RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639956.1

SPIN3-232, Transcript of spindlin family member 3, humanhuman

TSL 5

Gene SPIN3, Length 2,998 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3-232ENST00000639956 FAM229BQ4G0N7 80 aa7.89□□□□□ -1.15
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SPIN3-232ENST00000639956 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
SPIN3-232ENST00000639956 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.87□□□□□ -1.15
SPIN3-232ENST00000639956 DNAH1Q9P2D7 4330 aa7.86□□□□□ -1.15
SPIN3-232ENST00000639956 DNAH3Q8TD57 4116 aa7.86□□□□□ -1.15
SPIN3-232ENST00000639956 DNAH7Q8WXX0 4024 aa7.86□□□□□ -1.15
SPIN3-232ENST00000639956 A0A0U1RQV1 116 aa7.85□□□□□ -1.15
SPIN3-232ENST00000639956 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.85□□□□□ -1.15
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SPIN3-232ENST00000639956 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
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SPIN3-232ENST00000639956 C9orf163Q8N9P6 203 aa7.68□□□□□ -1.18
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SPIN3-232ENST00000639956 H0Y9P7 68 aa7.65□□□□□ -1.19
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SPIN3-232ENST00000639956 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.62□□□□□ -1.19
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SPIN3-232ENST00000639956 PCOTHQ58A44 107 aa7.62□□□□□ -1.19
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SPIN3-232ENST00000639956 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa7.53□□□□□ -1.2
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SPIN3-232ENST00000639956 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa7.49□□□□□ -1.21
SPIN3-232ENST00000639956 CDK2AP2O75956 126 aa7.48□□□□□ -1.21
SPIN3-232ENST00000639956 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa7.48□□□□□ -1.21
SPIN3-232ENST00000639956 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa7.48□□□□□ -1.21
SPIN3-232ENST00000639956 DNAH2Q9P225 4427 aa7.48□□□□□ -1.21
SPIN3-232ENST00000639956 C8orf17Q9NRJ1 99 aa7.47□□□□□ -1.21
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SPIN3-232ENST00000639956 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa7.46□□□□□ -1.22
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SPIN3-232ENST00000639956 Q1T7F1 81 aa7.45□□□□□ -1.22
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SPIN3-232ENST00000639956 LY6G6CO95867 125 aa7.45□□□□□ -1.22
SPIN3-232ENST00000639956 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
SPIN3-232ENST00000639956 CD164Q04900 197 aa7.44□□□□□ -1.22
SPIN3-232ENST00000639956 PRR15LQ9BU68 103 aa7.44□□□□□ -1.22
SPIN3-232ENST00000639956 DNAH6Q9C0G6 4158 aa7.43□□□□□ -1.22
SPIN3-232ENST00000639956 ZNF861PO60384 105 aa7.42□□□□□ -1.22
SPIN3-232ENST00000639956 COA5Q86WW8 74 aa7.42□□□□□ -1.22
SPIN3-232ENST00000639956 DNHD1Q96M86 4753 aa7.42□□□□□ -1.22
SPIN3-232ENST00000639956 A0A1B0GVX0 72 aa7.42□□□□□ -1.22
SPIN3-232ENST00000639956 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa7.42□□□□□ -1.22
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