RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591994.1

RPRD1A-210, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1A, humanhuman

TSL 2

Gene RPRD1A, Length 2,484 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1A-210ENST00000591994 HMGN4O00479 90 aa-0.07□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 APOC3P02656 99 aa-0.07□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa-0.07□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 Q8IZM0 81 aa-0.07□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 C2orf88Q9BSF0 95 aa-0.07□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa-0.07□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 ANKRD36A6QL64 1941 aa-0.07□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 CFAP54Q96N23 3096 aa-0.07□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 CHD7Q9P2D1 2997 aa-0.07□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 A0A0C4DFX4 3053 aa-0.07□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa-0.07□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 TRAV22A0A0B4J277 110 aa-0.07□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 M0R3E3 92 aa-0.07□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 IFITM1P13164 125 aa-0.07□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 GNG4P50150 75 aa-0.07□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 HAMPP81172 84 aa-0.07□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 COX6B2Q6YFQ2 88 aa-0.07□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 SPRR4Q96PI1 79 aa-0.07□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 H3BQ15 152 aa-0.08□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 BCE1O60756 84 aa-0.08□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 S100A3P33764 101 aa-0.08□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 MYOZ3Q8TDC0 251 aa-0.08□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 NPVFQ9HCQ7 196 aa-0.08□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 LINC00474Q9P2X8 69 aa-0.08□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 Q9Y3F1 56 aa-0.08□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 MYO7BQ6PIF6 2116 aa-0.08□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 A0A1B0GV90 55 aa-0.08□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 K7EP34 96 aa-0.08□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 CFDP00746 253 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 UBE2D3P61077 147 aa-0.08□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 UBE2D2P62837 147 aa-0.08□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 TMEM170BQ5T4T1 132 aa-0.08□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 C9orf153Q5TBE3 101 aa-0.08□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 TMEM203Q969S6 136 aa-0.08□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa-0.08□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 SVEP1Q4LDE5 3571 aa-0.09□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 ZFHX4Q86UP3 3567 aa-0.09□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 C20orf202A1L168 122 aa-0.09□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 CORTO00230 105 aa-0.09□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 MT1AP04731 61 aa-0.09□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 TSLPQ969D9 159 aa-0.09□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 APLNQ9ULZ1 77 aa-0.09□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 DMXL1Q9Y485 3027 aa-0.09□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa-0.09□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 RELNP78509 3460 aa-0.09□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 F6UZH7 168 aa-0.09□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 SFT2D2O95562 160 aa-0.09□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 MGPP08493 103 aa-0.09□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa-0.09□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 DEFB109BQ30KR1 87 aa-0.09□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 Q6JHZ5 121 aa-0.09□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 CENPFP49454 3210 aa-0.09□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 LAMA5O15230 3695 aa-0.1□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP-0.1□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa-0.1□□□□□ -2.43
RPRD1A-210ENST00000591994 DCDP81605 110 aaKnown RBP-0.1□□□□□ -2.43
RPRD1A-210ENST00000591994 FAIMQ9NVQ4 179 aa-0.1□□□□□ -2.43
RPRD1A-210ENST00000591994 CRIPTQ9P021 101 aa-0.1□□□□□ -2.43
RPRD1A-210ENST00000591994 UQCR10Q9UDW1 63 aa-0.1□□□□□ -2.43
RPRD1A-210ENST00000591994 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa-0.1□□□□□ -2.43
RPRD1A-210ENST00000591994 FAM24AA6NFZ4 105 aa-0.1□□□□□ -2.43
RPRD1A-210ENST00000591994 SPRR1AP35321 89 aa-0.1□□□□□ -2.43
RPRD1A-210ENST00000591994 PPP3R1P63098 170 aa-0.1□□□□□ -2.43
RPRD1A-210ENST00000591994 COX6CP09669 75 aa-0.11□□□□□ -2.43
RPRD1A-210ENST00000591994 MT1XP80297 61 aa-0.11□□□□□ -2.43
RPRD1A-210ENST00000591994 PIGYQ3MUY2 71 aa-0.11□□□□□ -2.43
RPRD1A-210ENST00000591994 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa-0.11□□□□□ -2.43
RPRD1A-210ENST00000591994 USP34Q70CQ2 3546 aa-0.11□□□□□ -2.43
RPRD1A-210ENST00000591994 LINC00587B1AMM8 73 aa-0.11□□□□□ -2.43
RPRD1A-210ENST00000591994 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa-0.11□□□□□ -2.43
RPRD1A-210ENST00000591994 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP-0.11□□□□□ -2.43
RPRD1A-210ENST00000591994 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa-0.11□□□□□ -2.43
RPRD1A-210ENST00000591994 LAMA3Q16787 3333 aa-0.12□□□□□ -2.43
RPRD1A-210ENST00000591994 ZZEF1O43149 2961 aa-0.12□□□□□ -2.43
RPRD1A-210ENST00000591994 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa-0.12□□□□□ -2.43
RPRD1A-210ENST00000591994 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa-0.12□□□□□ -2.43
RPRD1A-210ENST00000591994 NAP1L6A6NFF2 107 aa-0.12□□□□□ -2.43
RPRD1A-210ENST00000591994 STATHP02808 62 aa-0.12□□□□□ -2.43
RPRD1A-210ENST00000591994 IGLC1P0CG04 106 aa-0.12□□□□□ -2.43
RPRD1A-210ENST00000591994 DEFA5Q01523 94 aa-0.12□□□□□ -2.43
RPRD1A-210ENST00000591994 Q0VG73 95 aa-0.12□□□□□ -2.43
RPRD1A-210ENST00000591994 FAM223AQ8IWN6 122 aa-0.12□□□□□ -2.43
RPRD1A-210ENST00000591994 FRYLO94915 3013 aa-0.12□□□□□ -2.43
RPRD1A-210ENST00000591994 CUBNO60494 3623 aa-0.12□□□□□ -2.43
RPRD1A-210ENST00000591994 HTTP42858 3142 aa-0.12□□□□□ -2.43
RPRD1A-210ENST00000591994 PRM1P04553 51 aa-0.12□□□□□ -2.43
RPRD1A-210ENST00000591994 MT1EP04732 61 aa-0.12□□□□□ -2.43
RPRD1A-210ENST00000591994 C10orf113Q5VZT2 155 aa-0.12□□□□□ -2.43
RPRD1A-210ENST00000591994 SVBPQ8N300 66 aa-0.12□□□□□ -2.43
RPRD1A-210ENST00000591994 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa-0.13□□□□□ -2.43
RPRD1A-210ENST00000591994 TMEM262E9PQX1 116 aa-0.13□□□□□ -2.43
RPRD1A-210ENST00000591994 SNAPC5O75971 98 aa-0.13□□□□□ -2.43
RPRD1A-210ENST00000591994 COX14Q96I36 57 aa-0.13□□□□□ -2.43
RPRD1A-210ENST00000591994 PRO1854Q9UHT4 67 aa-0.13□□□□□ -2.43
RPRD1A-210ENST00000591994 TRIOO75962 3097 aa-0.13□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.2 ms