RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499624.3

GABPB1-AS1-202, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GABPB1-AS1, Length 16,182 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 A0A087X002 238 aa3.06□□□□□ -1.92
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa3.06□□□□□ -1.92
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GDF5OSQ5U4N7 250 aa3.06□□□□□ -1.92
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 Q6ZQT0 140 aa3.06□□□□□ -1.92
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 Q6ZPA2 131 aa3.06□□□□□ -1.92
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 A0A1W2PPR1 153 aa3.06□□□□□ -1.92
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CHD9Q3L8U1 2897 aa3.06□□□□□ -1.92
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa3.06□□□□□ -1.92
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CHD7Q9P2D1 2997 aa3.06□□□□□ -1.92
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa3.06□□□□□ -1.92
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LINC00315P59091 139 aa3.05□□□□□ -1.92
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 EPM2AB3EWF7 344 aa3.05□□□□□ -1.92
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PRO0628Q9UI54 55 aa3.05□□□□□ -1.92
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DEFB4AO15263 64 aa3.05□□□□□ -1.92
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MT-ATP8P03928 68 aa3.05□□□□□ -1.92
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 COX6A2Q02221 97 aa3.05□□□□□ -1.92
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 APCP25054 2843 aa3.04□□□□□ -1.92
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 A0A087WSZ3 146 aa3.04□□□□□ -1.92
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa3.04□□□□□ -1.92
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ITPR1Q14643 2758 aa3.04□□□□□ -1.92
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 COX6B2Q6YFQ2 88 aa3.04□□□□□ -1.92
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZNF575Q86XF7 245 aa3.04□□□□□ -1.92
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NBEAQ8NFP9 2946 aa3.04□□□□□ -1.92
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 C18orf65Q6ZTR6 163 aa3.04□□□□□ -1.92
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CDIP1Q9H305 208 aa3.04□□□□□ -1.92
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RETNQ9HD89 108 aa3.04□□□□□ -1.92
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PRM2P04554 102 aa3.03□□□□□ -1.92
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 Q5XG85 94 aa3.03□□□□□ -1.92
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PMAIP1Q13794 54 aa3.03□□□□□ -1.92
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 C10orf99Q6UWK7 81 aa3.03□□□□□ -1.92
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LINC00476Q8WZB0 136 aa3.03□□□□□ -1.92
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SPRR4Q96PI1 79 aa3.03□□□□□ -1.92
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LRCOL1A6NCL2 159 aa3.03□□□□□ -1.92
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 K7ERJ3 54 aa3.03□□□□□ -1.92
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 A0A1B0GVX0 72 aa3.03□□□□□ -1.93
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa3.03□□□□□ -1.93
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LINC00167Q96N53 147 aa3.02□□□□□ -1.93
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LINC00588Q9Y4M8 146 aa3.02□□□□□ -1.93
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa3.02□□□□□ -1.93
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 C1orf64Q8NEQ6 169 aa3.02□□□□□ -1.93
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP3.02□□□□□ -1.935e-8■□□□□ 8.6
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa3.02□□□□□ -1.93
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SNURFQ9Y675 71 aa3.02□□□□□ -1.93
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CDH23Q9H251 3354 aa3.01□□□□□ -1.93
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa3.01□□□□□ -1.93
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LINC00694P0DN24 101 aa3.01□□□□□ -1.93
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 H7BZZ5 65 aa3.01□□□□□ -1.93
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MGAQ8IWI9 3026 aa3.01□□□□□ -1.93
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 A0A087WTM6 91 aa3.01□□□□□ -1.93
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LUZP6Q538Z0 58 aa3□□□□□ -1.93
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CRIPTQ9P021 101 aa3□□□□□ -1.93
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa3□□□□□ -1.93
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SZT2Q5T011 3432 aa3□□□□□ -1.93
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 A0A096LNT2 108 aa3□□□□□ -1.93
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 Q6ZSA8 131 aa3□□□□□ -1.93
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa3□□□□□ -1.93
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 IGLV7-43P04211 117 aa2.99□□□□□ -1.93
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CEP350Q5VT06 3117 aa2.99□□□□□ -1.93
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DEFB1P60022 68 aa2.98□□□□□ -1.93
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 WFDC2Q14508 124 aa2.98□□□□□ -1.93
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NF1P21359 2839 aa2.98□□□□□ -1.93
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa2.98□□□□□ -1.93
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 C11orf21Q9P2W6 132 aa2.97□□□□□ -1.93
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 APLNQ9ULZ1 77 aa2.97□□□□□ -1.93
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MYO15AQ9UKN7 3530 aa2.97□□□□□ -1.93
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SPRR1BP22528 89 aa2.97□□□□□ -1.93
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 A0A087WYN8 130 aa2.97□□□□□ -1.93
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa2.96□□□□□ -1.93
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MUC3AQ02505 3323 aa2.96□□□□□ -1.93
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PRR9Q5T870 116 aa2.96□□□□□ -1.94
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PLAC8Q9NZF1 115 aa2.96□□□□□ -1.94
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SMIM29Q86T20 159 aa2.96□□□□□ -1.94
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SCXQ7RTU7 201 aa2.95□□□□□ -1.94
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FAM218AQ96MZ4 157 aa2.95□□□□□ -1.94
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 Q6ZS46 218 aa2.95□□□□□ -1.94
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PRLHP81277 87 aa2.95□□□□□ -1.94
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 K7EIL1 84 aa2.95□□□□□ -1.94
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DMAC1Q96GE9 116 aa2.94□□□□□ -1.94
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FRYQ5TBA9 3013 aa2.94□□□□□ -1.94
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CASC10Q5T4H9 136 aa2.94□□□□□ -1.94
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 C8orf17Q9NRJ1 99 aa2.94□□□□□ -1.94
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa2.93□□□□□ -1.94
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CSAG1Q6PB30 78 aa2.93□□□□□ -1.94
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa2.93□□□□□ -1.94
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LCE6AA0A183 80 aa2.93□□□□□ -1.94
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 IGFL1Q6UW32 110 aa2.93□□□□□ -1.94
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 A0A096LNJ9 63 aa2.93□□□□□ -1.94
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa2.93□□□□□ -1.94
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SPEGQ15772 3267 aa2.93□□□□□ -1.94
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa2.92□□□□□ -1.94
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SPRR1AP35321 89 aa2.92□□□□□ -1.94
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 Q96NJ1 140 aa2.92□□□□□ -1.94
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZZEF1O43149 2961 aa2.92□□□□□ -1.94
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MPLKIPQ8TAP9 179 aa2.92□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 108.8 ms