RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384546.1

RNU6-1160P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1160, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1160P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1160P-201ENST00000384546 MUSTN1Q8IVN3 82 aa-5.99□□□□□ -3.37
RNU6-1160P-201ENST00000384546 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP-5.99□□□□□ -3.37
RNU6-1160P-201ENST00000384546 IFI6P09912 130 aa-6□□□□□ -3.37
RNU6-1160P-201ENST00000384546 ATP7BP35670 1465 aa-6.01□□□□□ -3.37
RNU6-1160P-201ENST00000384546 RGPD1P0DJD0 1748 aa-6.01□□□□□ -3.37
RNU6-1160P-201ENST00000384546 ALKAL2Q6UX46 152 aa-6.01□□□□□ -3.37
RNU6-1160P-201ENST00000384546 WFDC9Q8NEX5 89 aa-6.01□□□□□ -3.37
RNU6-1160P-201ENST00000384546 GAFA1Q96PS6 74 aa-6.01□□□□□ -3.37
RNU6-1160P-201ENST00000384546 H3BQ15 152 aa-6.02□□□□□ -3.37
RNU6-1160P-201ENST00000384546 UQCRHP07919 91 aa-6.02□□□□□ -3.37
RNU6-1160P-201ENST00000384546 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa-6.03□□□□□ -3.37
RNU6-1160P-201ENST00000384546 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa-6.03□□□□□ -3.37
RNU6-1160P-201ENST00000384546 MLH3Q9UHC1 1453 aa-6.03□□□□□ -3.38
RNU6-1160P-201ENST00000384546 LEPROTL1O95214 131 aa-6.04□□□□□ -3.38
RNU6-1160P-201ENST00000384546 TRGV9Q99603 122 aa-6.04□□□□□ -3.38
RNU6-1160P-201ENST00000384546 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP-6.05□□□□□ -3.38
RNU6-1160P-201ENST00000384546 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP-6.06□□□□□ -3.38
RNU6-1160P-201ENST00000384546 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa-6.07□□□□□ -3.38
RNU6-1160P-201ENST00000384546 HMGN3Q15651 99 aa-6.07□□□□□ -3.38
RNU6-1160P-201ENST00000384546 SVBPQ8N300 66 aa-6.07□□□□□ -3.38
RNU6-1160P-201ENST00000384546 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa-6.08□□□□□ -3.38
RNU6-1160P-201ENST00000384546 NWD1Q149M9 1564 aa-6.08□□□□□ -3.38
RNU6-1160P-201ENST00000384546 NDUFC1O43677 76 aa-6.08□□□□□ -3.38
RNU6-1160P-201ENST00000384546 NRXN1Q9ULB1 1477 aa-6.09□□□□□ -3.38
RNU6-1160P-201ENST00000384546 MPC2O95563 127 aa-6.09□□□□□ -3.38
RNU6-1160P-201ENST00000384546 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa-6.09□□□□□ -3.38
RNU6-1160P-201ENST00000384546 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa-6.09□□□□□ -3.38
RNU6-1160P-201ENST00000384546 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa-6.1□□□□□ -3.39
RNU6-1160P-201ENST00000384546 ABCA3Q99758 1704 aa-6.11□□□□□ -3.39
RNU6-1160P-201ENST00000384546 SNAPC5O75971 98 aa-6.12□□□□□ -3.39
RNU6-1160P-201ENST00000384546 MYOM2P54296 1465 aa-6.12□□□□□ -3.39
RNU6-1160P-201ENST00000384546 FYCO1Q9BQS8 1478 aa-6.13□□□□□ -3.39
RNU6-1160P-201ENST00000384546 IQCF6A8MYZ5 107 aa-6.13□□□□□ -3.39
RNU6-1160P-201ENST00000384546 ETDBQ3ZM63 59 aa-6.13□□□□□ -3.39
RNU6-1160P-201ENST00000384546 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP-6.13□□□□□ -3.39
RNU6-1160P-201ENST00000384546 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP-6.13□□□□□ -3.39
RNU6-1160P-201ENST00000384546 TEX14Q8IWB6 1497 aa-6.14□□□□□ -3.39
RNU6-1160P-201ENST00000384546 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa-6.16□□□□□ -3.4
RNU6-1160P-201ENST00000384546 NRKQ7Z2Y5 1582 aa-6.18□□□□□ -3.4
RNU6-1160P-201ENST00000384546 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP-6.18□□□□□ -3.4
RNU6-1160P-201ENST00000384546 DOT1LQ8TEK3 1739 aa-6.21□□□□□ -3.4
RNU6-1160P-201ENST00000384546 LCE6AA0A183 80 aa-6.21□□□□□ -3.4
RNU6-1160P-201ENST00000384546 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa-6.22□□□□□ -3.4
RNU6-1160P-201ENST00000384546 A0A1B0GUT8 65 aa-6.22□□□□□ -3.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 LTN1O94822 1766 aa-6.22□□□□□ -3.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 ZFHX4Q86UP3 3567 aa-6.22□□□□□ -3.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 LY75O60449 1722 aa-6.22□□□□□ -3.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 ZNF720Q7Z2F6 126 aa-6.23□□□□□ -3.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 DEFB4AO15263 64 aa-6.24□□□□□ -3.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP-6.28□□□□□ -3.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 TRAV21A0A0B4J279 112 aa-6.28□□□□□ -3.41
RNU6-1160P-201ENST00000384546 GNGT2O14610 69 aa-6.29□□□□□ -3.42
RNU6-1160P-201ENST00000384546 CFAP54Q96N23 3096 aa-6.29□□□□□ -3.42
RNU6-1160P-201ENST00000384546 WT1-ASQ06250 92 aa-6.3□□□□□ -3.42
RNU6-1160P-201ENST00000384546 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP-6.31□□□□□ -3.42
RNU6-1160P-201ENST00000384546 PPP3R1P63098 170 aa-6.33□□□□□ -3.42
RNU6-1160P-201ENST00000384546 LINC01546A6NGU7 62 aa-6.34□□□□□ -3.42
RNU6-1160P-201ENST00000384546 NDUFA2O43678 99 aa-6.34□□□□□ -3.42
RNU6-1160P-201ENST00000384546 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP-6.34□□□□□ -3.42
RNU6-1160P-201ENST00000384546 NALCNQ8IZF0 1738 aa-6.34□□□□□ -3.42
RNU6-1160P-201ENST00000384546 MAST1Q9Y2H9 1570 aa-6.35□□□□□ -3.43
RNU6-1160P-201ENST00000384546 PLIN4Q96Q06 1357 aa-6.35□□□□□ -3.43
RNU6-1160P-201ENST00000384546 PLGLAQ15195 96 aa-6.36□□□□□ -3.43
RNU6-1160P-201ENST00000384546 ITSN2Q9NZM3 1697 aa-6.36□□□□□ -3.43
RNU6-1160P-201ENST00000384546 GNG4P50150 75 aa-6.37□□□□□ -3.43
RNU6-1160P-201ENST00000384546 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP-6.38□□□□□ -3.43
RNU6-1160P-201ENST00000384546 ACYP1P07311 99 aa-6.38□□□□□ -3.43
RNU6-1160P-201ENST00000384546 CYB5AP00167 134 aa-6.4□□□□□ -3.43
RNU6-1160P-201ENST00000384546 CCDC58Q4VC31 144 aa-6.4□□□□□ -3.43
RNU6-1160P-201ENST00000384546 PMCHL2Q9BQD1 86 aa-6.41□□□□□ -3.44
RNU6-1160P-201ENST00000384546 PZPP20742 1482 aa-6.41□□□□□ -3.44
RNU6-1160P-201ENST00000384546 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP-6.42□□□□□ -3.44
RNU6-1160P-201ENST00000384546 ATOX1O00244 68 aa-6.43□□□□□ -3.44
RNU6-1160P-201ENST00000384546 MYO15AQ9UKN7 3530 aa-6.46□□□□□ -3.44
RNU6-1160P-201ENST00000384546 UQCRHLA0A096LP55 91 aa-6.46□□□□□ -3.44
RNU6-1160P-201ENST00000384546 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa-6.46□□□□□ -3.44
RNU6-1160P-201ENST00000384546 ITSN1Q15811 1721 aa-6.46□□□□□ -3.44
RNU6-1160P-201ENST00000384546 KIF1AQ12756 1690 aa-6.47□□□□□ -3.45
RNU6-1160P-201ENST00000384546 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP-6.48□□□□□ -3.45
RNU6-1160P-201ENST00000384546 SMARCA2P51531 1590 aa-6.51□□□□□ -3.45
RNU6-1160P-201ENST00000384546 DIP2BQ9P265 1576 aa-6.52□□□□□ -3.45
RNU6-1160P-201ENST00000384546 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa-6.52□□□□□ -3.45
RNU6-1160P-201ENST00000384546 CORTO00230 105 aa-6.53□□□□□ -3.45
RNU6-1160P-201ENST00000384546 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP-6.54□□□□□ -3.46
RNU6-1160P-201ENST00000384546 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP-6.55□□□□□ -3.46
RNU6-1160P-201ENST00000384546 S100A1P23297 94 aa-6.55□□□□□ -3.46
RNU6-1160P-201ENST00000384546 RPS27P42677 84 aaKnown RBP-6.55□□□□□ -3.46
RNU6-1160P-201ENST00000384546 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa-6.55□□□□□ -3.46
RNU6-1160P-201ENST00000384546 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP-6.55□□□□□ -3.46
RNU6-1160P-201ENST00000384546 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa-6.56□□□□□ -3.46
RNU6-1160P-201ENST00000384546 TSC22D3Q99576 134 aa-6.56□□□□□ -3.46
RNU6-1160P-201ENST00000384546 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa-6.57□□□□□ -3.46
RNU6-1160P-201ENST00000384546 CCNB3Q8WWL7 1395 aa-6.57□□□□□ -3.46
RNU6-1160P-201ENST00000384546 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa-6.58□□□□□ -3.46
RNU6-1160P-201ENST00000384546 S100PP25815 95 aa-6.58□□□□□ -3.46
RNU6-1160P-201ENST00000384546 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP-6.59□□□□□ -3.46
RNU6-1160P-201ENST00000384546 VPS13CQ709C8 3753 aa-6.59□□□□□ -3.46
RNU6-1160P-201ENST00000384546 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP-6.59□□□□□ -3.46
RNU6-1160P-201ENST00000384546 NDUFB1O75438 58 aa-6.59□□□□□ -3.46
RNU6-1160P-201ENST00000384546 MT-ATP8P03928 68 aa-6.59□□□□□ -3.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.9 ms