Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rbm38Q62176 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rbm38Q62176 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rbm38Q62176 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rbm38Q62176 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Rbm38Q62176 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rbm38Q62176 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rbm38Q62176 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Rbm38Q62176 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rbm38Q62176 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rbm38Q62176 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rbm38Q62176 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rbm38Q62176 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rbm38Q62176 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rbm38Q62176 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rbm38Q62176 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rbm38Q62176 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rbm38Q62176 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rbm38Q62176 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rbm38Q62176 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rbm38Q62176 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rbm38Q62176 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Rbm38Q62176 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Rbm38Q62176 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rbm38Q62176 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rbm38Q62176 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rbm38Q62176 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rbm38Q62176 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rbm38Q62176 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rbm38Q62176 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rbm38Q62176 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rbm38Q62176 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rbm38Q62176 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rbm38Q62176 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rbm38Q62176 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rbm38Q62176 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbm38Q62176 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rbm38Q62176 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbm38Q62176 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbm38Q62176 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbm38Q62176 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rbm38Q62176 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbm38Q62176 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rbm38Q62176 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rbm38Q62176 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rbm38Q62176 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rbm38Q62176 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbm38Q62176 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbm38Q62176 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rbm38Q62176 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rbm38Q62176 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rbm38Q62176 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbm38Q62176 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rbm38Q62176 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rbm38Q62176 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rbm38Q62176 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rbm38Q62176 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbm38Q62176 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rbm38Q62176 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rbm38Q62176 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rbm38Q62176 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rbm38Q62176 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rbm38Q62176 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rbm38Q62176 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rbm38Q62176 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rbm38Q62176 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rbm38Q62176 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rbm38Q62176 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rbm38Q62176 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rbm38Q62176 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rbm38Q62176 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rbm38Q62176 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rbm38Q62176 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rbm38Q62176 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rbm38Q62176 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbm38Q62176 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rbm38Q62176 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rbm38Q62176 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbm38Q62176 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rbm38Q62176 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rbm38Q62176 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbm38Q62176 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbm38Q62176 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rbm38Q62176 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rbm38Q62176 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rbm38Q62176 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rbm38Q62176 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rbm38Q62176 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbm38Q62176 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rbm38Q62176 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbm38Q62176 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbm38Q62176 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbm38Q62176 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbm38Q62176 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rbm38Q62176 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rbm38Q62176 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rbm38Q62176 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rbm38Q62176 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbm38Q62176 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rbm38Q62176 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
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