RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476784.5

TTC3-215, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 2

Gene TTC3, Length 7,425 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-215	ENST00000476784	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TTC3-215	ENST00000476784	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		4.15	□□□□□ -1.74
TTC3-215	ENST00000476784	ATR	Q13535	2644 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TTC3-215	ENST00000476784	BPTF	Q12830	3046 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TTC3-215	ENST00000476784	TRANK1	O15050	2925 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TTC3-215	ENST00000476784	KRTAP10-2	P60368	255 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TTC3-215	ENST00000476784	MAST4	O15021	2626 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TTC3-215	ENST00000476784		H7BZZ5	65 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TTC3-215	ENST00000476784	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TTC3-215	ENST00000476784	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TTC3-215	ENST00000476784	VCAN	P13611	3396 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TTC3-215	ENST00000476784	KLKP1	Q107X0	134 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TTC3-215	ENST00000476784	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TTC3-215	ENST00000476784	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TTC3-215	ENST00000476784	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TTC3-215	ENST00000476784	ADM2	Q7Z4H4	148 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TTC3-215	ENST00000476784	DMAC1	Q96GE9	116 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TTC3-215	ENST00000476784	C5orf42	Q9H799	3197 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TTC3-215	ENST00000476784	LINC01546	A6NGU7	62 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TTC3-215	ENST00000476784	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TTC3-215	ENST00000476784	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
TTC3-215	ENST00000476784	DMD	P11532	3685 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TTC3-215	ENST00000476784	C20orf166-AS1	Q96NR2	134 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TTC3-215	ENST00000476784		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
TTC3-215	ENST00000476784	STAB1	Q9NY15	2570 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TTC3-215	ENST00000476784	SPEG	Q15772	3267 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TTC3-215	ENST00000476784		A0A0C4DFX4	3053 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TTC3-215	ENST00000476784	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
TTC3-215	ENST00000476784	FRYL	O94915	3013 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TTC3-215	ENST00000476784	PRO0461	Q9UI25	63 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TTC3-215	ENST00000476784	CFAP54	Q96N23	3096 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TTC3-215	ENST00000476784	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
TTC3-215	ENST00000476784	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		4.03	□□□□□ -1.76
TTC3-215	ENST00000476784	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
TTC3-215	ENST00000476784	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		4.03	□□□□□ -1.77
TTC3-215	ENST00000476784	WDFY3	Q8IZQ1	3526 aa		4.02	□□□□□ -1.77
TTC3-215	ENST00000476784	COL6A3	P12111	3177 aa		4.02	□□□□□ -1.77
TTC3-215	ENST00000476784	LAMA1	P25391	3075 aa		4.02	□□□□□ -1.77
TTC3-215	ENST00000476784		Q5W150	140 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TTC3-215	ENST00000476784	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
TTC3-215	ENST00000476784	SPANXA2-OT1	Q8N9U9	137 aa		4	□□□□□ -1.77
TTC3-215	ENST00000476784	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
TTC3-215	ENST00000476784	RPL37	P61927	97 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
TTC3-215	ENST00000476784	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TTC3-215	ENST00000476784	SPRR1B	P22528	89 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TTC3-215	ENST00000476784		A0A1B0GVY2	172 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TTC3-215	ENST00000476784		A8MUU9	505 aa		3.97	□□□□□ -1.77
TTC3-215	ENST00000476784	KLK9	Q2XQG4	91 aa		3.96	□□□□□ -1.77
TTC3-215	ENST00000476784	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		3.96	□□□□□ -1.78
TTC3-215	ENST00000476784	SPATA8	Q6RVD6	105 aa		3.96	□□□□□ -1.78
TTC3-215	ENST00000476784		Q8NDZ9	215 aa		3.95	□□□□□ -1.78
TTC3-215	ENST00000476784	ROMO1	P60602	79 aa		3.94	□□□□□ -1.78
TTC3-215	ENST00000476784	ITPR3	Q14573	2671 aa		3.94	□□□□□ -1.78
TTC3-215	ENST00000476784	MMP24-AS1	A0A0U1RRL7	71 aa		3.94	□□□□□ -1.78
TTC3-215	ENST00000476784	KRTAP10-8	P60410	259 aa		3.94	□□□□□ -1.78
TTC3-215	ENST00000476784		A0A087X002	238 aa		3.92	□□□□□ -1.78
TTC3-215	ENST00000476784	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		3.9	□□□□□ -1.78
TTC3-215	ENST00000476784		Q6ZR54	194 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TTC3-215	ENST00000476784	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
TTC3-215	ENST00000476784	PRAC1	Q96KF2	57 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TTC3-215	ENST00000476784		P0C880	135 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TTC3-215	ENST00000476784	PANO1	I0J062	215 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TTC3-215	ENST00000476784	KRTAP10-10	P60014	251 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TTC3-215	ENST00000476784	ASPM	Q8IZT6	3477 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TTC3-215	ENST00000476784	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TTC3-215	ENST00000476784	TNP1	P09430	55 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TTC3-215	ENST00000476784	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		3.86	□□□□□ -1.79
TTC3-215	ENST00000476784	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
TTC3-215	ENST00000476784	OCR1	Q9BZK8	76 aa		3.85	□□□□□ -1.79
TTC3-215	ENST00000476784	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		3.85	□□□□□ -1.79
TTC3-215	ENST00000476784	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		3.84	□□□□□ -1.8
TTC3-215	ENST00000476784	LINC00472	Q9H8W2	130 aa		3.83	□□□□□ -1.8
TTC3-215	ENST00000476784	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		3.83	□□□□□ -1.8
TTC3-215	ENST00000476784	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		3.83	□□□□□ -1.8
TTC3-215	ENST00000476784	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		3.83	□□□□□ -1.8
TTC3-215	ENST00000476784	NOTCH1	P46531	2555 aa		3.82	□□□□□ -1.8
TTC3-215	ENST00000476784	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		3.82	□□□□□ -1.8
TTC3-215	ENST00000476784		Q75L30	129 aa		3.82	□□□□□ -1.8
TTC3-215	ENST00000476784	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		3.82	□□□□□ -1.8
TTC3-215	ENST00000476784	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
TTC3-215	ENST00000476784	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		3.82	□□□□□ -1.8
TTC3-215	ENST00000476784	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		3.81	□□□□□ -1.8
TTC3-215	ENST00000476784	SPRR1A	P35321	89 aa		3.81	□□□□□ -1.8
TTC3-215	ENST00000476784	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		3.8	□□□□□ -1.8
TTC3-215	ENST00000476784	LAMA5	O15230	3695 aa		3.8	□□□□□ -1.8
TTC3-215	ENST00000476784	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		3.8	□□□□□ -1.8
TTC3-215	ENST00000476784	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
TTC3-215	ENST00000476784	PRO2289	Q9P1D8	64 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TTC3-215	ENST00000476784	AKAP13	Q12802	2813 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-215	ENST00000476784	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TTC3-215	ENST00000476784		A8MU10	97 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTC3-215	ENST00000476784	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TTC3-215	ENST00000476784	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TTC3-215	ENST00000476784	FRY	Q5TBA9	3013 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TTC3-215	ENST00000476784	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		3.72	□□□□□ -1.81
TTC3-215	ENST00000476784	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
TTC3-215	ENST00000476784	COL6A5	A8TX70	2615 aa		3.7	□□□□□ -1.82
TTC3-215	ENST00000476784	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	3.7	□□□□□ -1.82
TTC3-215	ENST00000476784	CENPE	Q02224	2701 aa		3.7	□□□□□ -1.82
TTC3-215	ENST00000476784		Q5XG85	94 aa		3.7	□□□□□ -1.82

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