RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523555.5

PABPC1-222, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, human

TSL 3

Gene PABPC1, Length 522 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PABPC1-222	ENST00000523555	hADV29S1	A0JD25	119 aa		5.26	□□□□□ -1.57
PABPC1-222	ENST00000523555	KRTAP4-1	Q9BYQ7	146 aa		5.26	□□□□□ -1.57
PABPC1-222	ENST00000523555	PRO1933	Q9H354	126 aa		5.26	□□□□□ -1.57
PABPC1-222	ENST00000523555	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
PABPC1-222	ENST00000523555	VAMP3	Q15836	100 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PABPC1-222	ENST00000523555	FXYD2	P54710	66 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-222	ENST00000523555	CD164	Q04900	197 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-222	ENST00000523555	XP32	Q5T750	250 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-222	ENST00000523555	CEND1	Q8N111	149 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-222	ENST00000523555	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-222	ENST00000523555	LIMD2	Q9BT23	127 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-222	ENST00000523555		A0A0B4J2C4	111 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PABPC1-222	ENST00000523555	C9orf92	A6NGG3	77 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PABPC1-222	ENST00000523555	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PABPC1-222	ENST00000523555	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PABPC1-222	ENST00000523555	RAB37	Q96AX2	223 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PABPC1-222	ENST00000523555	C1orf195	Q5TG92	126 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PABPC1-222	ENST00000523555	IGFL1	Q6UW32	110 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PABPC1-222	ENST00000523555	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
PABPC1-222	ENST00000523555	TSTD3	H0UI37	97 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PABPC1-222	ENST00000523555	LCE2A	Q5TA79	106 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
PABPC1-222	ENST00000523555		Q5XG85	94 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PABPC1-222	ENST00000523555	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PABPC1-222	ENST00000523555	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PABPC1-222	ENST00000523555		F8WEM9	126 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PABPC1-222	ENST00000523555		H3BUT2	72 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PABPC1-222	ENST00000523555		K7ERJ3	54 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PABPC1-222	ENST00000523555	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PABPC1-222	ENST00000523555	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PABPC1-222	ENST00000523555	TRIAP1	O43715	76 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PABPC1-222	ENST00000523555	CLEC2B	Q92478	149 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PABPC1-222	ENST00000523555	TRBV7-7	A0A0K0K1E9	115 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PABPC1-222	ENST00000523555		A0A0U1RQV1	116 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PABPC1-222	ENST00000523555	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PABPC1-222	ENST00000523555		A6NJY4	79 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PABPC1-222	ENST00000523555	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
PABPC1-222	ENST00000523555	HSD52	Q0P140	79 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PABPC1-222	ENST00000523555		H0YGX0	51 aa		5.15	□□□□□ -1.59
PABPC1-222	ENST00000523555		Q6JHZ5	121 aa		5.15	□□□□□ -1.59
PABPC1-222	ENST00000523555	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		5.15	□□□□□ -1.59
PABPC1-222	ENST00000523555	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		5.15	□□□□□ -1.59
PABPC1-222	ENST00000523555	PCOTH	Q58A44	107 aa		5.14	□□□□□ -1.59
PABPC1-222	ENST00000523555	TCL1B	O95988	128 aa		5.13	□□□□□ -1.59
PABPC1-222	ENST00000523555	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
PABPC1-222	ENST00000523555		A0A1B0GX51	115 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PABPC1-222	ENST00000523555		M0R143	59 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PABPC1-222	ENST00000523555		A0A1B0GV72	72 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PABPC1-222	ENST00000523555	FABP2	P12104	132 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PABPC1-222	ENST00000523555	KRTAP19-2	Q3LHN2	52 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PABPC1-222	ENST00000523555		H3BMG7	143 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-222	ENST00000523555	PSMB2	P49721	201 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-222	ENST00000523555	RPL37	P61927	97 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-222	ENST00000523555	LCE2C	Q5TA81	110 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-222	ENST00000523555		Q6Q795	121 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PABPC1-222	ENST00000523555		A0A1W2PNM2	257 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PABPC1-222	ENST00000523555	SNCG	O76070	127 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PABPC1-222	ENST00000523555		A0A087WSZ3	146 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC1-222	ENST00000523555	TEN1	Q86WV5	123 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC1-222	ENST00000523555		Q96NJ1	140 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC1-222	ENST00000523555	LST1	O00453	97 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-222	ENST00000523555	ORMDL1	Q9P0S3	153 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-222	ENST00000523555	FLG	P20930	4061 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-222	ENST00000523555	DNAL4	O96015	105 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-222	ENST00000523555	OBSCN-AS1	Q96MR7	158 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-222	ENST00000523555	COX6C	P09669	75 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PABPC1-222	ENST00000523555	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PABPC1-222	ENST00000523555	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-222	ENST00000523555	TMEM256-PLSCR3	K7ERE1	68 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PABPC1-222	ENST00000523555	GHRH	P01286	108 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PABPC1-222	ENST00000523555	ANKRD29	Q8N6D5	301 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PABPC1-222	ENST00000523555	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PABPC1-222	ENST00000523555	TRAC	P01848	142 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PABPC1-222	ENST00000523555	SCGB1C2	P0DMR2	95 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PABPC1-222	ENST00000523555	MT1H	P80294	61 aa		5	□□□□□ -1.61
PABPC1-222	ENST00000523555	UBE2V1	Q13404	147 aa		5	□□□□□ -1.61
PABPC1-222	ENST00000523555		Q75L30	129 aa		5	□□□□□ -1.61
PABPC1-222	ENST00000523555	TRBV7-4	A0A0J9YYF1	115 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-222	ENST00000523555	CCK	P06307	115 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-222	ENST00000523555	DSCR10	P59022	87 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-222	ENST00000523555	DEFB116	Q30KQ4	102 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-222	ENST00000523555	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-222	ENST00000523555	LYRM7	Q5U5X0	104 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PABPC1-222	ENST00000523555		H3BQ85	93 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PABPC1-222	ENST00000523555	SIGMAR1	Q99720	223 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PABPC1-222	ENST00000523555	BAALC-AS2	P0C853	105 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-222	ENST00000523555	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-222	ENST00000523555	C20orf166-AS1	Q96NR2	134 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-222	ENST00000523555	LINC00472	Q9H8W2	130 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-222	ENST00000523555	PCP4L1	A6NKN8	68 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-222	ENST00000523555		A8MUU9	505 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-222	ENST00000523555	IGKV4-1	P06312	121 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-222	ENST00000523555	VPS25	Q9BRG1	176 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-222	ENST00000523555	TRBV20-1	A0A075B6N2	111 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-222	ENST00000523555	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-222	ENST00000523555	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-222	ENST00000523555	C9orf118	A6NHY6	69 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-222	ENST00000523555	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-222	ENST00000523555	ATXN8	Q156A1	80 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-222	ENST00000523555	BATF	Q16520	125 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PABPC1-222	ENST00000523555	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		4.94	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.1 ms