RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472230.5

GCFC2-208, Transcript of GC-rich sequence DNA-binding factor 2, human

TSL 2

Gene GCFC2, Length 2,265 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GCFC2-208	ENST00000472230		A0A1B0GW54	56 aa		11.23	□□□□□ -0.61
GCFC2-208	ENST00000472230		A0A1W2PNM2	257 aa		11.23	□□□□□ -0.61
GCFC2-208	ENST00000472230	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		11.22	□□□□□ -0.61
GCFC2-208	ENST00000472230	FAM236A	A0A1B0GUQ0	79 aa		11.21	□□□□□ -0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	FAM236B	A0A1B0GV22	79 aa		11.21	□□□□□ -0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	HIST1H4A	P62805	103 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	NREP	Q16612	68 aa		11.21	□□□□□ -0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	KRTAP10-1	P60331	282 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	IGFL1	Q6UW32	110 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	ZNF861P	O60384	105 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	SCX	Q7RTU7	201 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	SPRR4	Q96PI1	79 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	CXCL6	P80162	114 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GCFC2-208	ENST00000472230		Q6ZSA8	131 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GCFC2-208	ENST00000472230		A0A087WVE0	104 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	IGLV7-43	P04211	117 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GCFC2-208	ENST00000472230		A0A0G2JQZ4	141 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	CRYGA	P11844	174 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	LINC00483	Q53H64	154 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	BPY2	O14599	106 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GCFC2-208	ENST00000472230	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GCFC2-208	ENST00000472230	ATOX1	O00244	68 aa		11.06	□□□□□ -0.64
GCFC2-208	ENST00000472230		A0A087WSZ3	146 aa		11.06	□□□□□ -0.64
GCFC2-208	ENST00000472230	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		11.04	□□□□□ -0.64
GCFC2-208	ENST00000472230	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		11.03	□□□□□ -0.64
GCFC2-208	ENST00000472230	PKD1	P98161	4303 aa		11.03	□□□□□ -0.64
GCFC2-208	ENST00000472230	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.64
GCFC2-208	ENST00000472230	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		11.02	□□□□□ -0.65
GCFC2-208	ENST00000472230	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		11.02	□□□□□ -0.65
GCFC2-208	ENST00000472230	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
GCFC2-208	ENST00000472230	MOBP	Q13875	183 aa		11	□□□□□ -0.65
GCFC2-208	ENST00000472230		Q8N9L7	120 aa		10.99	□□□□□ -0.65
GCFC2-208	ENST00000472230	IGKV4-1	P06312	121 aa		10.97	□□□□□ -0.65
GCFC2-208	ENST00000472230		A0A1B0GVY2	172 aa		10.97	□□□□□ -0.65
GCFC2-208	ENST00000472230	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		10.97	□□□□□ -0.65
GCFC2-208	ENST00000472230	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		10.93	□□□□□ -0.66
GCFC2-208	ENST00000472230	CCDC179	H3BU77	68 aa		10.93	□□□□□ -0.66
GCFC2-208	ENST00000472230	DEFB116	Q30KQ4	102 aa		10.92	□□□□□ -0.66
GCFC2-208	ENST00000472230	DSCR10	P59022	87 aa		10.92	□□□□□ -0.66
GCFC2-208	ENST00000472230	COX7C	P15954	63 aa		10.91	□□□□□ -0.66
GCFC2-208	ENST00000472230	SERP2	Q8N6R1	65 aa		10.91	□□□□□ -0.66
GCFC2-208	ENST00000472230	UQCRQ	O14949	82 aa		10.89	□□□□□ -0.67
GCFC2-208	ENST00000472230		K7EQZ3	153 aa		10.88	□□□□□ -0.67
GCFC2-208	ENST00000472230	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		10.88	□□□□□ -0.67
GCFC2-208	ENST00000472230	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		10.87	□□□□□ -0.67
GCFC2-208	ENST00000472230	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		10.87	□□□□□ -0.67
GCFC2-208	ENST00000472230	LINC00472	Q9H8W2	130 aa		10.86	□□□□□ -0.67
GCFC2-208	ENST00000472230	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		10.84	□□□□□ -0.67
GCFC2-208	ENST00000472230		J3KT08	172 aa		10.83	□□□□□ -0.68
GCFC2-208	ENST00000472230	TRAV7	A0A075B6U4	112 aa		10.82	□□□□□ -0.68
GCFC2-208	ENST00000472230	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
GCFC2-208	ENST00000472230		A0A087X002	238 aa		10.8	□□□□□ -0.68
GCFC2-208	ENST00000472230	CD164	Q04900	197 aa		10.8	□□□□□ -0.68
GCFC2-208	ENST00000472230		A8MWP4	228 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GCFC2-208	ENST00000472230	HCG22	E2RYF7	251 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GCFC2-208	ENST00000472230	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GCFC2-208	ENST00000472230	NDUFB1	O75438	58 aa		10.77	□□□□□ -0.69
GCFC2-208	ENST00000472230	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		10.77	□□□□□ -0.69
GCFC2-208	ENST00000472230	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		10.77	□□□□□ -0.69
GCFC2-208	ENST00000472230	PRR15	Q8IV56	129 aa		10.77	□□□□□ -0.69
GCFC2-208	ENST00000472230	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		10.76	□□□□□ -0.69
GCFC2-208	ENST00000472230		Q96NJ1	140 aa		10.76	□□□□□ -0.69
GCFC2-208	ENST00000472230	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
GCFC2-208	ENST00000472230	RYR2	Q92736	4967 aa		10.74	□□□□□ -0.69
GCFC2-208	ENST00000472230	CDK2AP2	O75956	126 aa		10.73	□□□□□ -0.69
GCFC2-208	ENST00000472230	WFDC13	Q8IUB5	93 aa		10.73	□□□□□ -0.69
GCFC2-208	ENST00000472230	PKHD1	P08F94	4074 aa		10.71	□□□□□ -0.7
GCFC2-208	ENST00000472230	OCR1	Q9BZK8	76 aa		10.7	□□□□□ -0.7
GCFC2-208	ENST00000472230	C20orf197	Q8N268	126 aa		10.69	□□□□□ -0.7
GCFC2-208	ENST00000472230	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		10.69	□□□□□ -0.7
GCFC2-208	ENST00000472230	CASC2	Q6XLA1	102 aa		10.68	□□□□□ -0.7
GCFC2-208	ENST00000472230	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
GCFC2-208	ENST00000472230	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		10.66	□□□□□ -0.7
GCFC2-208	ENST00000472230	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		10.65	□□□□□ -0.7
GCFC2-208	ENST00000472230	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
GCFC2-208	ENST00000472230		A0A1B0GVX0	72 aa		10.64	□□□□□ -0.71
GCFC2-208	ENST00000472230	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
GCFC2-208	ENST00000472230	IGHV6-1	A0A0B4J1U7	121 aa		10.63	□□□□□ -0.71
GCFC2-208	ENST00000472230	MMP24-AS1	A0A0U1RRL7	71 aa		10.63	□□□□□ -0.71
GCFC2-208	ENST00000472230	LIMD2	Q9BT23	127 aa		10.63	□□□□□ -0.71
GCFC2-208	ENST00000472230	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GCFC2-208	ENST00000472230	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
GCFC2-208	ENST00000472230		Q5XG85	94 aa		10.6	□□□□□ -0.71
GCFC2-208	ENST00000472230	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		10.6	□□□□□ -0.71
GCFC2-208	ENST00000472230	C8orf17	Q9NRJ1	99 aa		10.6	□□□□□ -0.71
GCFC2-208	ENST00000472230	hDV103S1	A0JD37	113 aa		10.6	□□□□□ -0.71
GCFC2-208	ENST00000472230	CYSTM1	Q9H1C7	97 aa		10.6	□□□□□ -0.71
GCFC2-208	ENST00000472230	SNURF	Q9Y675	71 aa		10.59	□□□□□ -0.71
GCFC2-208	ENST00000472230	FAM229A	H3BQW9	127 aa		10.59	□□□□□ -0.71
GCFC2-208	ENST00000472230	TMEM254	Q8TBM7	123 aa		10.59	□□□□□ -0.71
GCFC2-208	ENST00000472230	KLKP1	Q107X0	134 aa		10.58	□□□□□ -0.72
GCFC2-208	ENST00000472230	SPINK1	P00995	79 aa		10.56	□□□□□ -0.72

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