.68□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Rnf126Q91YL2 313 aa4.68□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Olfr317Q5NCD6 327 aa4.68□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Olfr984Q8VFN1 314 aa4.68□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Igkv4-91A0A075B5L2 119 aa4.68□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Uqcrfs1Q9CR68 274 aa4.68□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Spata25Q9DA57 226 aa4.68□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Dmrtc2Q8CGW9 370 aa4.68□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gm45213A0A0U1RNZ6 101 aa4.68□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Zc2hc1aQ8BJH1 324 aa4.68□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Rpl15Q9CZM2 204 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Defb3Q9WTL0 63 aa4.68□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ighv3-1A0A075B5S6 116 aa4.68□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 ColqO35348 457 aa4.68□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Pgpep1Q9ESW8 209 aa4.68□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Defa27F2Z403 93 aa4.68□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Zcwpw2Q08EN7 125 aa4.68□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 PtprbB2RU80 1998 aa4.68□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 AcanQ61282 2132 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gm10203F6QJ09 66 aa4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 110.3 ms