RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564966.5

PPP4C-208, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 2

Gene PPP4C, Length 1,122 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-208	ENST00000564966	RPL37	P61927	97 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PPP4C-208	ENST00000564966		Q6JHZ5	121 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PPP4C-208	ENST00000564966	HIST1H4G	Q99525	98 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PPP4C-208	ENST00000564966	KRTAP19-2	Q3LHN2	52 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PPP4C-208	ENST00000564966	SCGB1D1	O95968	90 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PPP4C-208	ENST00000564966	CLEC2B	Q92478	149 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PPP4C-208	ENST00000564966	MT1H	P80294	61 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PPP4C-208	ENST00000564966	LCE2D	Q5TA82	110 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PPP4C-208	ENST00000564966	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PPP4C-208	ENST00000564966	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PPP4C-208	ENST00000564966	IGFL1	Q6UW32	110 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PPP4C-208	ENST00000564966	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PPP4C-208	ENST00000564966	TRBV7-7	A0A0K0K1E9	115 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PPP4C-208	ENST00000564966	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PPP4C-208	ENST00000564966	COX6B2	Q6YFQ2	88 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PPP4C-208	ENST00000564966	CFC1B	P0CG36	223 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PPP4C-208	ENST00000564966		M0R2T5	61 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PPP4C-208	ENST00000564966	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PPP4C-208	ENST00000564966		H3BUT2	72 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PPP4C-208	ENST00000564966	COX8A	P10176	69 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PPP4C-208	ENST00000564966	S100A1	P23297	94 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PPP4C-208	ENST00000564966	RAB37	Q96AX2	223 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PPP4C-208	ENST00000564966	OBSCN-AS1	Q96MR7	158 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PPP4C-208	ENST00000564966	SNCG	O76070	127 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PPP4C-208	ENST00000564966	LST1	O00453	97 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PPP4C-208	ENST00000564966	FSIP2	Q5CZC0	6907 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PPP4C-208	ENST00000564966	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PPP4C-208	ENST00000564966	C14orf144	Q96I85	54 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PPP4C-208	ENST00000564966	CFC1	P0CG37	223 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PPP4C-208	ENST00000564966	DLEU1	O43261	78 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PPP4C-208	ENST00000564966	CRCT1	Q9UGL9	99 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PPP4C-208	ENST00000564966	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
PPP4C-208	ENST00000564966		Q6Q795	121 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PPP4C-208	ENST00000564966	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PPP4C-208	ENST00000564966	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PPP4C-208	ENST00000564966		H0YGX0	51 aa		13.32	□□□□□ -0.28
PPP4C-208	ENST00000564966	SPATA45	Q537H7	98 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PPP4C-208	ENST00000564966		Q96NJ1	140 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PPP4C-208	ENST00000564966		Q75L30	129 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PPP4C-208	ENST00000564966	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
PPP4C-208	ENST00000564966		A0A0B4J2C4	111 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PPP4C-208	ENST00000564966	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
PPP4C-208	ENST00000564966	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PPP4C-208	ENST00000564966	HIGD1B	Q9P298	99 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PPP4C-208	ENST00000564966	TEN1	Q86WV5	123 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PPP4C-208	ENST00000564966	VAMP8	Q9BV40	100 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PPP4C-208	ENST00000564966	FABP2	P12104	132 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PPP4C-208	ENST00000564966		A0A087WSZ3	146 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PPP4C-208	ENST00000564966		H3BMG7	143 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PPP4C-208	ENST00000564966	GHRH	P01286	108 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PPP4C-208	ENST00000564966	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PPP4C-208	ENST00000564966		A6NJY4	79 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PPP4C-208	ENST00000564966	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PPP4C-208	ENST00000564966	CEND1	Q8N111	149 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PPP4C-208	ENST00000564966	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PPP4C-208	ENST00000564966		A0A1B0GX51	115 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PPP4C-208	ENST00000564966	SIGMAR1	Q99720	223 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PPP4C-208	ENST00000564966	FLG	P20930	4061 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
PPP4C-208	ENST00000564966		A0A1B0GV72	72 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PPP4C-208	ENST00000564966	FXYD2	P54710	66 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PPP4C-208	ENST00000564966	DSCR10	P59022	87 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PPP4C-208	ENST00000564966	C20orf166-AS1	Q96NR2	134 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PPP4C-208	ENST00000564966	TRIAP1	O43715	76 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PPP4C-208	ENST00000564966	DNAL4	O96015	105 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PPP4C-208	ENST00000564966		A8MUU9	505 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PPP4C-208	ENST00000564966	TRBV20-1	A0A075B6N2	111 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PPP4C-208	ENST00000564966	PSMB2	P49721	201 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PPP4C-208	ENST00000564966		A0A1W2PNM2	257 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PPP4C-208	ENST00000564966	ANKRD29	Q8N6D5	301 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PPP4C-208	ENST00000564966	ORMDL1	Q9P0S3	153 aa		13.04	□□□□□ -0.32
PPP4C-208	ENST00000564966	IGKV4-1	P06312	121 aa		13.02	□□□□□ -0.33
PPP4C-208	ENST00000564966		K7ERJ3	54 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PPP4C-208	ENST00000564966	COX6C	P09669	75 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PPP4C-208	ENST00000564966	LINC00313	P59037	77 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PPP4C-208	ENST00000564966	HSD52	Q0P140	79 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PPP4C-208	ENST00000564966	TRBV7-4	A0A0J9YYF1	115 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PPP4C-208	ENST00000564966		H3BQ85	93 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PPP4C-208	ENST00000564966	TMEM256-PLSCR3	K7ERE1	68 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PPP4C-208	ENST00000564966	DEFB116	Q30KQ4	102 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PPP4C-208	ENST00000564966	TRAC	P01848	142 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PPP4C-208	ENST00000564966	CCK	P06307	115 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PPP4C-208	ENST00000564966	FAM236D	A0A1B0GTK5	79 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PPP4C-208	ENST00000564966	FAM236C	P0DP71	79 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PPP4C-208	ENST00000564966	PYY3	Q5JQD4	70 aa		12.89	□□□□□ -0.35
PPP4C-208	ENST00000564966	VPS25	Q9BRG1	176 aa		12.89	□□□□□ -0.35
PPP4C-208	ENST00000564966	IGHV6-1	A0A0B4J1U7	121 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PPP4C-208	ENST00000564966	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PPP4C-208	ENST00000564966	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PPP4C-208	ENST00000564966	SCGB1C2	P0DMR2	95 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PPP4C-208	ENST00000564966	LINC00472	Q9H8W2	130 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PPP4C-208	ENST00000564966	UBE2V1	Q13404	147 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PPP4C-208	ENST00000564966	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PPP4C-208	ENST00000564966	RBM12B-AS1	Q9P1G2	102 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PPP4C-208	ENST00000564966	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
PPP4C-208	ENST00000564966	DSCR8	Q96T75	97 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PPP4C-208	ENST00000564966	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PPP4C-208	ENST00000564966	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	12.73	□□□□□ -0.37
PPP4C-208	ENST00000564966		A0A1B0GVX0	72 aa		12.72	□□□□□ -0.37
PPP4C-208	ENST00000564966	C8orf87	E5RJ46	101 aa		12.72	□□□□□ -0.37
PPP4C-208	ENST00000564966	HRES1	P13985	223 aa		12.69	□□□□□ -0.38

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