Protein–RNA interactions for Protein: Q2TJ95

Rspo3, R-spondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo3Q2TJ95 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Rspo3Q2TJ95 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Rspo3Q2TJ95 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Rspo3Q2TJ95 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rspo3Q2TJ95 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rspo3Q2TJ95 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rspo3Q2TJ95 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Rspo3Q2TJ95 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Rspo3Q2TJ95 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rspo3Q2TJ95 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Rspo3Q2TJ95 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rspo3Q2TJ95 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Rspo3Q2TJ95 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rspo3Q2TJ95 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rspo3Q2TJ95 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Rspo3Q2TJ95 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rspo3Q2TJ95 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rspo3Q2TJ95 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rspo3Q2TJ95 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rspo3Q2TJ95 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rspo3Q2TJ95 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rspo3Q2TJ95 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rspo3Q2TJ95 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rspo3Q2TJ95 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rspo3Q2TJ95 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rspo3Q2TJ95 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Rspo3Q2TJ95 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rspo3Q2TJ95 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rspo3Q2TJ95 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rspo3Q2TJ95 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rspo3Q2TJ95 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Rspo3Q2TJ95 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rspo3Q2TJ95 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Rspo3Q2TJ95 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rspo3Q2TJ95 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rspo3Q2TJ95 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rspo3Q2TJ95 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rspo3Q2TJ95 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rspo3Q2TJ95 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rspo3Q2TJ95 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rspo3Q2TJ95 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rspo3Q2TJ95 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rspo3Q2TJ95 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Rspo3Q2TJ95 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rspo3Q2TJ95 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rspo3Q2TJ95 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rspo3Q2TJ95 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rspo3Q2TJ95 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rspo3Q2TJ95 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Rspo3Q2TJ95 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rspo3Q2TJ95 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rspo3Q2TJ95 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rspo3Q2TJ95 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rspo3Q2TJ95 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rspo3Q2TJ95 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rspo3Q2TJ95 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rspo3Q2TJ95 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rspo3Q2TJ95 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rspo3Q2TJ95 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Rspo3Q2TJ95 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Rspo3Q2TJ95 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rspo3Q2TJ95 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rspo3Q2TJ95 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rspo3Q2TJ95 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rspo3Q2TJ95 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rspo3Q2TJ95 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rspo3Q2TJ95 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rspo3Q2TJ95 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rspo3Q2TJ95 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rspo3Q2TJ95 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rspo3Q2TJ95 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rspo3Q2TJ95 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Rspo3Q2TJ95 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rspo3Q2TJ95 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Rspo3Q2TJ95 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rspo3Q2TJ95 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Rspo3Q2TJ95 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rspo3Q2TJ95 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rspo3Q2TJ95 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rspo3Q2TJ95 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rspo3Q2TJ95 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rspo3Q2TJ95 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rspo3Q2TJ95 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rspo3Q2TJ95 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rspo3Q2TJ95 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rspo3Q2TJ95 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rspo3Q2TJ95 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rspo3Q2TJ95 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rspo3Q2TJ95 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Rspo3Q2TJ95 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rspo3Q2TJ95 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rspo3Q2TJ95 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rspo3Q2TJ95 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rspo3Q2TJ95 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rspo3Q2TJ95 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rspo3Q2TJ95 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rspo3Q2TJ95 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rspo3Q2TJ95 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rspo3Q2TJ95 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rspo3Q2TJ95 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms