RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292535.11

CUX1-201, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CUX1, Length 13,747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-201ENST00000292535 LINC00483Q53H64 154 aa6.14□□□□□ -1.43
CUX1-201ENST00000292535 A0A087WTM6 91 aa6.14□□□□□ -1.43
CUX1-201ENST00000292535 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6.13□□□□□ -1.43
CUX1-201ENST00000292535 KLKP1Q107X0 134 aa6.12□□□□□ -1.43
CUX1-201ENST00000292535 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.11□□□□□ -1.43
CUX1-201ENST00000292535 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
CUX1-201ENST00000292535 Q6ZSA8 131 aa6.11□□□□□ -1.43
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CUX1-201ENST00000292535 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa5.77□□□□□ -1.49
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CUX1-201ENST00000292535 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.77□□□□□ -1.49
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CUX1-201ENST00000292535 RPL37P61927 97 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
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CUX1-201ENST00000292535 ROMO1P60602 79 aa5.69□□□□□ -1.5
CUX1-201ENST00000292535 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
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CUX1-201ENST00000292535 TENM2Q9NT68 2774 aa5.67□□□□□ -1.5
CUX1-201ENST00000292535 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa5.67□□□□□ -1.5
CUX1-201ENST00000292535 OXTP01178 125 aa5.66□□□□□ -1.5
CUX1-201ENST00000292535 M0QZ58 72 aa5.66□□□□□ -1.5
CUX1-201ENST00000292535 COL7A1Q02388 2944 aa5.66□□□□□ -1.5
CUX1-201ENST00000292535 LINC00472Q9H8W2 130 aa5.65□□□□□ -1.5
CUX1-201ENST00000292535 UTRNP46939 3433 aa5.65□□□□□ -1.5
CUX1-201ENST00000292535 Q5VV11 94 aa5.65□□□□□ -1.5
CUX1-201ENST00000292535 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa5.63□□□□□ -1.51
CUX1-201ENST00000292535 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa5.63□□□□□ -1.51
CUX1-201ENST00000292535 SPRR1BP22528 89 aa5.62□□□□□ -1.51
CUX1-201ENST00000292535 LCE6AA0A183 80 aa5.62□□□□□ -1.51
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