RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480273.5

RTEL1-TNFRSF6B-201, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,751 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IGSF10Q6WRI0 2623 aa10.84□□□□□ -0.67
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 Q75L30 129 aa10.83□□□□□ -0.68
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 VPS13AQ96RL7 3174 aa10.81□□□□□ -0.68
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CYSTM1Q9H1C7 97 aa10.81□□□□□ -0.68
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa10.8□□□□□ -0.68
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HRES1P13985 223 aa10.76□□□□□ -0.69
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 COL6A3P12111 3177 aa10.71□□□□□ -0.69
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 Q8NDZ9 215 aa10.7□□□□□ -0.7
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PRAC1Q96KF2 57 aa10.65□□□□□ -0.7
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 Q5VV11 94 aa10.64□□□□□ -0.71
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa10.63□□□□□ -0.71
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SPINK7P58062 85 aa10.56□□□□□ -0.72
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RPL37P61927 97 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa10.17□□□□□ -0.78
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KALRNO60229 2985 aa10.14□□□□□ -0.79
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HIVEP1P15822 2718 aa10.13□□□□□ -0.79
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa10.11□□□□□ -0.79
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NBEAQ8NFP9 2946 aa10.11□□□□□ -0.79
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SPATA8Q6RVD6 105 aa10.1□□□□□ -0.79
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZZEF1O43149 2961 aa10.09□□□□□ -0.79
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa10.08□□□□□ -0.8
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 APCP25054 2843 aa10.06□□□□□ -0.8
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP10-2P60368 255 aa10.05□□□□□ -0.8
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PANO1I0J062 215 aa10.04□□□□□ -0.8
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP10-1P60331 282 aa10.04□□□□□ -0.8
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 M0QZ58 72 aa10.03□□□□□ -0.8
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 A0A087X002 238 aa10□□□□□ -0.81
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa10□□□□□ -0.81
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
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