RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568477.5

CMTM3-215, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CMTM3, Length 687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CMTM3-215ENST00000568477 FAM218AQ96MZ4 157 aa8.37□□□□□ -1.07
CMTM3-215ENST00000568477 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa8.36□□□□□ -1.07
CMTM3-215ENST00000568477 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa8.36□□□□□ -1.07
CMTM3-215ENST00000568477 ETDBQ3ZM63 59 aa8.36□□□□□ -1.07
CMTM3-215ENST00000568477 C6orf99Q4VX62 202 aa8.36□□□□□ -1.07
CMTM3-215ENST00000568477 OCIAD2Q56VL3 154 aa8.36□□□□□ -1.07
CMTM3-215ENST00000568477 TEN1Q86WV5 123 aa8.36□□□□□ -1.07
CMTM3-215ENST00000568477 SMCR5Q8TEV8 140 aa8.36□□□□□ -1.07
CMTM3-215ENST00000568477 RETNLBQ9BQ08 111 aa8.36□□□□□ -1.07
CMTM3-215ENST00000568477 SNCGO76070 127 aa8.35□□□□□ -1.07
CMTM3-215ENST00000568477 K7ERU9 68 aa8.34□□□□□ -1.07
CMTM3-215ENST00000568477 B5MCH6 92 aa8.33□□□□□ -1.08
CMTM3-215ENST00000568477 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CMTM3-215ENST00000568477 DNAL4O96015 105 aa8.33□□□□□ -1.08
CMTM3-215ENST00000568477 SPAG11AQ6PDA7 123 aa8.33□□□□□ -1.08
CMTM3-215ENST00000568477 J3QR89 54 aa8.31□□□□□ -1.08
CMTM3-215ENST00000568477 BAALC-AS2P0C853 105 aa8.31□□□□□ -1.08
CMTM3-215ENST00000568477 C4orf48Q5BLP8 95 aa8.31□□□□□ -1.08
CMTM3-215ENST00000568477 LINC00575Q6W349 94 aa8.31□□□□□ -1.08
CMTM3-215ENST00000568477 PPDPFLQ8WWR9 84 aa8.31□□□□□ -1.08
CMTM3-215ENST00000568477 COX7BP24311 80 aa8.3□□□□□ -1.08
CMTM3-215ENST00000568477 LINC00483Q53H64 154 aa8.3□□□□□ -1.08
CMTM3-215ENST00000568477 Q6ZRX8 168 aa8.3□□□□□ -1.08
CMTM3-215ENST00000568477 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa8.29□□□□□ -1.08
CMTM3-215ENST00000568477 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CMTM3-215ENST00000568477 GAGE2AQ6NT46 116 aa8.29□□□□□ -1.08
CMTM3-215ENST00000568477 Q8NBF4 154 aa8.29□□□□□ -1.08
CMTM3-215ENST00000568477 ERC2-IT1O76042 136 aa8.28□□□□□ -1.08
CMTM3-215ENST00000568477 Q9BRP9 147 aa8.28□□□□□ -1.08
CMTM3-215ENST00000568477 hADV29S1A0JD25 119 aa8.27□□□□□ -1.09
CMTM3-215ENST00000568477 TPRXLQ17RH7 258 aa8.27□□□□□ -1.09
CMTM3-215ENST00000568477 ORMDL1Q9P0S3 153 aa8.27□□□□□ -1.09
CMTM3-215ENST00000568477 H3BQ85 93 aa8.26□□□□□ -1.09
CMTM3-215ENST00000568477 CDIP1Q9H305 208 aa8.25□□□□□ -1.09
CMTM3-215ENST00000568477 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa8.24□□□□□ -1.09
CMTM3-215ENST00000568477 GHRHP01286 108 aa8.24□□□□□ -1.09
CMTM3-215ENST00000568477 MOBPQ13875 183 aa8.24□□□□□ -1.09
CMTM3-215ENST00000568477 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa8.23□□□□□ -1.09
CMTM3-215ENST00000568477 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa8.23□□□□□ -1.09
CMTM3-215ENST00000568477 SPINK1P00995 79 aa8.23□□□□□ -1.09
CMTM3-215ENST00000568477 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
CMTM3-215ENST00000568477 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
CMTM3-215ENST00000568477 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa8.22□□□□□ -1.09
CMTM3-215ENST00000568477 A0A0U1RQV1 116 aa8.21□□□□□ -1.1
CMTM3-215ENST00000568477 MUC2Q02817 5179 aa8.2□□□□□ -1.1
CMTM3-215ENST00000568477 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa8.2□□□□□ -1.1
CMTM3-215ENST00000568477 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa8.2□□□□□ -1.1
CMTM3-215ENST00000568477 Q6ZQY7 126 aa8.19□□□□□ -1.1
CMTM3-215ENST00000568477 RPS29P62273 56 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
CMTM3-215ENST00000568477 C9orf153Q5TBE3 101 aa8.18□□□□□ -1.1
CMTM3-215ENST00000568477 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa8.18□□□□□ -1.1
CMTM3-215ENST00000568477 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa8.17□□□□□ -1.1
CMTM3-215ENST00000568477 VPS25Q9BRG1 176 aa8.15□□□□□ -1.1
CMTM3-215ENST00000568477 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa8.14□□□□□ -1.11
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa8.14□□□□□ -1.11
CMTM3-215ENST00000568477 Q8N377 158 aa8.14□□□□□ -1.11
CMTM3-215ENST00000568477 ACYP1P07311 99 aa8.13□□□□□ -1.11
CMTM3-215ENST00000568477 MUC17Q685J3 4493 aa8.13□□□□□ -1.11
CMTM3-215ENST00000568477 SPRR1BP22528 89 aa8.12□□□□□ -1.11
CMTM3-215ENST00000568477 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa8.11□□□□□ -1.11
CMTM3-215ENST00000568477 C14orf132Q9NPU4 83 aa8.1□□□□□ -1.11
CMTM3-215ENST00000568477 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa8.09□□□□□ -1.11
CMTM3-215ENST00000568477 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
CMTM3-215ENST00000568477 RBM3P98179 157 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
CMTM3-215ENST00000568477 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa8.08□□□□□ -1.12
CMTM3-215ENST00000568477 PDE6GP18545 87 aa8.08□□□□□ -1.12
CMTM3-215ENST00000568477 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
CMTM3-215ENST00000568477 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa8.08□□□□□ -1.12
CMTM3-215ENST00000568477 CCKP06307 115 aa8.07□□□□□ -1.12
CMTM3-215ENST00000568477 FAT4Q6V0I7 4981 aa8.07□□□□□ -1.12
CMTM3-215ENST00000568477 DEFB105AQ8NG35 78 aa8.06□□□□□ -1.12
CMTM3-215ENST00000568477 DSCR8Q96T75 97 aa8.05□□□□□ -1.12
CMTM3-215ENST00000568477 LIMD2Q9BT23 127 aa8.05□□□□□ -1.12
CMTM3-215ENST00000568477 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa8.04□□□□□ -1.12
CMTM3-215ENST00000568477 HRCT1Q6UXD1 115 aa8.04□□□□□ -1.12
CMTM3-215ENST00000568477 SIGMAR1Q99720 223 aa8.04□□□□□ -1.12
CMTM3-215ENST00000568477 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa8.03□□□□□ -1.12
CMTM3-215ENST00000568477 A0A1B0GV72 72 aa8.03□□□□□ -1.12
CMTM3-215ENST00000568477 Q6ZQT0 140 aa8.03□□□□□ -1.12
CMTM3-215ENST00000568477 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
CMTM3-215ENST00000568477 CD164Q04900 197 aa8□□□□□ -1.13
CMTM3-215ENST00000568477 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
CMTM3-215ENST00000568477 SMIM29Q86T20 159 aa7.99□□□□□ -1.13
CMTM3-215ENST00000568477 XP32Q5T750 250 aa7.98□□□□□ -1.13
CMTM3-215ENST00000568477 LINC00643Q86TS7 51 aa7.98□□□□□ -1.13
CMTM3-215ENST00000568477 LINC00846Q9NV44 126 aa7.96□□□□□ -1.14
CMTM3-215ENST00000568477 F8WEM9 126 aa7.95□□□□□ -1.14
CMTM3-215ENST00000568477 MT-ATP8P03928 68 aa7.95□□□□□ -1.14
CMTM3-215ENST00000568477 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.94□□□□□ -1.14
CMTM3-215ENST00000568477 A0A1B0GW54 56 aa7.94□□□□□ -1.14
CMTM3-215ENST00000568477 Q5XG85 94 aa7.93□□□□□ -1.14
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa7.93□□□□□ -1.14
CMTM3-215ENST00000568477 A0A0G2JQZ4 141 aa7.91□□□□□ -1.14
CMTM3-215ENST00000568477 SCGB1A1P11684 91 aa7.91□□□□□ -1.14
CMTM3-215ENST00000568477 UBL5Q9BZL1 73 aa7.91□□□□□ -1.14
CMTM3-215ENST00000568477 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa7.9□□□□□ -1.14
CMTM3-215ENST00000568477 C9orf92A6NGG3 77 aa7.9□□□□□ -1.14
CMTM3-215ENST00000568477 Q6JHZ5 121 aa7.9□□□□□ -1.14
CMTM3-215ENST00000568477 Q6Q795 121 aa7.9□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.6 ms