RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368213.9

PTPRK-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRK, Length 5,816 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-205ENST00000368213 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRK-205ENST00000368213 ERC2-IT1O76042 136 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRK-205ENST00000368213 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRK-205ENST00000368213 Q5VSD8 79 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRK-205ENST00000368213 M0R2T5 61 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRK-205ENST00000368213 PSPHP1O15172 72 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRK-205ENST00000368213 NBEAQ8NFP9 2946 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRK-205ENST00000368213 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRK-205ENST00000368213 TACC2O95359 2948 aa6.8□□□□□ -1.32
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PTPRK-205ENST00000368213 UNC79Q9P2D8 2635 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRK-205ENST00000368213 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
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PTPRK-205ENST00000368213 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRK-205ENST00000368213 COL6A5A8TX70 2615 aa6.78□□□□□ -1.32
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PTPRK-205ENST00000368213 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa6.75□□□□□ -1.33
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PTPRK-205ENST00000368213 LOC400499M0QZD8 3231 aa6.74□□□□□ -1.33
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PTPRK-205ENST00000368213 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
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PTPRK-205ENST00000368213 NOTCH1P46531 2555 aa6.72□□□□□ -1.33
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PTPRK-205ENST00000368213 CRIPTQ9P021 101 aa6.63□□□□□ -1.35
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PTPRK-205ENST00000368213 Q6ZR54 194 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-205ENST00000368213 OXTP01178 125 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-205ENST00000368213 A0A0A0MQY5 61 aa6.58□□□□□ -1.36
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PTPRK-205ENST00000368213 CSAG1Q6PB30 78 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-205ENST00000368213 H3BS24 57 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-205ENST00000368213 Q8NDZ9 215 aa6.47□□□□□ -1.37
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PTPRK-205ENST00000368213 PANO1I0J062 215 aa6.46□□□□□ -1.38
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PTPRK-205ENST00000368213 APCP25054 2843 aa6.44□□□□□ -1.38
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PTPRK-205ENST00000368213 RELNP78509 3460 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRK-205ENST00000368213 NF1P21359 2839 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRK-205ENST00000368213 CELSR2Q9HCU4 2923 aa6.41□□□□□ -1.38
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PTPRK-205ENST00000368213 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP6.4□□□□□ -1.38
PTPRK-205ENST00000368213 HRES1P13985 223 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRK-205ENST00000368213 KLKP1Q107X0 134 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRK-205ENST00000368213 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.39□□□□□ -1.39
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PTPRK-205ENST00000368213 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRK-205ENST00000368213 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
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PTPRK-205ENST00000368213 A0A087X002 238 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-205ENST00000368213 DCHS2Q6V1P9 2916 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-205ENST00000368213 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRK-205ENST00000368213 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRK-205ENST00000368213 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRK-205ENST00000368213 Q5W150 140 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-205ENST00000368213 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
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