RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465846.6

HOXB-AS3-203, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 434 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-203ENST00000465846 H7C2G1 150 aa9.96□□□□□ -0.82
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
HOXB-AS3-203ENST00000465846 C9orf92A6NGG3 77 aa9.95□□□□□ -0.82
HOXB-AS3-203ENST00000465846 LCE1DQ5T752 114 aa9.95□□□□□ -0.82
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SMIM11BQ8TCY0 68 aa9.95□□□□□ -0.82
HOXB-AS3-203ENST00000465846 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
HOXB-AS3-203ENST00000465846 Q5XG85 94 aa9.93□□□□□ -0.82
HOXB-AS3-203ENST00000465846 A0A0G2JQZ4 141 aa9.92□□□□□ -0.82
HOXB-AS3-203ENST00000465846 HIST3H2BBQ8N257 126 aa9.92□□□□□ -0.82
HOXB-AS3-203ENST00000465846 HIST1H2BLQ99880 126 aa9.91□□□□□ -0.82
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PCOTHQ58A44 107 aa9.9□□□□□ -0.82
HOXB-AS3-203ENST00000465846 S100A2P29034 98 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa9.88□□□□□ -0.83
HOXB-AS3-203ENST00000465846 HSBP1L1C9JCN9 74 aa9.88□□□□□ -0.83
HOXB-AS3-203ENST00000465846 C1orf195Q5TG92 126 aa9.88□□□□□ -0.83
HOXB-AS3-203ENST00000465846 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa9.85□□□□□ -0.83
HOXB-AS3-203ENST00000465846 VAMP3Q15836 100 aa9.85□□□□□ -0.83
HOXB-AS3-203ENST00000465846 LINC00575Q6W349 94 aa9.85□□□□□ -0.83
HOXB-AS3-203ENST00000465846 F8WEM9 126 aa9.83□□□□□ -0.84
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa9.82□□□□□ -0.84
HOXB-AS3-203ENST00000465846 Q6ZQY7 126 aa9.82□□□□□ -0.84
HOXB-AS3-203ENST00000465846 hADV29S1A0JD25 119 aa9.81□□□□□ -0.84
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TCL1BO95988 128 aa9.8□□□□□ -0.84
HOXB-AS3-203ENST00000465846 S100A6P06703 90 aa9.8□□□□□ -0.84
HOXB-AS3-203ENST00000465846 C12orf57Q99622 126 aa9.78□□□□□ -0.84
HOXB-AS3-203ENST00000465846 RPL37P61927 97 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
HOXB-AS3-203ENST00000465846 Q6JHZ5 121 aa9.76□□□□□ -0.85
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CLEC2BQ92478 149 aa9.76□□□□□ -0.85
HOXB-AS3-203ENST00000465846 HIST1H4GQ99525 98 aa9.76□□□□□ -0.85
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa9.76□□□□□ -0.85
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SCGB1D1O95968 90 aa9.75□□□□□ -0.85
HOXB-AS3-203ENST00000465846 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MT1HP80294 61 aa9.74□□□□□ -0.85
HOXB-AS3-203ENST00000465846 IGFL1Q6UW32 110 aa9.74□□□□□ -0.85
HOXB-AS3-203ENST00000465846 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa9.73□□□□□ -0.85
HOXB-AS3-203ENST00000465846 COX8AP10176 69 aa9.73□□□□□ -0.85
HOXB-AS3-203ENST00000465846 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa9.73□□□□□ -0.85
HOXB-AS3-203ENST00000465846 OCIAD2Q56VL3 154 aa9.71□□□□□ -0.86
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PPDPFLQ8WWR9 84 aa9.7□□□□□ -0.86
HOXB-AS3-203ENST00000465846 DLEU1O43261 78 aa9.68□□□□□ -0.86
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SNHG12Q9BXW3 62 aa9.67□□□□□ -0.86
HOXB-AS3-203ENST00000465846 H3BUT2 72 aa9.65□□□□□ -0.86
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CFC1BP0CG36 223 aa9.65□□□□□ -0.86
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CFC1P0CG37 223 aa9.65□□□□□ -0.86
HOXB-AS3-203ENST00000465846 RAB37Q96AX2 223 aa9.64□□□□□ -0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 C14orf144Q96I85 54 aa9.64□□□□□ -0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa9.62□□□□□ -0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 HIGD1BQ9P298 99 aa9.62□□□□□ -0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PAM16Q9Y3D7 125 aa9.62□□□□□ -0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 A0A0B4J2C4 111 aa9.61□□□□□ -0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SPATA45Q537H7 98 aa9.61□□□□□ -0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa9.61□□□□□ -0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 LST1O00453 97 aa9.59□□□□□ -0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 COX6B2Q6YFQ2 88 aa9.59□□□□□ -0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 C2orf91Q6ZV80 131 aa9.59□□□□□ -0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 FAM218AQ96MZ4 157 aa9.59□□□□□ -0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 FSIP2Q5CZC0 6907 aa9.59□□□□□ -0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 C9orf118A6NHY6 69 aa9.58□□□□□ -0.88
HOXB-AS3-203ENST00000465846 H0YGX0 51 aa9.58□□□□□ -0.88
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SNCGO76070 127 aa9.58□□□□□ -0.88
HOXB-AS3-203ENST00000465846 Q75L30 129 aa9.58□□□□□ -0.88
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
HOXB-AS3-203ENST00000465846 Q6Q795 121 aa9.57□□□□□ -0.88
HOXB-AS3-203ENST00000465846 VAMP8Q9BV40 100 aa9.57□□□□□ -0.88
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SS18L2Q9UHA2 77 aa9.56□□□□□ -0.88
HOXB-AS3-203ENST00000465846 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
HOXB-AS3-203ENST00000465846 M0R2T5 61 aa9.54□□□□□ -0.88
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa9.54□□□□□ -0.88
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CEND1Q8N111 149 aa9.54□□□□□ -0.88
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TEN1Q86WV5 123 aa9.53□□□□□ -0.88
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CRCT1Q9UGL9 99 aa9.52□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PRO1854Q9UHT4 67 aa9.51□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-203ENST00000465846 A0A087WSZ3 146 aa9.5□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-203ENST00000465846 A0A1B0GX51 115 aa9.5□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-203ENST00000465846 Q96NJ1 140 aa9.5□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-203ENST00000465846 H3BMG7 143 aa9.49□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-203ENST00000465846 FXYD2P54710 66 aa9.49□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa9.49□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-203ENST00000465846 FABP2P12104 132 aa9.47□□□□□ -0.89
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TRIAP1O43715 76 aa9.46□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-203ENST00000465846 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa9.46□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-203ENST00000465846 A8MUU9 505 aa9.43□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-203ENST00000465846 A0A1W2PNM2 257 aa9.42□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-203ENST00000465846 LCE5AQ5TCM9 118 aa9.42□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SIGMAR1Q99720 223 aa9.4□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-203ENST00000465846 DNAL4O96015 105 aa9.39□□□□□ -0.91
HOXB-AS3-203ENST00000465846 DSCR10P59022 87 aa9.39□□□□□ -0.91
HOXB-AS3-203ENST00000465846 HSD52Q0P140 79 aa9.38□□□□□ -0.91
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ORMDL1Q9P0S3 153 aa9.38□□□□□ -0.91
HOXB-AS3-203ENST00000465846 A0A1B0GV72 72 aa9.37□□□□□ -0.91
HOXB-AS3-203ENST00000465846 K7ERJ3 54 aa9.37□□□□□ -0.91
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PYY3Q5JQD4 70 aa9.37□□□□□ -0.91
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa9.37□□□□□ -0.91
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PSMB2P49721 201 aa9.36□□□□□ -0.91
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ANKRD29Q8N6D5 301 aa9.36□□□□□ -0.91
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa9.35□□□□□ -0.91
HOXB-AS3-203ENST00000465846 H3BQ85 93 aa9.34□□□□□ -0.91
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa9.33□□□□□ -0.92
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.1 ms