RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 C16orf92Q96LL3 132 aa7.69□□□□□ -1.18
HCG18-241ENST00000602290 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa7.68□□□□□ -1.18
HCG18-241ENST00000602290 KLLNB2CW77 178 aa7.68□□□□□ -1.18
HCG18-241ENST00000602290 CCKP06307 115 aa7.68□□□□□ -1.18
HCG18-241ENST00000602290 LINC00846Q9NV44 126 aa7.68□□□□□ -1.18
HCG18-241ENST00000602290 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa7.67□□□□□ -1.18
HCG18-241ENST00000602290 A8MTW9 85 aa7.67□□□□□ -1.18
HCG18-241ENST00000602290 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa7.67□□□□□ -1.18
HCG18-241ENST00000602290 Q6ZRU5 148 aa7.67□□□□□ -1.18
HCG18-241ENST00000602290 LINC00612Q8N6U2 182 aa7.67□□□□□ -1.18
HCG18-241ENST00000602290 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa7.67□□□□□ -1.18
HCG18-241ENST00000602290 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
HCG18-241ENST00000602290 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa7.66□□□□□ -1.18
HCG18-241ENST00000602290 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa7.65□□□□□ -1.18
HCG18-241ENST00000602290 F5H697 171 aa7.65□□□□□ -1.18
HCG18-241ENST00000602290 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
HCG18-241ENST00000602290 LINC00467Q9BRT7 94 aa7.65□□□□□ -1.18
HCG18-241ENST00000602290 GNRH2O43555 120 aa7.64□□□□□ -1.19
HCG18-241ENST00000602290 ERC2-IT1O76042 136 aa7.64□□□□□ -1.19
HCG18-241ENST00000602290 FAM104AQ969W3 186 aa7.64□□□□□ -1.19
HCG18-241ENST00000602290 PKIGQ9Y2B9 76 aa7.64□□□□□ -1.19
HCG18-241ENST00000602290 C20orf197Q8N268 126 aa7.63□□□□□ -1.19
HCG18-241ENST00000602290 FAM218AQ96MZ4 157 aa7.63□□□□□ -1.19
HCG18-241ENST00000602290 LINC00167Q96N53 147 aa7.63□□□□□ -1.19
HCG18-241ENST00000602290 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
HCG18-241ENST00000602290 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa7.62□□□□□ -1.19
HCG18-241ENST00000602290 A0A087WVE0 104 aa7.61□□□□□ -1.19
HCG18-241ENST00000602290 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa7.61□□□□□ -1.19
HCG18-241ENST00000602290 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa7.61□□□□□ -1.19
HCG18-241ENST00000602290 F6UB75 175 aa7.61□□□□□ -1.19
HCG18-241ENST00000602290 CRPP02741 224 aa7.61□□□□□ -1.19
HCG18-241ENST00000602290 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa7.6□□□□□ -1.19
HCG18-241ENST00000602290 INSP01308 110 aa7.6□□□□□ -1.19
HCG18-241ENST00000602290 PRR15Q8IV56 129 aa7.6□□□□□ -1.19
HCG18-241ENST00000602290 UBL5Q9BZL1 73 aa7.6□□□□□ -1.19
HCG18-241ENST00000602290 C14orf132Q9NPU4 83 aa7.6□□□□□ -1.19
HCG18-241ENST00000602290 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.59□□□□□ -1.19
HCG18-241ENST00000602290 C16orf74Q96GX8 76 aa7.59□□□□□ -1.19
HCG18-241ENST00000602290 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
HCG18-241ENST00000602290 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
HCG18-241ENST00000602290 A0A087WWL8 130 aa7.58□□□□□ -1.2
HCG18-241ENST00000602290 H3BQ85 93 aa7.58□□□□□ -1.2
HCG18-241ENST00000602290 PSCAO43653 123 aa7.58□□□□□ -1.2
HCG18-241ENST00000602290 WFDC10BQ8IUB3 73 aa7.58□□□□□ -1.2
HCG18-241ENST00000602290 ORMDL1Q9P0S3 153 aa7.58□□□□□ -1.2
HCG18-241ENST00000602290 CHCHD7Q9BUK0 85 aa7.57□□□□□ -1.2
HCG18-241ENST00000602290 SPINK13Q1W4C9 94 aa7.56□□□□□ -1.2
HCG18-241ENST00000602290 BRK1Q8WUW1 75 aa7.56□□□□□ -1.2
HCG18-241ENST00000602290 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa7.55□□□□□ -1.2
HCG18-241ENST00000602290 CXCL6P80162 114 aa7.55□□□□□ -1.2
HCG18-241ENST00000602290 RBM3P98179 157 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
HCG18-241ENST00000602290 CD164Q04900 197 aa7.55□□□□□ -1.2
HCG18-241ENST00000602290 PMAIP1Q13794 54 aa7.55□□□□□ -1.2
HCG18-241ENST00000602290 Q9HAA7 133 aa7.55□□□□□ -1.2
HCG18-241ENST00000602290 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa7.55□□□□□ -1.2
HCG18-241ENST00000602290 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa7.54□□□□□ -1.2
HCG18-241ENST00000602290 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa7.54□□□□□ -1.2
HCG18-241ENST00000602290 PDE6GP18545 87 aa7.54□□□□□ -1.2
HCG18-241ENST00000602290 F8WEM9 126 aa7.53□□□□□ -1.2
HCG18-241ENST00000602290 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa7.53□□□□□ -1.2
HCG18-241ENST00000602290 SMIM11BQ8TCY0 68 aa7.53□□□□□ -1.2
HCG18-241ENST00000602290 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa7.52□□□□□ -1.21
HCG18-241ENST00000602290 SMIM1B2RUZ4 78 aa7.52□□□□□ -1.21
HCG18-241ENST00000602290 FAM74A4Q5TZK3 123 aa7.52□□□□□ -1.21
HCG18-241ENST00000602290 ENHOQ6UWT2 76 aa7.52□□□□□ -1.21
HCG18-241ENST00000602290 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
HCG18-241ENST00000602290 A0A087WYN8 130 aa7.51□□□□□ -1.21
HCG18-241ENST00000602290 SS18Q15532 418 aa7.51□□□□□ -1.21
HCG18-241ENST00000602290 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.51□□□□□ -1.21
HCG18-241ENST00000602290 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
HCG18-241ENST00000602290 LINC00242Q5T6M2 205 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-241ENST00000602290 LINC00337Q8N6G1 96 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-241ENST00000602290 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.5□□□□□ -1.21
HCG18-241ENST00000602290 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-241ENST00000602290 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-241ENST00000602290 NCR3O14931 201 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-241ENST00000602290 LECT2O14960 151 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-241ENST00000602290 IGKV2D-28P01615 120 aa7.49□□□□□ -1.21
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP10-8P60410 259 aa7.49□□□□□ -1.21
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HCG18-241ENST00000602290 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa7.47□□□□□ -1.21
HCG18-241ENST00000602290 HTN1P15515 57 aa7.47□□□□□ -1.21
HCG18-241ENST00000602290 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa7.47□□□□□ -1.21
HCG18-241ENST00000602290 IGHV3-53P01767 116 aa7.46□□□□□ -1.22
HCG18-241ENST00000602290 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
HCG18-241ENST00000602290 Q1T7F1 81 aa7.46□□□□□ -1.22
HCG18-241ENST00000602290 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
HCG18-241ENST00000602290 RMI2Q96E14 147 aa7.46□□□□□ -1.22
HCG18-241ENST00000602290 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa7.45□□□□□ -1.22
HCG18-241ENST00000602290 PAX4O43316 350 aa7.45□□□□□ -1.22
HCG18-241ENST00000602290 LINC01556Q5JQF7 62 aa7.45□□□□□ -1.22
HCG18-241ENST00000602290 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.45□□□□□ -1.22
HCG18-241ENST00000602290 PANO1I0J062 215 aa7.44□□□□□ -1.22
HCG18-241ENST00000602290 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
HCG18-241ENST00000602290 COX6A2Q02221 97 aa7.44□□□□□ -1.22
HCG18-241ENST00000602290 Q6ZQT0 140 aa7.44□□□□□ -1.22
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.44□□□□□ -1.22
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.44□□□□□ -1.22
HCG18-241ENST00000602290 K7EQD1 137 aa7.43□□□□□ -1.22
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