RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578025.5

TSPOAP1-AS1-201, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,229 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 COX7BP24311 80 aa15.77■□□□□ 0.12
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa15.54■□□□□ 0.08
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NKAPP1Q8N9T2 125 aa15.52■□□□□ 0.08
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 STARD9Q9P2P6 4700 aa15.46■□□□□ 0.07
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa15.39■□□□□ 0.05
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa15.36■□□□□ 0.05
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa15.33■□□□□ 0.05
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa15.33■□□□□ 0.05
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa15.32■□□□□ 0.04
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 F8WEM9 126 aa15.31■□□□□ 0.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C5orf47Q569G3 176 aa15.3■□□□□ 0.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SERP1Q9Y6X1 66 aa15.29■□□□□ 0.04
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LRCOL1A6NCL2 159 aa15.29■□□□□ 0.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C16orf90A8MZG2 172 aa15.29■□□□□ 0.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TNP2Q05952 138 aa15.29■□□□□ 0.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 A0A1W2PNM2 257 aa15.27■□□□□ 0.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C4orf26Q17RF5 130 aa15.27■□□□□ 0.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ERC2-IT1O76042 136 aa15.27■□□□□ 0.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 OCR1Q9BZK8 76 aa15.26■□□□□ 0.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NDUFC1O43677 76 aa15.25■□□□□ 0.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa15.25■□□□□ 0.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa15.25■□□□□ 0.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TMEM254Q8TBM7 123 aa15.24■□□□□ 0.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 A0A1B0GW54 56 aa15.23■□□□□ 0.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 A0A1W2PNN7 141 aa15.23■□□□□ 0.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP15.23■□□□□ 0.03
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