RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478087.5

HPS1-211, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 971 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-211ENST00000478087 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
HPS1-211ENST00000478087 PPDPFLQ8WWR9 84 aa7.38□□□□□ -1.23
HPS1-211ENST00000478087 CDIP1Q9H305 208 aa7.38□□□□□ -1.23
HPS1-211ENST00000478087 COX6CP09669 75 aa7.37□□□□□ -1.23
HPS1-211ENST00000478087 MOBPQ13875 183 aa7.37□□□□□ -1.23
HPS1-211ENST00000478087 OCIAD2Q56VL3 154 aa7.37□□□□□ -1.23
HPS1-211ENST00000478087 FAT4Q6V0I7 4981 aa7.37□□□□□ -1.23
HPS1-211ENST00000478087 C9orf153Q5TBE3 101 aa7.36□□□□□ -1.23
HPS1-211ENST00000478087 SPINK1P00995 79 aa7.35□□□□□ -1.23
HPS1-211ENST00000478087 DEFB105AQ8NG35 78 aa7.35□□□□□ -1.23
HPS1-211ENST00000478087 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
HPS1-211ENST00000478087 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
HPS1-211ENST00000478087 Q6ZQY7 126 aa7.34□□□□□ -1.23
HPS1-211ENST00000478087 F8WEM9 126 aa7.33□□□□□ -1.24
HPS1-211ENST00000478087 H3BQ85 93 aa7.33□□□□□ -1.24
HPS1-211ENST00000478087 PSMB2P49721 201 aa7.33□□□□□ -1.24
HPS1-211ENST00000478087 TRIAP1O43715 76 aa7.32□□□□□ -1.24
HPS1-211ENST00000478087 Q8N377 158 aa7.32□□□□□ -1.24
HPS1-211ENST00000478087 K7ERJ3 54 aa7.31□□□□□ -1.24
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa7.31□□□□□ -1.24
HPS1-211ENST00000478087 CD164Q04900 197 aa7.3□□□□□ -1.24
HPS1-211ENST00000478087 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
HPS1-211ENST00000478087 SMIM29Q86T20 159 aa7.3□□□□□ -1.24
HPS1-211ENST00000478087 DNAL4O96015 105 aa7.29□□□□□ -1.24
HPS1-211ENST00000478087 Q6JHZ5 121 aa7.28□□□□□ -1.24
HPS1-211ENST00000478087 SNHG12Q9BXW3 62 aa7.28□□□□□ -1.24
HPS1-211ENST00000478087 SCGB1C2P0DMR2 95 aa7.27□□□□□ -1.25
HPS1-211ENST00000478087 FAM218AQ96MZ4 157 aa7.27□□□□□ -1.25
HPS1-211ENST00000478087 LIMD2Q9BT23 127 aa7.27□□□□□ -1.25
HPS1-211ENST00000478087 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.26□□□□□ -1.25
HPS1-211ENST00000478087 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
HPS1-211ENST00000478087 A0A0U1RQV1 116 aa7.25□□□□□ -1.25
HPS1-211ENST00000478087 LYRM7Q5U5X0 104 aa7.25□□□□□ -1.25
HPS1-211ENST00000478087 HRCT1Q6UXD1 115 aa7.25□□□□□ -1.25
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa7.25□□□□□ -1.25
HPS1-211ENST00000478087 TRACP01848 142 aa7.24□□□□□ -1.25
HPS1-211ENST00000478087 CLEC2BQ92478 149 aa7.24□□□□□ -1.25
HPS1-211ENST00000478087 ORMDL1Q9P0S3 153 aa7.24□□□□□ -1.25
HPS1-211ENST00000478087 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa7.22□□□□□ -1.25
HPS1-211ENST00000478087 LST1O00453 97 aa7.21□□□□□ -1.26
HPS1-211ENST00000478087 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
HPS1-211ENST00000478087 Q5XG85 94 aa7.21□□□□□ -1.26
HPS1-211ENST00000478087 A0A0G2JQZ4 141 aa7.2□□□□□ -1.26
HPS1-211ENST00000478087 FABP2P12104 132 aa7.2□□□□□ -1.26
HPS1-211ENST00000478087 BATFQ16520 125 aa7.2□□□□□ -1.26
HPS1-211ENST00000478087 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7.2□□□□□ -1.26
HPS1-211ENST00000478087 ATXN8Q156A1 80 aa7.19□□□□□ -1.26
HPS1-211ENST00000478087 TCL1BO95988 128 aa7.18□□□□□ -1.26
HPS1-211ENST00000478087 UBE2V1Q13404 147 aa7.18□□□□□ -1.26
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa7.18□□□□□ -1.26
HPS1-211ENST00000478087 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.17□□□□□ -1.26
HPS1-211ENST00000478087 IGFL1Q6UW32 110 aa7.17□□□□□ -1.26
HPS1-211ENST00000478087 H3BMG7 143 aa7.16□□□□□ -1.26
HPS1-211ENST00000478087 XP32Q5T750 250 aa7.16□□□□□ -1.26
HPS1-211ENST00000478087 C9orf118A6NHY6 69 aa7.15□□□□□ -1.26
HPS1-211ENST00000478087 Q6Q795 121 aa7.15□□□□□ -1.26
HPS1-211ENST00000478087 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa7.14□□□□□ -1.27
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa7.14□□□□□ -1.27
HPS1-211ENST00000478087 C9orf92A6NGG3 77 aa7.13□□□□□ -1.27
HPS1-211ENST00000478087 H3BUT2 72 aa7.13□□□□□ -1.27
HPS1-211ENST00000478087 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
HPS1-211ENST00000478087 TEN1Q86WV5 123 aa7.13□□□□□ -1.27
HPS1-211ENST00000478087 BAALC-AS2P0C853 105 aa7.12□□□□□ -1.27
HPS1-211ENST00000478087 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
HPS1-211ENST00000478087 SS18L2Q9UHA2 77 aa7.12□□□□□ -1.27
HPS1-211ENST00000478087 TAX1BP3O14907 124 aa7.11□□□□□ -1.27
HPS1-211ENST00000478087 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa7.11□□□□□ -1.27
HPS1-211ENST00000478087 ANKRD29Q8N6D5 301 aa7.11□□□□□ -1.27
HPS1-211ENST00000478087 A0A1W2PPM0 123 aa7.1□□□□□ -1.27
HPS1-211ENST00000478087 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa7.09□□□□□ -1.27
HPS1-211ENST00000478087 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa7.08□□□□□ -1.28
HPS1-211ENST00000478087 RBM3P98179 157 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
HPS1-211ENST00000478087 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7.07□□□□□ -1.28
HPS1-211ENST00000478087 C1orf195Q5TG92 126 aa7.07□□□□□ -1.28
HPS1-211ENST00000478087 DSCR8Q96T75 97 aa7.07□□□□□ -1.28
HPS1-211ENST00000478087 PCOTHQ58A44 107 aa7.06□□□□□ -1.28
HPS1-211ENST00000478087 PDE6GP18545 87 aa7.05□□□□□ -1.28
HPS1-211ENST00000478087 LCE2CQ5TA81 110 aa7.05□□□□□ -1.28
HPS1-211ENST00000478087 C9JAW5 83 aa7.04□□□□□ -1.28
HPS1-211ENST00000478087 H3BT86 120 aa7.04□□□□□ -1.28
HPS1-211ENST00000478087 A0A1W2PNM2 257 aa7.03□□□□□ -1.28
HPS1-211ENST00000478087 CCKP06307 115 aa7.03□□□□□ -1.28
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa7.03□□□□□ -1.28
HPS1-211ENST00000478087 A0A087WSZ3 146 aa7.02□□□□□ -1.29
HPS1-211ENST00000478087 A0A1B0GW54 56 aa7.02□□□□□ -1.29
HPS1-211ENST00000478087 PCP4L1A6NKN8 68 aa7.02□□□□□ -1.29
HPS1-211ENST00000478087 SPCS1Q9Y6A9 102 aa7.02□□□□□ -1.29
HPS1-211ENST00000478087 A0A1B0GV72 72 aa7□□□□□ -1.29
HPS1-211ENST00000478087 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.99□□□□□ -1.29
HPS1-211ENST00000478087 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.98□□□□□ -1.29
HPS1-211ENST00000478087 Q6ZQT0 140 aa6.96□□□□□ -1.3
HPS1-211ENST00000478087 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.96□□□□□ -1.3
HPS1-211ENST00000478087 VPS25Q9BRG1 176 aa6.96□□□□□ -1.3
HPS1-211ENST00000478087 K7EP34 96 aa6.95□□□□□ -1.3
HPS1-211ENST00000478087 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
HPS1-211ENST00000478087 MT1HP80294 61 aa6.93□□□□□ -1.3
HPS1-211ENST00000478087 Q96NJ1 140 aa6.92□□□□□ -1.3
HPS1-211ENST00000478087 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.92□□□□□ -1.3
HPS1-211ENST00000478087 J3KT08 172 aa6.91□□□□□ -1.3
HPS1-211ENST00000478087 SIGMAR1Q99720 223 aa6.9□□□□□ -1.3
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