RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 ERC2-IT1O76042 136 aa11.75□□□□□ -0.53
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HOXD11-201ENST00000249504 J3QR89 54 aa11.73□□□□□ -0.53
HOXD11-201ENST00000249504 K7ERU9 68 aa11.72□□□□□ -0.53
HOXD11-201ENST00000249504 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa11.71□□□□□ -0.53
HOXD11-201ENST00000249504 FAT3Q8TDW7 4589 aa11.7□□□□□ -0.54
HOXD11-201ENST00000249504 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
HOXD11-201ENST00000249504 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa11.7□□□□□ -0.54
HOXD11-201ENST00000249504 J3QL48 77 aa11.7□□□□□ -0.54
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HOXD11-201ENST00000249504 A0A087X002 238 aa11.52□□□□□ -0.57
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HOXD11-201ENST00000249504 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa11.5□□□□□ -0.57
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HOXD11-201ENST00000249504 C3orf22Q8N5N4 141 aa11.5□□□□□ -0.57
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HOXD11-201ENST00000249504 TYMSOSQ8TAI1 123 aa11.47□□□□□ -0.57
HOXD11-201ENST00000249504 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa11.45□□□□□ -0.58
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HOXD11-201ENST00000249504 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa11.44□□□□□ -0.58
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HOXD11-201ENST00000249504 CDIP1Q9H305 208 aa11.39□□□□□ -0.59
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HOXD11-201ENST00000249504 HERC1Q15751 4861 aa11.36□□□□□ -0.59
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HOXD11-201ENST00000249504 A0A1W2PNM2 257 aa11.3□□□□□ -0.6
HOXD11-201ENST00000249504 LINC00643Q86TS7 51 aa11.3□□□□□ -0.6
HOXD11-201ENST00000249504 A0A0G2JQZ4 141 aa11.29□□□□□ -0.6
HOXD11-201ENST00000249504 C4orf48Q5BLP8 95 aa11.28□□□□□ -0.6
HOXD11-201ENST00000249504 SIGMAR1Q99720 223 aa11.28□□□□□ -0.6
HOXD11-201ENST00000249504 Q6Q795 121 aa11.27□□□□□ -0.61
HOXD11-201ENST00000249504 SPAG11AQ6PDA7 123 aa11.25□□□□□ -0.61
HOXD11-201ENST00000249504 CD164Q04900 197 aa11.24□□□□□ -0.61
HOXD11-201ENST00000249504 Q6ZVQ6 151 aa11.22□□□□□ -0.61
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HOXD11-201ENST00000249504 SPINK1P00995 79 aa11.2□□□□□ -0.62
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HOXD11-201ENST00000249504 NREPQ16612 68 aa11.2□□□□□ -0.62
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HOXD11-201ENST00000249504 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa11.12□□□□□ -0.63
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HOXD11-201ENST00000249504 SS18L2Q9UHA2 77 aa11.12□□□□□ -0.63
HOXD11-201ENST00000249504 PRR4Q16378 134 aa11.1□□□□□ -0.63
HOXD11-201ENST00000249504 Q5XG85 94 aa11.1□□□□□ -0.63
HOXD11-201ENST00000249504 LIMD2Q9BT23 127 aa11.1□□□□□ -0.63
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HOXD11-201ENST00000249504 HMCN2Q8NDA2 5059 aa11.08□□□□□ -0.64
HOXD11-201ENST00000249504 BPY2O14599 106 aa11.08□□□□□ -0.64
HOXD11-201ENST00000249504 SCGB1A1P11684 91 aa11.03□□□□□ -0.64
HOXD11-201ENST00000249504 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa11.03□□□□□ -0.64
HOXD11-201ENST00000249504 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
HOXD11-201ENST00000249504 LINC00472Q9H8W2 130 aa11□□□□□ -0.65
HOXD11-201ENST00000249504 J3KT08 172 aa10.99□□□□□ -0.65
HOXD11-201ENST00000249504 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
HOXD11-201ENST00000249504 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa10.97□□□□□ -0.65
HOXD11-201ENST00000249504 C1orf195Q5TG92 126 aa10.97□□□□□ -0.65
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