RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445427.1

PRKCQ-AS1-202, PRKCQ antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKCQ-AS1, Length 1,133 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CEND1Q8N111 149 aa12.09□□□□□ -0.47
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SNCGO76070 127 aa12.04□□□□□ -0.48
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 MUC17Q685J3 4493 aa12.03□□□□□ -0.48
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 PPDPFLQ8WWR9 84 aa12.03□□□□□ -0.48
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 MUC2Q02817 5179 aa12.03□□□□□ -0.48
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 A0A0G2JQZ4 141 aa12.02□□□□□ -0.49
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 A0A0U1RQV1 116 aa12.02□□□□□ -0.49
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 H0YGX0 51 aa12.02□□□□□ -0.49
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 Q5XG85 94 aa12.02□□□□□ -0.49
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 PRO1854Q9UHT4 67 aa12.02□□□□□ -0.49
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 FXYD2P54710 66 aa12.01□□□□□ -0.49
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 Q6JHZ5 121 aa12□□□□□ -0.49
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 HSD52Q0P140 79 aa11.98□□□□□ -0.49
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SNHG12Q9BXW3 62 aa11.98□□□□□ -0.49
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa11.97□□□□□ -0.49
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 OCIAD2Q56VL3 154 aa11.97□□□□□ -0.49
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa11.95□□□□□ -0.5
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CLEC2BQ92478 149 aa11.95□□□□□ -0.5
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 UQCR10Q9UDW1 63 aa11.95□□□□□ -0.5
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TCL1BO95988 128 aa11.94□□□□□ -0.5
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 FAM218AQ96MZ4 157 aa11.93□□□□□ -0.5
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 A0A1B0GX51 115 aa11.92□□□□□ -0.5
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 XP32Q5T750 250 aa11.92□□□□□ -0.5
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 C1orf195Q5TG92 126 aa11.92□□□□□ -0.5
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 IGFL1Q6UW32 110 aa11.92□□□□□ -0.5
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TRIAP1O43715 76 aa11.89□□□□□ -0.51
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 GHRHP01286 108 aa11.89□□□□□ -0.51
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa11.87□□□□□ -0.51
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 C9orf92A6NGG3 77 aa11.87□□□□□ -0.51
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 H3BUT2 72 aa11.86□□□□□ -0.51
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 K7ERJ3 54 aa11.86□□□□□ -0.51
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 PSMB2P49721 201 aa11.85□□□□□ -0.51
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 COX6CP09669 75 aa11.82□□□□□ -0.52
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 DNAL4O96015 105 aa11.81□□□□□ -0.52
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 FABP2P12104 132 aa11.81□□□□□ -0.52
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 H3BMG7 143 aa11.77□□□□□ -0.53
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 Q6Q795 121 aa11.76□□□□□ -0.53
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 H3BQ85 93 aa11.75□□□□□ -0.53
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TEN1Q86WV5 123 aa11.75□□□□□ -0.53
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ORMDL1Q9P0S3 153 aa11.75□□□□□ -0.53
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SS18L2Q9UHA2 77 aa11.74□□□□□ -0.53
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 LST1O00453 97 aa11.72□□□□□ -0.53
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa11.72□□□□□ -0.53
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 FAT4Q6V0I7 4981 aa11.71□□□□□ -0.54
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SMIM6P0DI80 62 aa11.7□□□□□ -0.54
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 PCOTHQ58A44 107 aa11.7□□□□□ -0.54
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa11.69□□□□□ -0.54
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SCGB1C2P0DMR2 95 aa11.69□□□□□ -0.54
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 M0R143 59 aa11.67□□□□□ -0.54
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 A0A087WSZ3 146 aa11.66□□□□□ -0.54
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TRACP01848 142 aa11.65□□□□□ -0.54
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 RPL37P61927 97 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ANKRD29Q8N6D5 301 aa11.64□□□□□ -0.55
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 A0A1B0GV72 72 aa11.62□□□□□ -0.55
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 A0A1W2PNM2 257 aa11.61□□□□□ -0.55
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 UBE2V1Q13404 147 aa11.61□□□□□ -0.55
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa11.59□□□□□ -0.55
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa11.58□□□□□ -0.56
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TSTD3H0UI37 97 aa11.56□□□□□ -0.56
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 Q96NJ1 140 aa11.54□□□□□ -0.56
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CCKP06307 115 aa11.53□□□□□ -0.56
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 BAALC-AS2P0C853 105 aa11.51□□□□□ -0.57
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 RBM3P98179 157 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ATXN8Q156A1 80 aa11.5□□□□□ -0.57
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 Q75L30 129 aa11.5□□□□□ -0.57
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SIGMAR1Q99720 223 aa11.5□□□□□ -0.57
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 DSCR8Q96T75 97 aa11.49□□□□□ -0.57
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa11.46□□□□□ -0.57
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa11.46□□□□□ -0.57
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 VPS25Q9BRG1 176 aa11.46□□□□□ -0.57
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 LYRM7Q5U5X0 104 aa11.45□□□□□ -0.58
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 IGKV4-1P06312 121 aa11.44□□□□□ -0.58
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 BATFQ16520 125 aa11.44□□□□□ -0.58
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 C9JAW5 83 aa11.42□□□□□ -0.58
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 DSCR10P59022 87 aa11.4□□□□□ -0.58
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa11.4□□□□□ -0.58
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 LCE2CQ5TA81 110 aa11.4□□□□□ -0.58
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa11.4□□□□□ -0.58
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 LINC00472Q9H8W2 130 aa11.4□□□□□ -0.58
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa11.39□□□□□ -0.59
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa11.37□□□□□ -0.59
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 A8MUU9 505 aa11.37□□□□□ -0.59
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa11.37□□□□□ -0.59
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 DEFB116Q30KQ4 102 aa11.37□□□□□ -0.59
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 LINC00313P59037 77 aa11.36□□□□□ -0.59
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa11.3□□□□□ -0.6
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 PDE6GP18545 87 aa11.3□□□□□ -0.6
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 COX6B2Q6YFQ2 88 aa11.3□□□□□ -0.6
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa11.29□□□□□ -0.6
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 C9orf118A6NHY6 69 aa11.29□□□□□ -0.6
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 Q6ZQT0 140 aa11.29□□□□□ -0.6
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 A0A1B0GW54 56 aa11.27□□□□□ -0.61
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 J3KT08 172 aa11.27□□□□□ -0.61
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 MT1HP80294 61 aa11.27□□□□□ -0.61
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms