RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636483.1

SPTAN1-232, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-232ENST00000636483 A0A1B0GUT8 65 aa-0.34□□□□□ -2.46
SPTAN1-232ENST00000636483 IQCF6A8MYZ5 107 aa-0.34□□□□□ -2.46
SPTAN1-232ENST00000636483 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa-0.34□□□□□ -2.46
SPTAN1-232ENST00000636483 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP-0.34□□□□□ -2.46
SPTAN1-232ENST00000636483 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa-0.34□□□□□ -2.46
SPTAN1-232ENST00000636483 ABCC3O15438 1527 aa-0.34□□□□□ -2.46
SPTAN1-232ENST00000636483 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa-0.34□□□□□ -2.46
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SPTAN1-232ENST00000636483 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa-0.35□□□□□ -2.47
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SPTAN1-232ENST00000636483 NDUFB1O75438 58 aa-0.48□□□□□ -2.49
SPTAN1-232ENST00000636483 PRO3102Q9H379 93 aa-0.48□□□□□ -2.49
SPTAN1-232ENST00000636483 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP-0.48□□□□□ -2.49
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